95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1352 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1352  hypothetical protein  100 
 
 		 417 aa  865    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000699825  decreased coverage  0.0000016423 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2465  hypothetical protein  50.84 
 
 		 421 aa  455  1e-127  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.149567  normal  0.267329 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4689  hypothetical protein  46.37 
 
 		 419 aa  367  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0941  hypothetical protein  42.65 
 
 		 441 aa  295  8e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0564159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3223  hypothetical protein  33.8 
 
 		 428 aa  205  1e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.254658  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3776  hypothetical protein  27.48 
 
 		 438 aa  104  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000251059  hitchhiker  0.00347498 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2547  hypothetical protein  25.54 
 
 		 434 aa  100  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.119051  normal  0.289813 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3302  hypothetical protein  26.68 
 
 		 439 aa  97.1  6e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.181488 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2268  hypothetical protein  25.84 
 
 		 436 aa  96.3  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.459441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0163  hypothetical protein  25.27 
 
 		 451 aa  68.9  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.942803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0886  hypothetical protein  25.14 
 
 		 455 aa  67.8  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.109701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0594  hypothetical protein  23.82 
 
 		 455 aa  67.8  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.666308  hitchhiker  0.00000927115 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0398  hypothetical protein  24.57 
 
 		 455 aa  67  0.0000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.883113 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0482  hypothetical protein  24.25 
 
 		 448 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05010  hypothetical protein  24.25 
 
 		 448 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0583  hypothetical protein  23.55 
 
 		 455 aa  62.4  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0261491  hitchhiker  0.00025912 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2066  hypothetical protein  24.27 
 
 		 462 aa  60.5  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.76116  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2058  hypothetical protein  24.02 
 
 		 455 aa  60.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0166605  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24300  hypothetical protein  23.72 
 
 		 455 aa  60.5  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.147167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6783  hypothetical protein  24.78 
 
 		 521 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0992  hypothetical protein  30.27 
 
 		 456 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.1261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0223  hypothetical protein  26.94 
 
 		 453 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1806  hypothetical protein  24.12 
 
 		 454 aa  57.8  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00564831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2137  hypothetical protein  23.89 
 
 		 454 aa  57.8  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.181142 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2479  hypothetical protein  22.77 
 
 		 454 aa  57  0.0000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00147057  normal  0.0236321 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1156  hypothetical protein  25.92 
 
 		 459 aa  56.2  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2973  protein of unknown function DUF1329  24.72 
 
 		 455 aa  55.8  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.96658  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1150  hypothetical protein  29.73 
 
 		 462 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1999  hypothetical protein  24.07 
 
 		 455 aa  55.5  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00460648  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0766  hypothetical protein  23.08 
 
 		 454 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.825614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3166  hypothetical protein  25.09 
 
 		 451 aa  55.1  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.585126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2198  hypothetical protein  23.87 
 
 		 454 aa  54.3  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.394544  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2937  hypothetical protein  23.92 
 
 		 456 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2224  hypothetical protein  22.96 
 
 		 454 aa  53.9  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0337124  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0807  hypothetical protein  23.36 
 
 		 454 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4348  hypothetical protein  23.85 
 
 		 459 aa  53.9  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.277316  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3433  hypothetical protein  30 
 
 		 453 aa  53.9  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.451735  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1726  hypothetical protein  23.61 
 
 		 454 aa  53.9  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0200343  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4870  hypothetical protein  26.11 
 
 		 456 aa  53.9  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.49898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1185  hypothetical protein  24.36 
 
 		 455 aa  53.5  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0793  hypothetical protein  23.17 
 
 		 454 aa  53.5  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.520529  normal  0.180221 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3659  hypothetical protein  22.35 
 
 		 457 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.823343  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2703  hypothetical protein  23.5 
 
 		 261 aa  52.8  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13140  hypothetical protein  23.8 
 
 		 455 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1519  hypothetical protein  28.83 
 
 		 460 aa  52.4  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2596  hypothetical protein  23.48 
 
 		 454 aa  52.8  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1752  hypothetical protein  24.01 
 
 		 454 aa  52  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0127551  normal  0.672534 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1135  hypothetical protein  30.39 
 
 		 457 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.621628 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1363  hypothetical protein  26.04 
 
 		 451 aa  52  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.314999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1782  hypothetical protein  24.01 
 
 		 454 aa  52  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00144157  normal  0.133071 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4165  hypothetical protein  25 
 
 		 447 aa  52  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.466576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1677  hypothetical protein  24.01 
 
 		 454 aa  52  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00882036  normal  0.128248 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2319  hypothetical protein  30.41 
 
 		 451 aa  51.2  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000252338 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1719  hypothetical protein  23.57 
 
 		 455 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.416271  normal  0.143234 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003708  outer membrane lipoprotein-sorting protein  25.65 
 
 		 263 aa  51.2  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.212614  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2694  hypothetical protein  23.43 
 
 		 453 aa  51.2  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0223817  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1699  hypothetical protein  23.33 
 
 		 451 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.419588 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4707  hypothetical protein  24.68 
 
 		 454 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0317373  normal  0.139557 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4423  hypothetical protein  23.77 
 
 		 454 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.235878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2627  hypothetical protein  23.76 
 
 		 453 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.605472  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0589  hypothetical protein  24.26 
 
 		 435 aa  50.4  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000090884 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2003  hypothetical protein  29.05 
 
 		 452 aa  50.4  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.108317  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6838  hypothetical protein  33.55 
 
 		 453 aa  50.1  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0670921  normal  0.0354217 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2009  hypothetical protein  22.54 
 
 		 261 aa  49.7  0.00009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1939  hypothetical protein  23.61 
 
 		 454 aa  49.3  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.203598  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4262  hypothetical protein  23.99 
 
 		 459 aa  49.3  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0569982  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0906  hypothetical protein  28.29 
 
 		 455 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2805  hypothetical protein  25.08 
 
 		 453 aa  49.7  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2556  hypothetical protein  23.78 
 
 		 454 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0832128  normal  0.110045 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2436  hypothetical protein  23.78 
 
 		 454 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.351127  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1460  hypothetical protein  28.87 
 
 		 460 aa  48.5  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.673906  normal  0.786442 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1705  hypothetical protein  29.73 
 
 		 456 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3699  hypothetical protein  25.98 
 
 		 440 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6865  hypothetical protein  26.91 
 
 		 453 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00119627  normal  0.0926979 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1908  protein of unknown function DUF1329  23.78 
 
 		 454 aa  48.9  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000328398  normal  0.130945 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2443  hypothetical protein  23.78 
 
 		 454 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.714967  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1653  hypothetical protein  23.16 
 
 		 266 aa  47.8  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.561802  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2043  hypothetical protein  28.19 
 
 		 442 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19830  hypothetical protein  29.73 
 
 		 456 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0854065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1159  hypothetical protein  23.48 
 
 		 458 aa  47.8  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0591  hypothetical protein  24.38 
 
 		 459 aa  47.4  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293097 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3779  hypothetical protein  24.17 
 
 		 451 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5818  hypothetical protein  31.28 
 
 		 499 aa  47  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2163  hypothetical protein  26.1 
 
 		 449 aa  47  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0802537 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5042  hypothetical protein  31.28 
 
 		 499 aa  47  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.218422  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4361  hypothetical protein  31.28 
 
 		 455 aa  46.6  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4323  protein of unknown function DUF1329  32.69 
 
 		 454 aa  46.6  0.0009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.940807  normal  0.0836825 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4433  protein of unknown function DUF1329  32.69 
 
 		 454 aa  46.6  0.0009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0220692  normal  0.445109 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1589  hypothetical protein  22.49 
 
 		 454 aa  46.2  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0393574  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0806  hypothetical protein  33.85 
 
 		 1083 aa  45.4  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1179  hypothetical protein  28.3 
 
 		 263 aa  45.4  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0889  hypothetical protein  23.72 
 
 		 459 aa  45.1  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4027  protein of unknown function DUF1329  22.29 
 
 		 448 aa  44.3  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0887215  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0676  hypothetical protein  23.68 
 
 		 271 aa  43.5  0.007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.860563 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4060  protein of unknown function DUF1329  19.6 
 
 		 448 aa  43.5  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.126933  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>