More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1030 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1030  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 215 aa  431  1e-120  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2855  two component transcriptional regulator, LuxR family  68.25 
 
 		 217 aa  269  2e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1714  two component LuxR family transcriptional regulator  53.14 
 
 		 213 aa  237  1e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.975164  hitchhiker  0.000785935 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3060  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.14 
 
 		 215 aa  229  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3043  LuxR family DNA binding response regulator  53.62 
 
 		 209 aa  227  1e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0242  two component LuxR family transcriptional regulator  52.15 
 
 		 211 aa  204  8e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000159114 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0816  two component LuxR family transcriptional regulator  45.89 
 
 		 212 aa  188  4e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000419268  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0777  LuxR family DNA binding response regulator  43.27 
 
 		 215 aa  176  2e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.891731  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2450  two component LuxR family transcriptional regulator  42.58 
 
 		 214 aa  174  6e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00539256  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1639  response regulator  39.01 
 
 		 226 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00137195  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2677  response regulator  39.9 
 
 		 214 aa  171  5e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0738952  normal  0.957867 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2600  response regulator  39.9 
 
 		 214 aa  171  5e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000388579  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2562  response regulator  39.9 
 
 		 214 aa  171  5e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0171044  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1782  response regulator  39.9 
 
 		 214 aa  171  5e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0381154  hitchhiker  0.0000000750596 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2455  response regulator  39.9 
 
 		 214 aa  171  5.999999999999999e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.140183  normal  0.431169 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1953  response regulator  41.35 
 
 		 214 aa  171  5.999999999999999e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00404481  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2141  response regulator  38.76 
 
 		 214 aa  171  7.999999999999999e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.126922  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1824  response regulator  39.42 
 
 		 229 aa  171  9e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.152948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0833  response regulator  40.38 
 
 		 227 aa  171  1e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000189156  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3375  two component LuxR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 212 aa  170  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2150  response regulator  40 
 
 		 216 aa  170  1e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0590135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1547  response regulator  39.9 
 
 		 214 aa  171  1e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000288339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1614  response regulator  39.9 
 
 		 214 aa  170  1e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000746753  normal  0.505035 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1608  response regulator  39.9 
 
 		 214 aa  171  1e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000660452  normal  0.150334 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0815  two component LuxR family transcriptional regulator  43.27 
 
 		 213 aa  169  2e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000180305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1607  response regulator  40.1 
 
 		 214 aa  169  2e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000106395  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4099  DNA-binding response regulator GacA  42.79 
 
 		 212 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.427607  normal  0.0594882 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02748  response regulator  38.94 
 
 		 214 aa  169  3e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1765  two component LuxR family transcriptional regulator  42.79 
 
 		 212 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.456405  hitchhiker  0.00257365 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1860  response regulator  39.42 
 
 		 214 aa  167  1e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2613  response regulator GacA  40.95 
 
 		 214 aa  167  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.466832  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30650  response regulator GacA  40.95 
 
 		 214 aa  167  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00700013 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2649  response regulator  38.94 
 
 		 214 aa  166  2e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1725  response regulator  40.67 
 
 		 218 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000351159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1192  transcriptional regulator of LuxR family protein  38.94 
 
 		 214 aa  166  2.9999999999999998e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1732  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.67 
 
 		 218 aa  165  5e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000321601  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1269  response regulator  40.67 
 
 		 218 aa  165  5e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000584326  hitchhiker  0.00198125 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1041  response regulator  40.67 
 
 		 218 aa  165  5e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000644757  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2147  response regulator  40.67 
 
 		 218 aa  165  5e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000040455  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2686  response regulator  40.67 
 
 		 218 aa  165  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000957663  normal  0.053055 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2012  response regulator  40.67 
 
 		 218 aa  165  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000124814  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1848  response regulator  40.38 
 
 		 218 aa  165  5.9999999999999996e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0524957  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1450  response regulator  39.9 
 
 		 218 aa  163  1.0000000000000001e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1436  response regulator  38.46 
 
 		 214 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.794512  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1191  two component LuxR family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 219 aa  163  2.0000000000000002e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.259161  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2103  response regulator  40.67 
 
 		 218 aa  162  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0532421  hitchhiker  0.00988724 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1296  response regulator  40.67 
 
 		 218 aa  162  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0547167  hitchhiker  0.00000564902 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1173  response regulator  40.67 
 
 		 218 aa  162  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000706228  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2162  response regulator  40.67 
 
 		 218 aa  162  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.284818  hitchhiker  0.000000016111 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2375  two component LuxR family transcriptional regulator  41.9 
 
 		 214 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.405291  normal  0.0506876 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2253  response regulator  40.38 
 
 		 218 aa  162  4.0000000000000004e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000726498  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2052  response regulator  40.38 
 
 		 218 aa  162  4.0000000000000004e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000052182  hitchhiker  0.00148564 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2356  response regulator  40.38 
 
 		 218 aa  162  4.0000000000000004e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.996954  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1518  response regulator  40.76 
 
 		 220 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.121615  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2669  response regulator  39.9 
 
 		 218 aa  161  6e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000700042  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2110  response regulator  40.67 
 
 		 218 aa  160  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.167551  hitchhiker  0.00000000000000238763 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1594  response regulator  39.9 
 
 		 218 aa  160  1e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.518893  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2501  response regulator  40.78 
 
 		 218 aa  160  1e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000242353  normal  0.495647 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3271  response regulator  36.54 
 
 		 214 aa  159  4e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0222898  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3024  DNA-binding response regulator GacA  39.52 
 
 		 214 aa  159  4e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.26082  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2897  LuxR response regulator receiver  39.05 
 
 		 222 aa  157  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.017691  normal  0.317002 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25030  Response regulator GacA  39.61 
 
 		 209 aa  155  5.0000000000000005e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003098  BarA-associated response regulator UvrY  39.34 
 
 		 188 aa  152  4e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000268807  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5446  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.49 
 
 		 218 aa  152  5e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.26634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3067  two component LuxR family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 208 aa  150  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.598248 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6075  two-component response regulator  39.51 
 
 		 216 aa  150  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1205  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.98 
 
 		 212 aa  150  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2132  two component LuxR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 214 aa  149  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0449794  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01869  hypothetical protein  39.67 
 
 		 191 aa  145  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000330184  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0023  two component LuxR family transcriptional regulator  39.23 
 
 		 216 aa  145  4.0000000000000006e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3672  two component LuxR family transcriptional regulator  42.46 
 
 		 181 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.309643  hitchhiker  0.000000290511 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2571  transmission activator LetA  36.54 
 
 		 219 aa  144  1e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2271  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.71 
 
 		 223 aa  142  3e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2699  transmission activator LetA  36.06 
 
 		 219 aa  142  5e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3144  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.8 
 
 		 232 aa  141  9e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0320  two component LuxR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 221 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.15389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6235  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.02 
 
 		 210 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.612124 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6558  two component LuxR family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 210 aa  138  6e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.458284 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5126  two component LuxR family transcriptional regulator  38.65 
 
 		 209 aa  138  7.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.135043  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2054  response regulator receiver domain-containing protein  40 
 
 		 198 aa  138  7.999999999999999e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.595634 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1588  two component LuxR family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 215 aa  137  1e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.731747  normal  0.987016 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2471  two component LuxR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 220 aa  137  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7764  two component LuxR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 210 aa  136  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.527093  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01879  response regulator  39.88 
 
 		 169 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000614586  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1909  response regulator receiver protein  37.32 
 
 		 220 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.631594  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0703  LuxR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 211 aa  136  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000151408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0790  two component LuxR family transcriptional regulator  36.06 
 
 		 214 aa  136  3.0000000000000003e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.870503  normal  0.997505 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2722  two component LuxR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 214 aa  135  3.0000000000000003e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.378798 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1336  two component LuxR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 208 aa  135  4e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0677  two component LuxR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 211 aa  135  4e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00533706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2172  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.23 
 
 		 210 aa  135  5e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4618  LuxR response regulator receiver  37.2 
 
 		 209 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.601025 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0896  LuxR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 214 aa  134  9.999999999999999e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0998  response regulator  33.82 
 
 		 214 aa  134  9.999999999999999e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0745  putative two-component response regulator  38.16 
 
 		 210 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1691  two component LuxR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 208 aa  133  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0637899 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1168  LuxR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 216 aa  133  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07840  putative two-component response regulator  37.68 
 
 		 210 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0171986 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0828  response regulator  33.01 
 
 		 216 aa  132  3e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0183204  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1103  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.52 
 
 		 216 aa  132  3e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>