More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0756 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0756  hydrogenase accessory protein HypB  100 
 
 		 218 aa  447  1e-125  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.901261  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1497  hydrogenase accessory protein HypB  64.22 
 
 		 222 aa  302  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0637666  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3165  hydrogenase accessory protein HypB  64.06 
 
 		 218 aa  303  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0461052 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0448  hydrogenase accessory protein HypB  65.24 
 
 		 220 aa  300  9e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0929  hydrogenase accessory protein HypB  63.81 
 
 		 224 aa  293  1e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.367308 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1307  hydrogenase accessory protein HypB  61.29 
 
 		 219 aa  290  8e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00162338  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3066  hydrogenase accessory protein HypB  55.14 
 
 		 286 aa  251  5.000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.13732  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0438  hydrogenase accessory protein HypB  52.58 
 
 		 284 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.408549 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0427  hydrogenase accessory protein HypB  52.58 
 
 		 284 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02577  GTP hydrolase involved in nickel liganding into hydrogenases  53.3 
 
 		 290 aa  242  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0962  hydrogenase accessory protein HypB  53.3 
 
 		 290 aa  242  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3015  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  53.3 
 
 		 290 aa  242  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2852  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  53.3 
 
 		 290 aa  242  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.484483 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3150  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  53.3 
 
 		 290 aa  242  3.9999999999999997e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0985  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  53.3 
 
 		 290 aa  242  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.225312 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7255  hydrogenase accessory protein HypB  54.07 
 
 		 292 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.634166  normal  0.351792 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2864  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  53.3 
 
 		 290 aa  242  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02542  hypothetical protein  53.3 
 
 		 290 aa  242  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3008  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  53.3 
 
 		 290 aa  241  7.999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0101113 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2977  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  53.3 
 
 		 290 aa  241  9e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3979  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  53.3 
 
 		 290 aa  240  9e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3060  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  53.3 
 
 		 290 aa  241  9e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0585288 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3044  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  53.3 
 
 		 290 aa  241  9e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00655441 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0120  hydrogenase accessory protein HypB  57.69 
 
 		 244 aa  240  1e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000574081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0802  hydrogenase accessory protein HypB  52.88 
 
 		 279 aa  240  1e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.287566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2781  hydrogenase accessory protein HypB  53.21 
 
 		 276 aa  239  2e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0305  hydrogenase accessory protein HypB  57.21 
 
 		 254 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4012  hydrogenase accessory protein HypB  53.18 
 
 		 225 aa  238  8e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.411512 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0475  hydrogenase accessory protein HypB  54.19 
 
 		 288 aa  237  9e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.600099 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3165  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  52.83 
 
 		 290 aa  237  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.591749 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3761  hydrogenase accessory protein HypB  55.02 
 
 		 307 aa  237  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1949  hydrogenase accessory protein HypB  52.88 
 
 		 253 aa  236  2e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1169  hydrogenase accessory protein HypB  53.74 
 
 		 268 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0580173  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4096  hydrogenase accessory protein HypB  54.33 
 
 		 312 aa  232  3e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1383  hydrogenase accessory protein HypB  53.02 
 
 		 268 aa  231  5e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0873622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0478  hydrogenase nickel incorporation  54.73 
 
 		 237 aa  231  6e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.278517  normal  0.249483 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4608  hydrogenase accessory protein HypB  48.61 
 
 		 281 aa  231  8.000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3200  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  53.77 
 
 		 287 aa  230  1e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.747467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1810  hydrogenase accessory protein HypB  51.18 
 
 		 292 aa  230  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3978  hydrogenase accessory protein HypB  51.36 
 
 		 352 aa  229  3e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0171  hydrogenase accessory protein HypB  49.76 
 
 		 303 aa  229  3e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.452603  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1648  hydrogenase accessory protein HypB  52.29 
 
 		 223 aa  228  4e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1129  hydrogenase accessory protein HypB  53.27 
 
 		 273 aa  228  4e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3133  hydrogenase accessory protein HypB  53.55 
 
 		 282 aa  228  7e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3881  hydrogenase accessory protein HypB  50.24 
 
 		 267 aa  228  8e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.675088  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4559  hydrogenase accessory protein HypB  53.85 
 
 		 301 aa  227  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1786  hydrogenase accessory protein HypB  50.7 
 
 		 269 aa  227  1e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000796055  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4493  hydrogenase accessory protein HypB  54.07 
 
 		 300 aa  226  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.166702 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2007  hydrogenase nickel incorporation  50.95 
 
 		 321 aa  225  4e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.300196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3922  hydrogenase accessory protein HypB  55.56 
 
 		 322 aa  225  4e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.320935  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1166  hydrogenase accessory protein HypB  54.55 
 
 		 318 aa  224  6e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.153393  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2180  hydrogenase accessory protein HypB  49.3 
 
 		 217 aa  223  1e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.352538 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3978  hydrogenase accessory protein HypB  51.21 
 
 		 283 aa  223  2e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.83518  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50480  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  51.4 
 
 		 303 aa  223  2e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0494141  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2052  hydrogenase accessory protein HypB  50.71 
 
 		 269 aa  222  3e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.858375  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2132  hydrogenase accessory protein HypB  52.17 
 
 		 263 aa  222  4e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00364389 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2145  hydrogenase accessory protein HypB  51.69 
 
 		 261 aa  222  4e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2191  hydrogenase accessory protein HypB  51.69 
 
 		 261 aa  222  4e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.23017 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1274  hydrogenase accessory protein HypB  50.71 
 
 		 277 aa  221  4.9999999999999996e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.388022  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1417  hydrogenase accessory protein HypB  54.46 
 
 		 394 aa  221  6e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2527  hydrogenase accessory protein HypB  55.45 
 
 		 407 aa  221  8e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.455957  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1213  hydrogenase accessory protein HypB  47 
 
 		 218 aa  220  9.999999999999999e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0929883  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2417  hydrogenase accessory protein HypB  51.18 
 
 		 267 aa  219  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0580161  normal  0.128777 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2829  hydrogenase accessory protein HypB  47.44 
 
 		 216 aa  219  3e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0718  hydrogenase accessory protein HypB  47.34 
 
 		 257 aa  218  3.9999999999999997e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0866  hydrogenase accessory protein HypB  46.48 
 
 		 305 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1212  GTP hydrolase, accessory liganding Ni into hydrogenases, HypB  49.77 
 
 		 264 aa  218  5e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.113745 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0330  hydrogenase accessory protein HypB  52.75 
 
 		 294 aa  218  6e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0164285  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2436  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  52.38 
 
 		 264 aa  218  6e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3108  hydrogenase accessory protein HypB  53.02 
 
 		 306 aa  218  7e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1431  hydrogenase accessory protein HypB  47 
 
 		 217 aa  217  1e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1963  hydrogenase accessory protein HypB  50.68 
 
 		 328 aa  217  1e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3904  hydrogenase accessory protein HypB  47.85 
 
 		 284 aa  217  1e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1536  hydrogenase accessory protein HypB  47.73 
 
 		 326 aa  216  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0107781  normal  0.0565242 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2744  hydrogenase accessory protein HypB  50.72 
 
 		 293 aa  216  2e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4943  hydrogenase accessory protein HypB  49.31 
 
 		 225 aa  216  2e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000345448  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0302  hydrogenase accessory protein HypB  48.85 
 
 		 296 aa  216  2e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2886  hydrogenase accessory protein HypB  51.2 
 
 		 267 aa  216  2e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.896709  normal  0.39572 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3748  hydrogenase accessory protein HypB  51.17 
 
 		 319 aa  216  2e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3288  hydrogenase accessory protein HypB  51.2 
 
 		 266 aa  216  2e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2010  hydrogenase accessory protein HypB  48.62 
 
 		 226 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2445  hydrogenase accessory protein HypB  49.12 
 
 		 323 aa  216  2.9999999999999998e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.120884 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3881  hydrogenase accessory protein HypB  48.1 
 
 		 242 aa  214  7e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.785177 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0534  hydrogenase accessory protein HypB  48.34 
 
 		 275 aa  213  9.999999999999999e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1239  hydrogenase accessory protein HypB  45.62 
 
 		 217 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1644  hydrogenase accessory protein HypB  49.28 
 
 		 270 aa  212  3.9999999999999995e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2540  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  48.31 
 
 		 252 aa  210  1e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2395  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  47.83 
 
 		 252 aa  210  1e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1285  hydrogenase accessory protein HypB  48.12 
 
 		 345 aa  210  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.497783 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2157  hydrogenase accessory protein HypB  51.4 
 
 		 289 aa  210  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.126874  normal  0.122693 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0506  NI2+-binding GTPase protein HypB  50.93 
 
 		 289 aa  209  4e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1098  hydrogenase accessory protein HypB  44.81 
 
 		 278 aa  207  9e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1765  hydrogenase accessory protein HypB  47.22 
 
 		 264 aa  207  1e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.997182 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2815  hydrogenase-3 accessory protein, assembly of metallocenter  48.62 
 
 		 345 aa  206  1e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1174  hydrogenase accessory protein HypB  53.62 
 
 		 312 aa  206  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.150463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3214  hydrogenase accessory protein HypB  47.37 
 
 		 303 aa  206  2e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3365  hydrogenase expression/synthesis, HypA  50 
 
 		 263 aa  204  7e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.186715 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1563  hydrogenase accessory protein HypB  43.98 
 
 		 224 aa  204  9e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0444465  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0044  hydrogenase accessory protein HypB  42.79 
 
 		 250 aa  203  1e-51  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1046  hydrogenase accessory protein HypB  45.02 
 
 		 246 aa  203  1e-51  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.432152  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>