289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0088 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_0088  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 
290 aa  566  1e-160  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.529373  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0070  carboxylate/amino acid/amine transporter  74.83 
 
 
288 aa  402  1e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5289  regulator protein PecM  47.57 
 
 
318 aa  223  4e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.517421 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1589  hypothetical protein  47.12 
 
 
324 aa  220  2e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.151328  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4763  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.48 
 
 
314 aa  216  3e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0031  drug/metabolite transporter  45.02 
 
 
294 aa  216  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6822  normal  0.556158 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0154  drug/metabolite transporter  45.02 
 
 
294 aa  216  4e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.98831  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7502  regulator protein pecM  45.11 
 
 
307 aa  212  8e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4940  hypothetical protein  43.12 
 
 
303 aa  207  2e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.361149  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0619  hypothetical protein  45.25 
 
 
346 aa  202  4e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3501  hypothetical protein  44.84 
 
 
291 aa  202  5e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0286  hypothetical protein  40.82 
 
 
293 aa  202  6e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00960763  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3106  hypothetical protein  42.38 
 
 
299 aa  190  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0777432  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25270  predicted permease, DMT superfamily  45.78 
 
 
291 aa  187  1e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.206  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2255  hypothetical protein  41.2 
 
 
290 aa  187  2e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.116056  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0391  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.55 
 
 
287 aa  186  5e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.598398  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2560  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.82 
 
 
290 aa  185  9e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.711408  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4566  hypothetical protein  45.39 
 
 
395 aa  183  3e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.912559  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4286  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.28 
 
 
303 aa  182  5e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.853408 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4185  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.67 
 
 
291 aa  176  4e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2279  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.49 
 
 
301 aa  176  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0136903  normal  0.215844 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4210  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.73 
 
 
290 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2455  hypothetical protein  42.21 
 
 
272 aa  169  6e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.151746 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4367  hypothetical protein  36.7 
 
 
318 aa  167  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2764  hypothetical protein  44.49 
 
 
310 aa  159  8e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.876324  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0042  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.8 
 
 
302 aa  149  5e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0151  putative transmembrane protein  43.84 
 
 
309 aa  136  3e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0551496  normal  0.867935 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4244  PecM protein  33.6 
 
 
335 aa  128  1e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0960699 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4094  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.03 
 
 
317 aa  125  7e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.466006  normal  0.380638 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3677  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.6 
 
 
285 aa  113  3e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0215  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.7 
 
 
285 aa  111  1e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  1.75088e-09  normal  0.378069 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4124  hypothetical protein  33.08 
 
 
285 aa  110  3e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  6.21435e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3499  hypothetical protein  32.7 
 
 
285 aa  110  3e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.290777  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4245  hypothetical protein  32.7 
 
 
285 aa  109  6e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  1.22262e-07  hitchhiker  0.00219233 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0213  hypothetical protein  32.32 
 
 
285 aa  105  6e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  2.23398e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4527  integral membrane domain-containing protein  31.01 
 
 
284 aa  100  3e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3933  hypothetical protein  30.62 
 
 
284 aa  99  8e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  3.67698e-07  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3735  hypothetical protein  30.62 
 
 
284 aa  98.6  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.486754 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3806  hypothetical protein  30.62 
 
 
284 aa  98.6  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.305382  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2455  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.33 
 
 
362 aa  94.7  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4000  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.64 
 
 
321 aa  77  3e-13  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3644  hypothetical protein  27.43 
 
 
293 aa  74.7  2e-12  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3337  hypothetical protein  27.08 
 
 
298 aa  70.5  3e-11  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.491654 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2926  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.18 
 
 
305 aa  70.1  4e-11  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2495  hypothetical protein  28.34 
 
 
336 aa  65.9  7e-10  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.939833  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2053  integral membrane protein DUF6  23.88 
 
 
302 aa  65.5  9e-10  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1584  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.5 
 
 
312 aa  63.9  3e-09  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.317048 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0805  DMT family permease  25.84 
 
 
304 aa  62.4  9e-09  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0378246 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5528  hypothetical protein  26.47 
 
 
311 aa  62.4  1e-08  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2673  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.73 
 
 
294 aa  61.2  2e-08  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.481619  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5748  hypothetical protein  27.11 
 
 
303 aa  61.2  2e-08  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_5328  DMT family transporter: drug/metabolite  26.5 
 
 
300 aa  59.7  6e-08  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.681519  normal  0.112664 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0352  permease, drug/metabolite transporter  26.45 
 
 
306 aa  58.9  8e-08  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.110507  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1107  hypothetical protein  25.11 
 
 
316 aa  58.9  9e-08  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0257  DMT family permease  24.16 
 
 
310 aa  58.2  1e-07  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2763  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.33 
 
 
304 aa  58.5  1e-07  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0593  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.44 
 
 
283 aa  58.5  1e-07  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0716  hypothetical protein  26.29 
 
 
313 aa  57.8  2e-07  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003645  permease  28.47 
 
 
295 aa  57.8  2e-07  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.436376  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1832  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.18 
 
 
306 aa  57.8  2e-07  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.429903  normal  0.305907 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2645  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.11 
 
 
309 aa  57.4  3e-07  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03890  probable transmembrane protein  27.17 
 
 
294 aa  57  3e-07  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02200  hypothetical protein  27.57 
 
 
294 aa  57  4e-07  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16531  SMR family transporter  25.42 
 
 
316 aa  57  4e-07  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.724697 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0744  hypothetical protein  25.71 
 
 
312 aa  56.6  4e-07  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.906344  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0798  SMR family transporter PecM  25.08 
 
 
316 aa  56.6  5e-07  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1323  hypothetical protein  27.34 
 
 
296 aa  56.6  5e-07  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.81 
 
 
312 aa  56.6  5e-07  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0243  hypothetical protein  25.12 
 
 
312 aa  56.6  5e-07  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100372  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0260  DMT family permease  24.16 
 
 
312 aa  56.6  5e-07  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5619  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.71 
 
 
348 aa  56.2  6e-07  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.226332 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2779  hypothetical protein  27.34 
 
 
296 aa  56.2  6e-07  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.399846  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1039  hypothetical protein  26.84 
 
 
303 aa  56.2  6e-07  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.371653  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2858  hypothetical protein  27.34 
 
 
296 aa  56.2  6e-07  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1468  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.53 
 
 
303 aa  55.8  7e-07  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.845571  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3565  DMT family permease  30.97 
 
 
291 aa  55.8  7e-07  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3672  DMT family permease  23.02 
 
 
311 aa  55.8  8e-07  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.199096  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3529  hypothetical protein  29.68 
 
 
356 aa  55.8  9e-07  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23190  predicted permease  26.46 
 
 
287 aa  54.7  2e-06  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0147782 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0732  hypothetical protein  25.84 
 
 
343 aa  54.7  2e-06  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1011  hypothetical protein  29.3 
 
 
298 aa  54.7  2e-06  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0158427  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1240  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.52 
 
 
290 aa  53.9  3e-06  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  24.89 
 
 
289 aa  53.9  3e-06  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0314  hypothetical protein  24.79 
 
 
306 aa  53.9  3e-06  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5105  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.54 
 
 
349 aa  53.5  4e-06  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.910123  normal  0.400388 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2433  hypothetical protein  29.35 
 
 
294 aa  53.5  4e-06  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.21912  normal  0.079185 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1447  hypothetical protein  26.87 
 
 
299 aa  52.8  6e-06  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1578  hypothetical protein  27.46 
 
 
311 aa  52.8  6e-06  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.664968  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2588  hypothetical protein  24.24 
 
 
293 aa  52.4  8e-06  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0344975  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0682  hypothetical protein  29.29 
 
 
299 aa  52.8  8e-06  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.095942  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2704  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.24 
 
 
297 aa  52.4  9e-06  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1406  hypothetical protein  24.89 
 
 
324 aa  52  1e-05  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.520748  normal  0.479385 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4228  drug/metabolite exporter family protein  21.53 
 
 
299 aa  52  1e-05  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1828  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25 
 
 
310 aa  52  1e-05  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000133968  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0265  hypothetical protein  24.06 
 
 
307 aa  52  1e-05  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.726467  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1917  permease of the drug/metabolite transporter  25.39 
 
 
364 aa  51.6  1e-05  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0924  hypothetical protein  27.74 
 
 
306 aa  51.6  1e-05  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1225  hypothetical protein  27.74 
 
 
306 aa  51.6  1e-05  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.157758  normal  0.931863 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5896  hypothetical protein  25.09 
 
 
321 aa  52.4  1e-05  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.557426 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0065  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.89 
 
 
307 aa  52  1e-05  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>