189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3550 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_3550  fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  100 
 
 		 316 aa  639    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1583  phosphoglycerate mutase  44.33 
 
 		 216 aa  155  8e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0229  fructose-2,6-bisphosphatase  41.35 
 
 		 223 aa  101  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1007  phosphoglycerate mutase  34.93 
 
 		 241 aa  95.1  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1553  Phosphoglycerate mutase  38.06 
 
 		 200 aa  92  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233017  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3137  alpha-ribazole phosphatase  37.88 
 
 		 197 aa  90.9  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000105722  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1544  phosphoglycerate mutase  35.1 
 
 		 256 aa  90.1  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3431  Phosphoglycerate mutase  28.44 
 
 		 201 aa  89  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2288  phosphoglycerate mutase  34.03 
 
 		 155 aa  87.4  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1466  Phosphoglycerate mutase  28.51 
 
 		 198 aa  85.1  0.000000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.570916  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1317  metal dependent phosphohydrolase  33.12 
 
 		 591 aa  81.6  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.678364  hitchhiker  0.000242648 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1817  Phosphoglycerate mutase  36.88 
 
 		 208 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1815  Phosphoglycerate mutase  33.8 
 
 		 193 aa  70.5  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.230674  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0488  fructose-2,6-bisphosphatase-like protein  27.56 
 
 		 207 aa  68.2  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0488  hypothetical protein  93.75 
 
 		 70 aa  67.8  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2815  phosphoglycerate mutase  24.77 
 
 		 202 aa  68.2  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  23.47 
 
 		 188 aa  67.4  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0469  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  28.24 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  24.89 
 
 		 196 aa  64.7  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  25.41 
 
 		 214 aa  65.1  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3895  alpha-ribazole phosphatase  30.07 
 
 		 198 aa  61.6  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0234787 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3007  phosphoglycerate mutase family protein, putative  24.35 
 
 		 217 aa  60.8  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  28.7 
 
 		 214 aa  60.5  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3084  alpha-ribazole phosphatase  26.85 
 
 		 200 aa  60.8  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.237454  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2741  phosphoglycerate mutase/fructose-2,6-bisphosphatase  29.81 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.195547  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17495  bifunctional 6-phosphofructo-2-kinase  30.28 
 
 		 540 aa  60.1  0.00000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3811  alpha-ribazole phosphatase  29.37 
 
 		 198 aa  60.1  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  33.11 
 
 		 222 aa  59.7  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  33.11 
 
 		 222 aa  59.7  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3882  phosphoglycerate mutase  27.51 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4185  phosphoglycerate mutase  26.05 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0633  Phosphoglycerate mutase  29.62 
 
 		 327 aa  58.5  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.121571 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0238  phosphoglycerate mutase  29.03 
 
 		 402 aa  58.5  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.197081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40330  predicted protein  35.16 
 
 		 506 aa  58.5  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1697  alpha-ribazole phosphatase  30.83 
 
 		 196 aa  58.5  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  25.13 
 
 		 206 aa  58.2  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1379  Phosphoglycerate mutase  31.73 
 
 		 197 aa  58.2  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3400  phosphoglycerate mutase  30.36 
 
 		 223 aa  58.5  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0769  phosphoglycerate mutase  32.77 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.578842  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  37.35 
 
 		 411 aa  56.2  0.0000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1516  phosphoglycerate mutase  28.76 
 
 		 215 aa  55.5  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.481804 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0502  phosphoglycerate mutase  32.89 
 
 		 201 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0209  phosphoglycerate mutase  32.06 
 
 		 218 aa  55.5  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0511  6-phosphofructo-2-kinase  28.3 
 
 		 410 aa  54.3  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1262  Phosphoglycerate mutase  29.13 
 
 		 204 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00931821 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0968  Phosphoglycerate mutase  25.81 
 
 		 212 aa  54.3  0.000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.667484  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0188  Phosphoglycerate mutase  28.85 
 
 		 261 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.677515  normal  0.721859 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3598  phosphoglycerate mutase  35 
 
 		 207 aa  53.9  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.593139  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0242  phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 		 261 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.273686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  32.28 
 
 		 208 aa  53.1  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1855  phosphoglycerate mutase  28.03 
 
 		 209 aa  53.1  0.000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.54332  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  24.11 
 
 		 209 aa  52.8  0.000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07200  fructose-2,6-bisphosphatase  29.63 
 
 		 383 aa  52.8  0.000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0628  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  31.93 
 
 		 197 aa  52.8  0.000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.190097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2693  phosphoglycerate mutase  29.68 
 
 		 206 aa  52.4  0.000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  30.49 
 
 		 402 aa  52.8  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3275  phosphatase PhoE  26.85 
 
 		 203 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2034  phosphatase PhoE  26.85 
 
 		 203 aa  52  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1007  Phosphoglycerate mutase  25.48 
 
 		 204 aa  52  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.628079 
 
 
-
 
NC_002950  PG1513  phosphoribosyltransferase, putative/phosphoglycerate mutase family protein  25 
 
 		 438 aa  51.6  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000537342 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3651  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  30.15 
 
 		 449 aa  51.6  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.79129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0238  phosphoglycerate mutase  27.88 
 
 		 204 aa  51.2  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.688849  normal  0.278174 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0090  phosphoglycerate mutase  31.73 
 
 		 177 aa  51.2  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0350  Phosphoglycerate mutase  29.3 
 
 		 405 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2661  alpha-ribazole phosphatase  27.11 
 
 		 192 aa  50.8  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.321223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4141  phosphoglycerate mutase  29.84 
 
 		 196 aa  50.8  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.287698 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0928  Phosphoglycerate mutase  30.97 
 
 		 201 aa  50.4  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2395  hypothetical protein  28.86 
 
 		 192 aa  50.4  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0609145 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0151  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  34.29 
 
 		 185 aa  50.4  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  27.95 
 
 		 201 aa  50.4  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4807  Phosphoglycerate mutase  30.05 
 
 		 198 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000268692  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  31.25 
 
 		 225 aa  50.4  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  27.6 
 
 		 208 aa  50.4  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  27.95 
 
 		 201 aa  50.4  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2203  alpha-ribazole phosphatase  28.32 
 
 		 192 aa  50.1  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0925085 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4252  phosphoglycerate mutase  27.95 
 
 		 245 aa  50.1  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03630  6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2, 6-bisphosphatase bifunctional enzyme, putative  28.42 
 
 		 658 aa  49.7  0.00006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  23.04 
 
 		 233 aa  49.7  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1313  phosphoglycerate mutase  36.45 
 
 		 200 aa  49.7  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.25121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1694  Phosphoglycerate mutase  28.26 
 
 		 230 aa  49.7  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.873195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  29.58 
 
 		 202 aa  49.3  0.00007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1298  Phosphoglycerate mutase  27.67 
 
 		 211 aa  49.7  0.00007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000085953  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05144  hypothetical protein similar to 6-phosphofructo-2-kinase (Eurofung)  26.8 
 
 		 700 aa  49.3  0.00008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3175  Phosphoglycerate mutase  35.66 
 
 		 184 aa  49.3  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0998177  normal  0.379648 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0171  phosphoglycerate mutase  27.88 
 
 		 205 aa  49.3  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.693324  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1859  phosphatase PhoE  26.21 
 
 		 203 aa  49.3  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.324195  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14960  fructose-2,6-bisphosphatase  32.89 
 
 		 243 aa  48.9  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.588171  normal  0.430385 
 
 
-
 
NC_002936  DET1422  phosphoglycerate mutase family protein  25 
 
 		 207 aa  48.5  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.314707  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1897  phosphatase PhoE  26.21 
 
 		 203 aa  48.9  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  28.92 
 
 		 223 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1975  Phosphoglycerate mutase  28.86 
 
 		 207 aa  48.9  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00690294  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2044  phosphatase PhoE  26 
 
 		 160 aa  48.5  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0120  phosphoglycerate mutase  37.17 
 
 		 262 aa  48.9  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5172  Phosphoglycerate mutase  28.88 
 
 		 191 aa  48.9  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.23568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2015  phosphoglycerate mutase  29.3 
 
 		 401 aa  48.9  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128037  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1185  Phosphoglycerate mutase  32.03 
 
 		 191 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3355  phosphoglycerate mutase  33.61 
 
 		 412 aa  48.5  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1381  Phosphoglycerate mutase  25 
 
 		 240 aa  48.5  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0008  phosphoglycerate mutase  27.95 
 
 		 241 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357979 
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  24.56 
 
 		 200 aa  48.1  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>