More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0160 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_0160  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
379 aa  778    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5501  glycosyl transferase group 1  37.34 
 
 
378 aa  125  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.205399  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  35.62 
 
 
406 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  30.34 
 
 
377 aa  111  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  40.7 
 
 
353 aa  109  6e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1998  glycosyl transferase group 1  32.39 
 
 
379 aa  108  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  40.83 
 
 
370 aa  108  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1001  glycosyl transferase group 1  34.02 
 
 
411 aa  108  2e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  30.86 
 
 
360 aa  102  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1851  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
406 aa  102  1e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2192  glycosyl transferase group 1  30.58 
 
 
390 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  34.96 
 
 
377 aa  101  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  37.56 
 
 
395 aa  101  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  39.62 
 
 
376 aa  101  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  36.84 
 
 
360 aa  100  6e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  35.71 
 
 
384 aa  99.4  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.74 
 
 
407 aa  98.2  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2254  glycosyl transferase group 1  30.22 
 
 
390 aa  97.8  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0723451 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2445  glycosyl transferase group 1  36.84 
 
 
375 aa  97.1  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3891  glycosyl transferase group 1  37.97 
 
 
377 aa  96.7  6e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.14972  normal  0.743624 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  33.92 
 
 
395 aa  96.7  6e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  35.1 
 
 
367 aa  96.3  8e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  36.36 
 
 
426 aa  96.3  9e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  30.73 
 
 
536 aa  96.3  9e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2637  glycosyl transferase, group 1  29.44 
 
 
345 aa  95.1  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1099  glycosyl transferase, group 1  28.67 
 
 
388 aa  94.4  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  29.64 
 
 
386 aa  94.4  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0986  glycosyl transferase group 1  28.43 
 
 
429 aa  93.6  5e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.32714  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5249  glycosyl transferase group 1  37.09 
 
 
386 aa  93.6  5e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5179  glycosyl transferase group 1  30.87 
 
 
378 aa  93.6  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  31.34 
 
 
398 aa  93.2  7e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2126  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.67 
 
 
366 aa  92.8  8e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0783  glycosyl transferase group 1  34.91 
 
 
394 aa  92.8  9e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.492233  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1573  glycosyl transferase group 1  37.14 
 
 
420 aa  92.8  9e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  0.0199703 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5160  glycosyl transferase group 1  34.29 
 
 
800 aa  92.4  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.170469  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0377  glycosyl transferase group 1  34.67 
 
 
404 aa  92.4  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000391271  normal  0.137742 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0526  glycosyl transferase, group 1  31.15 
 
 
363 aa  91.7  2e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.548625  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  34.18 
 
 
419 aa  91.7  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2213  glycosyl transferase group 1  29.77 
 
 
395 aa  91.7  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  33.52 
 
 
390 aa  91.3  3e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  31.4 
 
 
348 aa  91.3  3e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5016  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.55 
 
 
378 aa  90.5  4e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.506111  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4955  glycosyl transferase group 1  35.14 
 
 
405 aa  90.1  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  39.84 
 
 
382 aa  90.1  6e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4512  glycosyl transferase group 1  31.69 
 
 
375 aa  89.7  7e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.115065  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  35.33 
 
 
362 aa  88.6  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  36.48 
 
 
391 aa  89.4  1e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  28.88 
 
 
373 aa  89  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  34.48 
 
 
382 aa  88.2  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3880  glycosyl transferase group 1  33.86 
 
 
455 aa  87.8  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2884  glycosyl transferase group 1  32.07 
 
 
417 aa  88.6  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  37.2 
 
 
383 aa  88.6  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  32.24 
 
 
395 aa  88.6  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  31.72 
 
 
398 aa  88.2  2e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2602  glycosyl transferase, group 1  34 
 
 
812 aa  88.2  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  31.71 
 
 
413 aa  87.8  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02595  glycosyltransferase  26.88 
 
 
382 aa  87.8  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.157205  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1562  glycosyl transferase group 1  31.93 
 
 
381 aa  87.4  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395728  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1682  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.42 
 
 
420 aa  87.4  4e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.961392 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  28.7 
 
 
904 aa  87.4  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5245  glycosyl transferase, group 1  32.69 
 
 
410 aa  87  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.844139 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3107  glycosyl transferase group 1  30.52 
 
 
426 aa  86.7  6e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.47 
 
 
409 aa  86.7  7e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  31.96 
 
 
391 aa  86.3  7e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3572  glycosyl transferase, group 1  28.24 
 
 
389 aa  86.7  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.483254  normal  0.0128829 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0166  glycosyl transferase group 1  35.76 
 
 
374 aa  86.7  7e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  33.13 
 
 
391 aa  86.3  7e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  34.11 
 
 
401 aa  86.3  8e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  32.86 
 
 
419 aa  85.9  9e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1456  glycosyl transferase, group 1  32.02 
 
 
409 aa  86.3  9e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2357  Glycosyltransferase-like protein  29.11 
 
 
408 aa  85.9  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.61542  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1365  glycosyl transferase, group 1  27.93 
 
 
396 aa  85.9  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0275215  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3034  glycosyl transferase, group 1  29.78 
 
 
360 aa  85.9  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1723  glycosyl transferase, group 1  31.4 
 
 
380 aa  85.9  0.000000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.952593  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8230  glycosyl transferase group 1  35.52 
 
 
414 aa  85.5  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00636  hypothetical protein similar to phosphatidylinositol:UDP-GlcNAc transferase PIG-A (Broad)  27.52 
 
 
488 aa  85.1  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0909226  normal  0.40959 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0604  glycosyl transferase group 1  31.92 
 
 
819 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3120  glycosyl transferase, group 1  30.81 
 
 
366 aa  84.7  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0017817  unclonable  0.0000176244 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  31.66 
 
 
392 aa  85.1  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  35.15 
 
 
415 aa  85.1  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0470  glycosyl transferase group 1  29.26 
 
 
456 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1304  group 1 glycosyl transferase  34.48 
 
 
388 aa  84.7  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0596732  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3591  glycosyl transferase group 1  33.17 
 
 
416 aa  84.7  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1784  glycosyltransferase  29.52 
 
 
401 aa  84.3  0.000000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3236  glycosyl transferase group 1  29.91 
 
 
374 aa  84.3  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0188616  hitchhiker  0.000126621 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0080  glycosyl transferase group 1  37.79 
 
 
404 aa  84.7  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2765  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.75 
 
 
365 aa  84.3  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.367187  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1002  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.5 
 
 
405 aa  84  0.000000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00183695  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  34.18 
 
 
391 aa  84  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0430  glycosyl transferase group 1  30.89 
 
 
379 aa  83.6  0.000000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0131441  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1114  glycosyltransferase (group I)  30.58 
 
 
404 aa  83.2  0.000000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3953  glycosyl transferase group 1  34.15 
 
 
374 aa  83.2  0.000000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.32029  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2869  glycosyl transferase, group 1  36.94 
 
 
816 aa  83.2  0.000000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.541026 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2958  glycosyl transferase group 1  29.65 
 
 
366 aa  83.2  0.000000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.298871  hitchhiker  0.000213048 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1905  glycosyltransferase  35.38 
 
 
402 aa  83.2  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2034  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.31 
 
 
385 aa  83.2  0.000000000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2376  glycosyl transferase group 1  31.31 
 
 
372 aa  82.8  0.000000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1062  glycosyl transferase group 1  31.1 
 
 
400 aa  82.8  0.000000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3146  glycosyl transferase group 1  31.94 
 
 
384 aa  82.8  0.000000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.833609  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1973  glycosyl transferase, group 1  31.34 
 
 
416 aa  82.4  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>