56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3115 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_3115  protein of unknown function DUF81  100 
 
 
238 aa  462  1e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3101  protein of unknown function DUF81  84.91 
 
 
230 aa  391  1e-108  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3331  protein of unknown function DUF81  70.17 
 
 
241 aa  301  4.0000000000000003e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5700  hypothetical protein  62.66 
 
 
249 aa  299  2e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00346849 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4604  hypothetical protein  62.66 
 
 
249 aa  299  2e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.026301  normal  0.0214445 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0979  hypothetical protein  69.75 
 
 
241 aa  300  2e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3764  hypothetical protein  62.66 
 
 
249 aa  299  2e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.260566  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4034  hypothetical protein  61.11 
 
 
267 aa  285  5e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.232214  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1237  hypothetical protein  61.7 
 
 
267 aa  284  8e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.318719  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4042  hypothetical protein  63.36 
 
 
267 aa  284  9e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.683964 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4492  hypothetical protein  61.11 
 
 
246 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4272  protein of unknown function DUF81  52.14 
 
 
251 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2148  protein of unknown function DUF81  47.62 
 
 
243 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4525  hypothetical protein  52.36 
 
 
254 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.542262  normal  0.388849 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4663  hypothetical protein  51.93 
 
 
254 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.518692  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3822  hypothetical protein  53.21 
 
 
251 aa  206  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1292  protein of unknown function DUF81  48.64 
 
 
248 aa  206  2e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.404695  normal  0.692055 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0947  protein of unknown function DUF81  54.09 
 
 
250 aa  204  7e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0773  hypothetical protein  51.07 
 
 
258 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.771758  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4352  hypothetical protein  50 
 
 
250 aa  204  1e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.284869  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3425  hypothetical protein  46.64 
 
 
251 aa  202  3e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4754  protein of unknown function DUF81  50 
 
 
250 aa  202  3e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.180268  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4876  protein of unknown function DUF81  50 
 
 
250 aa  202  3e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.093917 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4658  hypothetical protein  51.5 
 
 
254 aa  201  6e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.218581  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0716  hypothetical protein  51.29 
 
 
254 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3543  protein of unknown function DUF81  49.36 
 
 
270 aa  195  4.0000000000000005e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0157172  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2443  hypothetical protein  48.32 
 
 
278 aa  192  6e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.97715 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03620  hypothetical protein  49.56 
 
 
250 aa  188  5e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0487694  hitchhiker  0.00000000539148 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1633  hypothetical protein  46.32 
 
 
249 aa  188  7e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2113  hypothetical protein  45.96 
 
 
251 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0970  protein of unknown function DUF81  42.5 
 
 
250 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0270305  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4361  hypothetical protein  41 
 
 
261 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0967728  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4519  hypothetical protein  41.32 
 
 
261 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.233278  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0795  hypothetical protein  49.78 
 
 
254 aa  174  9e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1386  hypothetical protein  41.18 
 
 
250 aa  171  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.187593  normal  0.103822 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6144  hypothetical protein  40.43 
 
 
244 aa  169  4e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2216  hypothetical protein  45.66 
 
 
252 aa  168  6e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.86715  normal  0.544249 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2134  hypothetical protein  45.73 
 
 
258 aa  164  1.0000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2576  hypothetical protein  44.12 
 
 
258 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.448203  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0777  hypothetical protein  40 
 
 
259 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0354  hypothetical protein  49.16 
 
 
194 aa  142  7e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2458  hypothetical protein  41.59 
 
 
256 aa  139  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.210004  normal  0.809897 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0685  hypothetical protein  45.98 
 
 
256 aa  103  3e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0205  protein of unknown function DUF81  28.99 
 
 
254 aa  69.3  0.00000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.670843 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3052  hypothetical protein  38.89 
 
 
123 aa  65.9  0.0000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0369  hypothetical protein  67.35 
 
 
61 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.660019  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2445  hypothetical protein  28.64 
 
 
255 aa  63.2  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.315917  normal  0.587426 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4638  hypothetical protein  27.88 
 
 
309 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0730129  hitchhiker  0.00519194 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1367  hypothetical protein  28.12 
 
 
282 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.113148 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1837  hypothetical protein  52.46 
 
 
83 aa  53.9  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.1929  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2841  hypothetical protein  28.95 
 
 
257 aa  51.2  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6050  protein of unknown function DUF81  25.11 
 
 
264 aa  44.3  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.31696 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4297  hypothetical protein  24.69 
 
 
245 aa  42  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.147725  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0057  hypothetical protein  24.69 
 
 
245 aa  42  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0062  hypothetical protein  24.69 
 
 
245 aa  42  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.33836  hitchhiker  0.00207124 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0061  protein of unknown function DUF81  24.69 
 
 
245 aa  41.6  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>