More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2472 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_2472  class II aldolase/adducin family protein  100 
 
 
324 aa  659    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.480175  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2810  class II aldolase/adducin family protein  48.77 
 
 
332 aa  303  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3569  hypothetical protein  46.58 
 
 
332 aa  292  5e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0217  class II aldolase/adducin family protein  46.42 
 
 
323 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311562  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1965  class II aldolase/adducin family protein  42.29 
 
 
385 aa  236  4e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0068  class II aldolase/adducin family protein  43.35 
 
 
213 aa  136  5e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0993  hypothetical protein  48.36 
 
 
138 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1048  protein of unknown function UPF0066  49.18 
 
 
140 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.177831  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1052  protein of unknown function UPF0066  48.36 
 
 
140 aa  126  6e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2195  hypothetical protein  45 
 
 
138 aa  122  8e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150123  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4671  hypothetical protein  44.8 
 
 
131 aa  113  4.0000000000000004e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.199008 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1908  hypothetical protein  41.18 
 
 
131 aa  102  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.336096  unclonable  0.00000890078 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1090  vacuolar H+-transporting two-sector ATPase, F subunit  43.2 
 
 
141 aa  99.4  7e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1290  class II aldolase/adducin family protein  31.72 
 
 
265 aa  98.6  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0014  putative aldolase  34.81 
 
 
210 aa  98.6  1e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0503  class II aldolase/adducin family protein  34.55 
 
 
181 aa  97.8  2e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1486  class II aldolase/adducin family protein  34.97 
 
 
190 aa  95.9  9e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0704  class II aldolase/adducin-like  34.08 
 
 
207 aa  95.5  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4769  class II aldolase/adducin family protein  35.8 
 
 
227 aa  94.7  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04752  putative aldolase  34.25 
 
 
215 aa  92.8  7e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0929  class II aldolase/adducin family protein  31.64 
 
 
239 aa  92.8  8e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0434  class II aldolase/adducin family protein  34.55 
 
 
180 aa  92.4  9e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.192772  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1747  class II aldolase/adducin family protein  31.46 
 
 
303 aa  92  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.241807  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1298  class II aldolase/adducin family protein  31.98 
 
 
398 aa  91.3  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.65057  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0210  putative aldolase  34.46 
 
 
210 aa  90.5  3e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0128  class II aldolase/adducin family protein  32.35 
 
 
214 aa  90.5  3e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.717156  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0512  hypothetical protein  37.6 
 
 
151 aa  90.1  5e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.140743  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0414  class II aldolase/adducin family protein  31.55 
 
 
214 aa  89  1e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0398  class II aldolase/adducin family protein  34.24 
 
 
214 aa  88.6  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0966  class II aldolase/adducin family protein  35.23 
 
 
217 aa  88.2  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2170  putative aldolase  34.43 
 
 
220 aa  87.8  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.842805  normal  0.213675 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4482  class II aldolase/adducin-like  34.64 
 
 
220 aa  87.8  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0177289  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0403  class II aldolase/adducin family protein  33.13 
 
 
181 aa  87.8  2e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.631542  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2551  putative aldolase  33.7 
 
 
210 aa  87  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.189319  hitchhiker  0.00972731 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0464  putative aldolase  34.09 
 
 
212 aa  87  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0760  hypothetical protein  37.4 
 
 
143 aa  87  4e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000599137  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0736  hypothetical protein  37.4 
 
 
143 aa  87  4e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000191321  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5062  class II aldolase/adducin domain protein  34.09 
 
 
212 aa  86.3  7e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.754976  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2485  class II aldolase/adducin family protein  35.39 
 
 
226 aa  86.3  7e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0198  class II aldolase/adducin family protein  31.14 
 
 
180 aa  85.9  9e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0602846  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0319  class II aldolase/adducin-like protein  27.17 
 
 
214 aa  85.9  9e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.294023  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1697  class II aldolase/adducin family protein  32.56 
 
 
188 aa  83.6  0.000000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2896  putative aldolase  31.49 
 
 
220 aa  82.4  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0811936 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4425  putative aldolase  34.27 
 
 
218 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.869936  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3402  class II aldolase/adducin family protein  32.6 
 
 
225 aa  82  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.852747  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0453  hypothetical protein  37.5 
 
 
165 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.276022  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2580  class II aldolase/adducin family protein  29.21 
 
 
216 aa  82  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000288741  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1110  L-fuculose phosphate aldolase, putative  34.46 
 
 
219 aa  81.3  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5929  putative aldolase  34.27 
 
 
220 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3030  L-fuculose-1-phosphate aldolase  33.52 
 
 
220 aa  81.3  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0672732  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5324  hypothetical protein  38.84 
 
 
162 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0617685 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1837  putative aldolase  33.52 
 
 
212 aa  81.3  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0769134  normal  0.0677306 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1861  class II aldolase/adducin family protein  34.44 
 
 
212 aa  81.3  0.00000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00424065  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2747  putative aldolase  31.07 
 
 
231 aa  81.3  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.339118  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0116  putative aldolase  35.26 
 
 
218 aa  81.6  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02588  hypothetical protein  35.5 
 
 
212 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0950  class II aldolase/adducin family protein  35.5 
 
 
212 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3035  putative aldolase  35.5 
 
 
212 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2876  putative aldolase  35.5 
 
 
212 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3136  putative aldolase  35.5 
 
 
212 aa  80.9  0.00000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2825  putative aldolase  31.07 
 
 
243 aa  80.9  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0974  putative aldolase  35.5 
 
 
212 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.776053  normal  0.938908 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02553  hypothetical protein  35.5 
 
 
212 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0110  putative aldolase  35.26 
 
 
218 aa  80.9  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2465  class II aldolase/adducin family protein  35.71 
 
 
215 aa  79.7  0.00000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5310  putative aldolase  31.49 
 
 
222 aa  79.3  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0747891  normal  0.711943 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0711  class II aldolase/adducin family protein  33.13 
 
 
222 aa  79.3  0.00000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00125122  unclonable  2.5701e-17 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0340  hypothetical protein  39.17 
 
 
145 aa  79.3  0.00000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.634355  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1346  class II aldolase/adducin family protein  30.67 
 
 
189 aa  79  0.00000000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0532237  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2292  hypothetical protein  38.21 
 
 
265 aa  79.3  0.00000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2481  hypothetical protein  36.29 
 
 
182 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.35717 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1177  class II aldolase/adducin family protein  28.33 
 
 
264 aa  78.6  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000951199  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4323  putative aldolase  32.04 
 
 
225 aa  78.6  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.138256 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5014  putative aldolase  31.49 
 
 
224 aa  78.2  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0583347  normal  0.341145 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3731  class II aldolase/adducin family protein  32.16 
 
 
220 aa  78.2  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1137  putative aldolase  32.43 
 
 
226 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.73575 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0426  class II aldolase/adducin family protein  31.32 
 
 
191 aa  77.4  0.0000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000249785  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0476  putative aldolase  33.71 
 
 
212 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.369646  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3562  L-fuculose-phosphate aldolase  34.34 
 
 
214 aa  77.8  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.272655  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5557  protein of unknown function UPF0066  38.84 
 
 
162 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.233079  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1984  hypothetical protein  36.89 
 
 
164 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2082  putative aldolase  33.14 
 
 
220 aa  77.4  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.966031  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0939  class II aldolase/adducin family protein  31.1 
 
 
185 aa  77  0.0000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.100017 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3215  class II aldolase/adducin family protein  29.88 
 
 
216 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.549465  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4390  hypothetical protein  35.83 
 
 
176 aa  77.4  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1490  putative aldolase  35.16 
 
 
210 aa  77  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0388  hypothetical protein  35.71 
 
 
127 aa  77  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1425  putative aldolase  31.32 
 
 
217 aa  76.6  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0428074  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0722  protein of unknown function UPF0066  38.02 
 
 
168 aa  76.6  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0604494  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0024  protein of unknown function UPF0066  33.33 
 
 
135 aa  76.6  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1087  Sodium-transporting two-sector ATPase  35 
 
 
144 aa  76.6  0.0000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0424  class II aldolase/adducin family protein  32.34 
 
 
222 aa  76.6  0.0000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.130241  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0276  protein of unknown function UPF0066  33.33 
 
 
145 aa  76.6  0.0000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1135  hypothetical protein  35.54 
 
 
138 aa  76.3  0.0000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00122763  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3764  class II aldolase/adducin family protein  32.22 
 
 
212 aa  76.3  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00716825  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3734  putative aldolase  33.52 
 
 
214 aa  76.3  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1445  class II aldolase/adducin family protein  32.43 
 
 
208 aa  76.3  0.0000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2023  class II aldolase/adducin family protein  32.43 
 
 
208 aa  75.9  0.0000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0841682  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0709  hypothetical protein  38.02 
 
 
178 aa  75.9  0.0000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.045832  normal  0.207854 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3066  putative aldolase  34.32 
 
 
212 aa  75.1  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.494057 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>