275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0779 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0779  Hydantoinase/oxoprolinase  100 
 
 
553 aa  1124    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2282  hydantoinase/oxoprolinase family protein  48.54 
 
 
550 aa  517  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0836  Hydantoinase/oxoprolinase  48.93 
 
 
583 aa  518  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0997414 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1002  hydantoinase/oxoprolinase  48.54 
 
 
550 aa  509  1e-143  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.184636  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0990  hydantoinase/oxoprolinase  45.52 
 
 
557 aa  483  1e-135  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.454811 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0222  Hydantoinase/oxoprolinase  45.16 
 
 
557 aa  456  1e-127  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.134992 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4059  hydantoinase/oxoprolinase  42.62 
 
 
566 aa  417  9.999999999999999e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3162  hydantoinase/oxoprolinase  40.73 
 
 
572 aa  403  1e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.212808  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1404  hydantoinase/oxoprolinase  40.54 
 
 
560 aa  381  1e-104  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2933  hydantoinase/oxoprolinase  36.94 
 
 
570 aa  354  2e-96  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0177705 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22450  N-methylhydantoinase (ATP-hydrolyzing)  35.99 
 
 
579 aa  343  4e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2142  Hydantoinase/oxoprolinase  36.38 
 
 
693 aa  320  5e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1886  hydantoinase/oxoprolinase  34.77 
 
 
560 aa  313  5.999999999999999e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0999  Hydantoinase/oxoprolinase  35.43 
 
 
564 aa  299  7e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2126  Hydantoinase/oxoprolinase  34.53 
 
 
556 aa  297  3e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.031039  normal  0.0613561 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0975  hydantoinase/oxoprolinase  32.79 
 
 
559 aa  293  6e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1032  Hydantoinase/oxoprolinase  31.94 
 
 
546 aa  293  7e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2734  Hydantoinase/oxoprolinase  33.69 
 
 
559 aa  265  2e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1734  Hydantoinase/oxoprolinase  36 
 
 
658 aa  169  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2805  hydantoinase/oxoprolinase  33.01 
 
 
668 aa  151  2e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.726576 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0899  hydantoinase/oxoprolinase  30.23 
 
 
643 aa  150  7e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.742994  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2490  hydantoinase  29.33 
 
 
636 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1067  hydantoinase  31.79 
 
 
671 aa  146  1e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1967  hydantoinase/oxoprolinase  29.71 
 
 
639 aa  146  1e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0900  hydantoinase/oxoprolinase  29.53 
 
 
641 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.409671  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0817  hydantoinase/oxoprolinase  32.02 
 
 
638 aa  141  3e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.391568  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1068  hydantoinase  31.36 
 
 
642 aa  137  5e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3607  hypothetical protein  34.29 
 
 
675 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1134  hydantoinase/oxoprolinase  29.8 
 
 
645 aa  136  9.999999999999999e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.187357  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3293  hydantoinase/oxoprolinase  33.7 
 
 
675 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.220696  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2933  hydantoinase/oxoprolinase  32.14 
 
 
570 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.714431 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2491  hydantoinase  29.36 
 
 
701 aa  134  3e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0141  hydantoinase  28.53 
 
 
644 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.456007 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0930  hydantoinase/oxoprolinase  27.65 
 
 
481 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00360521  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3269  hydantoinase/oxoprolinase  32.16 
 
 
667 aa  131  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.471232  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0187  Hydantoinase/oxoprolinase  30.72 
 
 
553 aa  129  9.000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0574  Hydantoinase/oxoprolinase  30.15 
 
 
708 aa  121  3e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000997997  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0092  hydantoinase/oxoprolinase family protein  28.89 
 
 
575 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0427  hydantoinase/oxoprolinase  27.44 
 
 
519 aa  116  8.999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0645976  normal  0.347806 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2177  Hydantoinase/oxoprolinase  29 
 
 
665 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3766  hydantoinase/oxoprolinase  24.66 
 
 
710 aa  110  6e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4697  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.02 
 
 
692 aa  110  9.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.599265  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1963  hydantoinase/oxoprolinase  26.2 
 
 
516 aa  109  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0652  Hydantoinase/oxoprolinase  28.78 
 
 
516 aa  109  1e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0481682 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2018  Hydantoinase/oxoprolinase  25.69 
 
 
707 aa  109  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.128113  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3115  Hydantoinase/oxoprolinase  28.84 
 
 
686 aa  107  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0161  Hydantoinase/oxoprolinase  27.68 
 
 
715 aa  107  5e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3586  Hydantoinase/oxoprolinase  26.5 
 
 
519 aa  107  5e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  0.0167077  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0422  hydantoinase/oxoprolinase  29.59 
 
 
715 aa  105  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2513  Hydantoinase/oxoprolinase  29.91 
 
 
734 aa  104  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0312936 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3601  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.72 
 
 
682 aa  104  5e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0475  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  24.4 
 
 
680 aa  102  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2141  Hydantoinase/oxoprolinase  25.62 
 
 
519 aa  102  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0444045 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3064  Hydantoinase/oxoprolinase  30.32 
 
 
526 aa  102  2e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3641  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.25 
 
 
676 aa  102  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3384  Hydantoinase/oxoprolinase  29 
 
 
735 aa  100  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.637442  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6263  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.06 
 
 
673 aa  100  6e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0095  hydantoinase/oxoprolinase  24.51 
 
 
517 aa  100  6e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2442  hydantoinase/oxoprolinase  24.7 
 
 
694 aa  100  9e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2647  hydantoinase/oxoprolinase  26.83 
 
 
678 aa  99.4  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1547  hydantoinase/oxoprolinase  25.31 
 
 
515 aa  98.2  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1851  hydantoinase/oxoprolinase  26.36 
 
 
518 aa  98.6  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.51976  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0654  hydantoinase/oxoprolinase  27.76 
 
 
708 aa  97.8  4e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3091  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.79 
 
 
681 aa  98.2  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.435048  normal  0.0725739 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4116  Hydantoinase/oxoprolinase  26.88 
 
 
519 aa  97.4  6e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.665366  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4974  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32 
 
 
679 aa  97.4  6e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.167294 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22890  N-methylhydantoinase A/acetone carboxylase, beta subunit  27.59 
 
 
515 aa  96.3  1e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.700503 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5378  hydantoinase  25 
 
 
517 aa  95.1  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2412  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.6 
 
 
662 aa  95.1  3e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0201127  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2949  hydantoinase/oxoprolinase  27.29 
 
 
519 aa  94.7  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5243  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.06 
 
 
765 aa  94.7  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5622  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.06 
 
 
706 aa  94.4  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.49803 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01100  hypothetical 5-oxoprolinase (Eurofung)  24.71 
 
 
1355 aa  94  7e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0381114 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1727  Hydantoinase/oxoprolinase  29.59 
 
 
522 aa  93.2  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.666608  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3731  hydantoinase/oxoprolinase  24.6 
 
 
692 aa  93.2  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.863672  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2293  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.16 
 
 
672 aa  92.8  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.278366 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1913  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.39 
 
 
684 aa  92.4  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0388506 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3493  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.56 
 
 
681 aa  92.8  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.875843  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0640  putative N-methylhydantoinase A  26.91 
 
 
672 aa  91.7  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.221754  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4426  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.06 
 
 
692 aa  91.3  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4112  hydantoinase/oxoprolinase  26.45 
 
 
538 aa  91.3  4e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1496  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.53 
 
 
706 aa  90.9  6e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0678775  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0803  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  24.46 
 
 
684 aa  89.7  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.148951  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3366  N-methylhydantoinase A, beta-subunit (ATP- hydrolyzing)  28.84 
 
 
507 aa  90.1  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.712496  normal  0.127548 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1995  Hydantoinase/oxoprolinase  29.88 
 
 
522 aa  89.4  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5966  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.27 
 
 
694 aa  89.4  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.858122  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2368  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.16 
 
 
680 aa  89.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.773275  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1696  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.75 
 
 
684 aa  89  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0038  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.85 
 
 
661 aa  88.6  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8488  Hydantoinase/oxoprolinase  28.96 
 
 
682 aa  88.6  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.593385  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1876  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.86 
 
 
690 aa  88.2  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0079  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.6 
 
 
687 aa  88.6  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9128  hydantoin utilization protein  26.05 
 
 
680 aa  87.8  5e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20940  N-methylhydantoinase A/acetone carboxylase, beta subunit  25.25 
 
 
706 aa  87.4  6e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796393  normal  0.0791884 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1245  Hydantoinase/oxoprolinase  27.85 
 
 
679 aa  87.4  6e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.529227  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6536  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.97 
 
 
678 aa  87.4  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.234426 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3765  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  24.27 
 
 
690 aa  87  7e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.32896  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4325  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.12 
 
 
691 aa  87.4  7e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.79538  normal  0.392847 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8320  hydantoin utilization protein  24.54 
 
 
676 aa  86.7  9e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2299  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.41 
 
 
694 aa  86.3  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.375878  normal  0.208319 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>