229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3232 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_3232  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 218 aa  445  1.0000000000000001e-124  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.74588  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1764  hypothetical protein  49.53 
 
 		 232 aa  199  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2955  hypothetical protein  47.44 
 
 		 237 aa  197  9e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0919903  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0475  hypothetical protein  46.92 
 
 		 227 aa  185  4e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0149122 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1319  Lipocalin  46.32 
 
 		 260 aa  185  5e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00248779 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0211  Methyltransferase type 12  48.8 
 
 		 214 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.873381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0824  methyltransferase type 12  38.69 
 
 		 200 aa  118  9e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1626  hypothetical protein  29.44 
 
 		 231 aa  93.6  2e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.220792 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0515  Methyltransferase type 12  30.91 
 
 		 235 aa  92  7e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0562  methyltransferase type 12  29.88 
 
 		 239 aa  89.4  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0580  Methyltransferase type 12  27.93 
 
 		 233 aa  87.8  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.260933 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1383  Methyltransferase type 12  36.42 
 
 		 249 aa  85.1  7e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.413132  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0609  Methyltransferase type 12  26.29 
 
 		 235 aa  83.6  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0452  methyltransferase type 12  25.91 
 
 		 244 aa  82.4  0.000000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.652795 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1760  hypothetical protein  29.63 
 
 		 229 aa  80.5  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0686  Methyltransferase type 12  30.46 
 
 		 236 aa  78.2  0.00000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1098  methyltransferase small  26.67 
 
 		 210 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2848  histidine kinase  25.45 
 
 		 217 aa  73.2  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.531025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01421  hypothetical protein  35.4 
 
 		 129 aa  72.8  0.000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.232872  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4036  histidine kinase  26.39 
 
 		 221 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3014  hypothetical protein  28.47 
 
 		 230 aa  71.6  0.000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1002  methyltransferase small  33.11 
 
 		 240 aa  71.2  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0005  methyltransferase small  32.06 
 
 		 264 aa  70.5  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.125741 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1100  histidine kinase  26.83 
 
 		 219 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000104684 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3445  histidine kinase  26.83 
 
 		 219 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00303754 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3309  histidine kinase  26.83 
 
 		 219 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3267  histidine kinase  26.83 
 
 		 219 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2589  hypothetical protein  25.58 
 
 		 240 aa  66.6  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2861  histidine kinase  26.39 
 
 		 219 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1029  methyltransferase small  31.09 
 
 		 240 aa  62.4  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0043  hypothetical protein  32.89 
 
 		 232 aa  60.1  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1914  histidine kinase  26.36 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.116894  normal  0.357859 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0253  hypothetical protein  30 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0638202  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002195  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.79 
 
 		 295 aa  55.5  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00271176  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25153  predicted protein  24.88 
 
 		 338 aa  55.1  0.0000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00188354  hitchhiker  0.00255191 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1737  Methyltransferase-16, putative  28.77 
 
 		 246 aa  55.1  0.0000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.762946 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2810  Methyltransferase type 11  29.55 
 
 		 246 aa  54.7  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.54366  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92077  predicted protein  29.01 
 
 		 215 aa  54.7  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00026919  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00173  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.79 
 
 		 295 aa  53.5  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2837  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.66 
 
 		 294 aa  53.5  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104112  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0726  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  29.61 
 
 		 242 aa  53.1  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643352  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2435  hypothetical protein  28.57 
 
 		 237 aa  53.5  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.77423 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0687  hypothetical protein  33.06 
 
 		 217 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1068  methyltransferase type 11  30.41 
 
 		 417 aa  52.4  0.000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0014  UbiE/COQ5 family methlytransferase  29.55 
 
 		 244 aa  52.4  0.000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03000  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.33 
 
 		 301 aa  52  0.000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2164  hypothetical protein  27.56 
 
 		 242 aa  51.6  0.000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.883153  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0747  hypothetical protein  27.56 
 
 		 242 aa  51.6  0.000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2580  hypothetical protein  27.56 
 
 		 242 aa  51.6  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3087  hypothetical protein  27.56 
 
 		 252 aa  51.6  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.124312  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2034  hypothetical protein  27.56 
 
 		 242 aa  51.6  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3033  hypothetical protein  27.56 
 
 		 252 aa  51.6  0.000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.274712  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3115  methyl transferase  27.56 
 
 		 283 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2687  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.16 
 
 		 295 aa  50.8  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000011349  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2252  methyltransferase type 11  24.68 
 
 		 266 aa  50.1  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0529  methyltransferase small  42.86 
 
 		 211 aa  50.1  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.118716  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0640  hypothetical protein  27.22 
 
 		 223 aa  49.3  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.335057  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0114  hypothetical protein  27.45 
 
 		 262 aa  48.9  0.00006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_92679  predicted protein  31.87 
 
 		 216 aa  48.9  0.00006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0111  hypothetical protein  27.45 
 
 		 262 aa  48.9  0.00006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0314967  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0331  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.36 
 
 		 293 aa  48.9  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0201798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2196  Methyltransferase type 11  33.01 
 
 		 266 aa  48.5  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4465  hypothetical protein  31.4 
 
 		 217 aa  48.1  0.00009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5022  hypothetical protein  30.51 
 
 		 218 aa  48.1  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.949799 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0540  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.93 
 
 		 293 aa  48.1  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0395  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.06 
 
 		 293 aa  47.8  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0318  hypothetical protein  29.05 
 
 		 231 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.811126 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1665  ribosomal L11 methyltransferase  39.39 
 
 		 264 aa  47.8  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4895  methyltransferase type 11  27.63 
 
 		 242 aa  47.8  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00265389 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4421  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.2 
 
 		 293 aa  47.8  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00260494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0566  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.84 
 
 		 296 aa  47.8  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0178303  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0401  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.06 
 
 		 293 aa  47.8  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0130632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3624  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.06 
 
 		 293 aa  47.8  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000162524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0455  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.06 
 
 		 293 aa  47.8  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000781607  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1028  methyltransferase type 11  29.52 
 
 		 250 aa  47.8  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0400  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.06 
 
 		 293 aa  47.8  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0151894  normal  0.0533338 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3963  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.06 
 
 		 293 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00574631  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4117  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.43 
 
 		 293 aa  47.4  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0350894  hitchhiker  0.000425949 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2596  biotin biosynthesis protein bioC  29.14 
 
 		 265 aa  47.4  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.093326  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1129  Methyltransferase type 11  26.51 
 
 		 274 aa  47  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0978373  normal  0.945525 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3130  Methyltransferase type 11  28.91 
 
 		 261 aa  47.4  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.239042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3886  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.06 
 
 		 293 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.393855  hitchhiker  0.00000257617 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0513  hypothetical protein  25.64 
 
 		 220 aa  47.4  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3442  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.06 
 
 		 293 aa  47.4  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.116345  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1738  ribosomal L11 methyltransferase  39.39 
 
 		 264 aa  47.4  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4079  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.06 
 
 		 293 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0139274  normal  0.0416888 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0217  methyltransferase  35.06 
 
 		 200 aa  47.4  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3938  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.06 
 
 		 293 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000797733  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0400  methyltransferase type 11  31.43 
 
 		 248 aa  46.6  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.555595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  29.37 
 
 		 209 aa  46.2  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1372  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.75 
 
 		 303 aa  46.6  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.71577  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0951  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.2 
 
 		 294 aa  46.2  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3214  methyltransferase of 50S ribosomal subunit protein L11  34.07 
 
 		 311 aa  45.8  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.450631 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3687  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.53 
 
 		 295 aa  46.2  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.768619  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0918  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.61 
 
 		 232 aa  45.8  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0317965 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1594  ribosomal L11 methyltransferase  25.93 
 
 		 288 aa  45.8  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.77497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2522  Methyltransferase type 11  33.62 
 
 		 280 aa  45.8  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0795071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0914  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.61 
 
 		 232 aa  45.8  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.497259  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2163  hypothetical protein  26.97 
 
 		 214 aa  45.8  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1260  ribosomal protein L11 methyltransferase  30 
 
 		 278 aa  45.8  0.0005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.337848  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>