More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2192 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_2192  aspartate aminotransferase  100 
 
 
385 aa  794    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0958  aspartate aminotransferase  65.69 
 
 
381 aa  506  9.999999999999999e-143  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1584  aspartate aminotransferase  64.19 
 
 
379 aa  492  9.999999999999999e-139  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.697592  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4053  aspartate aminotransferase  59.37 
 
 
383 aa  459  9.999999999999999e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0443  aspartate aminotransferase  58.42 
 
 
384 aa  451  1.0000000000000001e-126  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1144  aspartate aminotransferase  55.76 
 
 
381 aa  445  1.0000000000000001e-124  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.859107  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0680  aspartate aminotransferase  56.53 
 
 
387 aa  421  1e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1546  aspartate aminotransferase  50.66 
 
 
398 aa  390  1e-107  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.623747  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3276  aminotransferase  42.78 
 
 
394 aa  299  5e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2043  hypothetical protein  42.55 
 
 
388 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0768  aminotransferase  41.09 
 
 
389 aa  277  3e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00291764  normal  0.0789189 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0836  hypothetical protein  39.27 
 
 
390 aa  276  6e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149421 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0881  hypothetical protein  39.42 
 
 
385 aa  270  4e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2229  aminotransferase  40.36 
 
 
394 aa  269  5e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.346154  hitchhiker  0.00140228 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1818  aminotransferase, class I and II  40.16 
 
 
378 aa  269  8e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.11769 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5438  hypothetical protein  39.63 
 
 
390 aa  268  1e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.962273  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1627  aminotransferase, class I and II  39.43 
 
 
393 aa  268  1e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.703964 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1089  hypothetical protein  40.05 
 
 
400 aa  267  2e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.806795  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0755  aspartate aminotransferase  36.02 
 
 
395 aa  267  2e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4803  hypothetical protein  39.38 
 
 
390 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0396768  hitchhiker  0.00689521 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4010  aminotransferase class I and II  38.14 
 
 
388 aa  266  4e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0894361  normal  0.978493 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2053  aminotransferase, class I/class II  41.18 
 
 
400 aa  266  5e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62480  hypothetical protein  39.79 
 
 
390 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2443  aminotransferase  41.25 
 
 
398 aa  265  1e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.693278  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1626  aminotransferase, class I and II  39.53 
 
 
383 aa  264  2e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.608674  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0739  aminotransferase class I and II  38.67 
 
 
400 aa  264  2e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.207853  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2671  aminotransferase  38.07 
 
 
397 aa  263  3e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3480  hypothetical protein  40.64 
 
 
394 aa  263  3e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.470485 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3584  hypothetical protein  38.48 
 
 
393 aa  262  6e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.510103 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0616  aminotransferase  39.43 
 
 
397 aa  261  1e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.736327  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0970  aminotransferase, classes I and II  38.44 
 
 
390 aa  261  2e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103563  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2465  aminotransferase  38.48 
 
 
394 aa  260  3e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0299601  normal  0.514082 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42630  hypothetical protein  38.44 
 
 
391 aa  260  3e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.385949  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2920  aminotransferase  38.58 
 
 
398 aa  259  5.0000000000000005e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.493105  normal  0.42279 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0815  aminotransferase  41.42 
 
 
398 aa  259  6e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0824  aminotransferase  41.42 
 
 
398 aa  259  8e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1528  aminotransferase  40.16 
 
 
397 aa  258  1e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.545419  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0664  hypothetical protein  37.37 
 
 
386 aa  257  2e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2938  aminotransferase  35.91 
 
 
396 aa  258  2e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1859  aminotransferase, class I and II  41.04 
 
 
383 aa  257  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1153  aminotransferase  36.91 
 
 
398 aa  257  2e-67  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2259  aminotransferase  38.58 
 
 
394 aa  256  3e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0236  aminotransferase, class I and II  37.57 
 
 
388 aa  256  4e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4055  aminotransferase  40.47 
 
 
414 aa  256  5e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0710  aminotransferase  38.4 
 
 
394 aa  256  6e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2696  aminotransferase  37.47 
 
 
393 aa  256  6e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.192367  normal  0.916147 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04129  hypothetical protein  39.04 
 
 
394 aa  256  7e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.926001  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0742  hypothetical protein  39.22 
 
 
390 aa  255  8e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.107858  hitchhiker  0.00000000116369 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2769  aminotransferase  38.58 
 
 
394 aa  255  1.0000000000000001e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.593168 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3512  hypothetical protein  38.08 
 
 
396 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0916  aminotransferase  40.9 
 
 
398 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.403355  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3104  aminotransferase  39.12 
 
 
398 aa  253  3e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0890  aminotransferase  38.86 
 
 
398 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2980  aminotransferase  39.79 
 
 
383 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.289509  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01041  probable aspartate aminotransferase  37.1 
 
 
410 aa  253  5.000000000000001e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0659  aminotransferase  38.38 
 
 
394 aa  252  9.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.165576 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2888  aminotransferase  38.1 
 
 
398 aa  252  9.000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.790701  normal  0.241341 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3072  aminotransferase  40.16 
 
 
397 aa  251  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3019  aminotransferase  40.16 
 
 
397 aa  251  1e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5012  hypothetical protein  38.07 
 
 
396 aa  251  2e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4771  hypothetical protein  38.07 
 
 
396 aa  251  2e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4611  hypothetical protein  38.07 
 
 
396 aa  251  2e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2148  aminotransferase  40.16 
 
 
397 aa  251  2e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0767  aminotransferase  36.96 
 
 
393 aa  251  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3104  aminotransferase  39.9 
 
 
460 aa  250  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2019  aminotransferase  40.16 
 
 
397 aa  251  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.184615  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0761  aminotransferase  40.16 
 
 
397 aa  251  2e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.590184  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5133  hypothetical protein  38.07 
 
 
396 aa  251  2e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2594  aminotransferase  40.16 
 
 
416 aa  250  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0475  aminotransferase  40.37 
 
 
398 aa  250  2e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2717  aminotransferase  36.96 
 
 
387 aa  250  2e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00629468 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0954  aminotransferase  40.37 
 
 
398 aa  250  2e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4633  hypothetical protein  38.07 
 
 
396 aa  250  3e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5033  hypothetical protein  38.07 
 
 
396 aa  249  4e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.145667  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3113  aminotransferase  39.09 
 
 
398 aa  249  5e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.274828  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5045  hypothetical protein  37.82 
 
 
396 aa  249  6e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2805  aminotransferase class I and II  37.63 
 
 
393 aa  249  7e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0703  aminotransferase  38.12 
 
 
394 aa  248  1e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4556  hypothetical protein  38.96 
 
 
390 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.331626  hitchhiker  0.00000115439 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1124  aspartate aminotransferase  35.6 
 
 
398 aa  248  1e-64  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4723  hypothetical protein  37.56 
 
 
396 aa  248  1e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1677  aminotransferase class I and II  38.67 
 
 
392 aa  248  1e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.206654  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0201  hypothetical protein  37.82 
 
 
396 aa  248  1e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.39659  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5040  hypothetical protein  37.56 
 
 
396 aa  247  2e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2719  aminotransferase  38.73 
 
 
392 aa  248  2e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1342  aspartate aminotransferase  35.6 
 
 
398 aa  247  3e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2582  aminotransferase class I and II  37.1 
 
 
393 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3728  aminotransferase class I and II  40.05 
 
 
387 aa  246  4.9999999999999997e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181067 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1601  aspartate aminotransferase  33.84 
 
 
395 aa  245  8e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1712  aspartate aminotransferase  33.84 
 
 
395 aa  245  8e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000959703  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4690  hypothetical protein  38.7 
 
 
390 aa  245  8e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000279841 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4692  hypothetical protein  38.7 
 
 
390 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000246036 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1674  aspartate aminotransferase  33.84 
 
 
395 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1454  aspartate aminotransferase  33.84 
 
 
395 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1426  aspartate aminotransferase  33.84 
 
 
395 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1427  aspartate aminotransferase  33.84 
 
 
395 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1568  aspartate aminotransferase  33.84 
 
 
395 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3018  aminotransferase class I and II  38.83 
 
 
383 aa  244  1.9999999999999999e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1639  aspartate aminotransferase  33.84 
 
 
395 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000120157 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0185  aminotransferase, class I and II  35.66 
 
 
388 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000603276  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>