More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1359 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1359  queuine tRNA-ribosyltransferase  100 
 
 
372 aa  762  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000569759  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1120  queuine tRNA-ribosyltransferase  70.14 
 
 
369 aa  558  1e-158  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0231453  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1666  queuine tRNA-ribosyltransferase  69.89 
 
 
370 aa  534  1e-150  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.098612  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3622  queuine tRNA-ribosyltransferase  64.93 
 
 
372 aa  522  1e-147  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00110996  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1457  queuine tRNA-ribosyltransferase  63.74 
 
 
375 aa  520  1e-146  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000844701  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1694  queuine tRNA-ribosyltransferase  67.77 
 
 
373 aa  503  1e-141  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.556038 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0958  queuine tRNA-ribosyltransferase  59.73 
 
 
374 aa  489  1e-137  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0452051  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12290  queuine tRNA-ribosyltransferase  61.02 
 
 
373 aa  490  1e-137  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  3.56741e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2109  queuine tRNA-ribosyltransferase  64.09 
 
 
379 aa  485  1e-136  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0382  queuine tRNA-ribosyltransferase  60.78 
 
 
357 aa  483  1e-135  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0530  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.84 
 
 
373 aa  482  1e-135  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00176978  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1203  queuine tRNA-ribosyltransferase  60.71 
 
 
379 aa  478  1e-133  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.261953  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2619  queuine tRNA-ribosyltransferase  62.36 
 
 
373 aa  476  1e-133  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3134  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.4 
 
 
379 aa  471  1e-132  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.212476  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4264  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.79 
 
 
379 aa  471  1e-132  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  8.51523e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4502  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.85 
 
 
379 aa  468  1e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  5.75969e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1696  queuine tRNA-ribosyltransferase  59.89 
 
 
379 aa  469  1e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1275  queuine tRNA-ribosyltransferase  67.17 
 
 
336 aa  469  1e-131  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4497  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.85 
 
 
379 aa  468  1e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.28432e-05 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2518  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.13 
 
 
380 aa  468  1e-131  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00624233  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1729  queuine tRNA-ribosyltransferase  59.89 
 
 
379 aa  469  1e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.37523  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4161  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.85 
 
 
379 aa  468  1e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  3.10592e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4150  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.85 
 
 
379 aa  468  1e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.48017e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4312  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.85 
 
 
379 aa  468  1e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  4.8864e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4647  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.85 
 
 
379 aa  468  1e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  2.56565e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0699  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.13 
 
 
379 aa  470  1e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  2.27158e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4536  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.13 
 
 
379 aa  470  1e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  5.78318e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4551  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.85 
 
 
379 aa  468  1e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  1.70513e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1428  queuine tRNA-ribosyltransferase  60.11 
 
 
369 aa  467  1e-130  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00175971  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0930  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.85 
 
 
380 aa  462  1e-129  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0852  queuine tRNA-ribosyltransferase  59.62 
 
 
370 aa  461  1e-128  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1791  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.42 
 
 
370 aa  461  1e-128  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  3.78979e-06  hitchhiker  0.00274251 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1194  queuine tRNA-ribosyltransferase  62.33 
 
 
367 aa  449  1e-125  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1716  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.87 
 
 
371 aa  444  1e-124  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.2965  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2435  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.28 
 
 
372 aa  446  1e-124  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0396  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.27 
 
 
380 aa  442  1e-123  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000954967  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1785  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.55 
 
 
380 aa  443  1e-123  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0229472  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1782  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.28 
 
 
372 aa  444  1e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00114635 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1894  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.72 
 
 
355 aa  439  1e-122  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.38291e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1175  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.34 
 
 
368 aa  440  1e-122  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0539668  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0632  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.29 
 
 
392 aa  436  1e-121  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0710  queuine tRNA-ribosyltransferase  60.11 
 
 
376 aa  437  1e-121  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1606  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.66 
 
 
388 aa  436  1e-121  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.894963  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0931  queuine tRNA-ribosyltransferase  60.22 
 
 
394 aa  437  1e-121  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0159  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.82 
 
 
382 aa  436  1e-121  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.95405  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3258  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.97 
 
 
368 aa  430  1e-119  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  6.43926e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3335  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.5 
 
 
368 aa  426  1e-118  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00131766  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0911  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.77 
 
 
368 aa  426  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8642e-32 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1259  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.72 
 
 
379 aa  426  1e-118  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.527316  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2398  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.8 
 
 
368 aa  426  1e-118  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.65402e-10  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0907  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.83 
 
 
372 aa  427  1e-118  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2011  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.62 
 
 
380 aa  422  1e-117  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.638578  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0579  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.41 
 
 
370 aa  421  1e-116  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.350695  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1800  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.82 
 
 
374 aa  420  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3097  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.01 
 
 
387 aa  419  1e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.141745  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2906  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.83 
 
 
387 aa  420  1e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.905549  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0049  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.19 
 
 
392 aa  419  1e-116  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0707792  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3123  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.47 
 
 
374 aa  415  1e-115  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00561158  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3384  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.47 
 
 
374 aa  415  1e-115  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000344335  normal  0.488605 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_52  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.92 
 
 
392 aa  415  1e-115  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000223938  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0052  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.07 
 
 
392 aa  417  1e-115  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1187  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.28 
 
 
384 aa  415  1e-115  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00200873  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1019  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.1 
 
 
381 aa  415  1e-115  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2435  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.99 
 
 
375 aa  417  1e-115  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3264  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.47 
 
 
374 aa  415  1e-115  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000400897  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2059  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.96 
 
 
371 aa  412  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0438  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.51 
 
 
375 aa  413  1e-114  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1215  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.08 
 
 
385 aa  413  1e-114  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.557932 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2017  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.78 
 
 
380 aa  414  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000528319  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0486  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.51 
 
 
375 aa  413  1e-114  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00354  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.51 
 
 
375 aa  413  1e-114  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.520405  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0436  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.51 
 
 
375 aa  413  1e-114  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0476  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.51 
 
 
375 aa  413  1e-114  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3227  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.51 
 
 
375 aa  413  1e-114  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  1.87089e-06 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0521  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.24 
 
 
371 aa  414  1e-114  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1061  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.87 
 
 
374 aa  412  1e-114  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00184616 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3291  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.34 
 
 
381 aa  412  1e-114  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1717  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.96 
 
 
371 aa  412  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.647195 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3203  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.51 
 
 
375 aa  413  1e-114  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.372376  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0325  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.51 
 
 
375 aa  413  1e-114  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00358  hypothetical protein  56.51 
 
 
375 aa  413  1e-114  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.575633  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1333  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.44 
 
 
370 aa  413  1e-114  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.299331  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1435  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.4 
 
 
374 aa  408  1e-113  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  6.52098e-07  hitchhiker  0.000858372 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1447  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.4 
 
 
374 aa  408  1e-113  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  3.28041e-06  normal  0.0357414 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0270  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.77 
 
 
379 aa  408  1e-113  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.147453  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0514  queuine tRNA-ribosyltransferase  55 
 
 
370 aa  409  1e-113  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1382  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.4 
 
 
374 aa  408  1e-113  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000246245  hitchhiker  1.18913e-05 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1305  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.17 
 
 
371 aa  408  1e-113  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1120  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.04 
 
 
385 aa  410  1e-113  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.38532  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01046  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.33 
 
 
378 aa  410  1e-113  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2892  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.34 
 
 
377 aa  408  1e-113  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.103545  hitchhiker  0.000645764 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0681  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.22 
 
 
370 aa  407  1e-112  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.111123  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0875  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.13 
 
 
375 aa  406  1e-112  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.68635  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2193  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.87 
 
 
374 aa  406  1e-112  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0616046  normal  0.0257357 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2075  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.14 
 
 
367 aa  406  1e-112  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.698983  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004367  tRNA-guanine transglycosylase  51.78 
 
 
382 aa  405  1e-112  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0455  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.96 
 
 
384 aa  407  1e-112  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2702  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.57 
 
 
374 aa  405  1e-112  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  6.54614e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0451  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.68 
 
 
375 aa  408  1e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0945287  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0464  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.68 
 
 
375 aa  408  1e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.992026  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>