157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0830 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_0830  AzlC family protein  100 
 
 
287 aa  567  1e-161  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4054  AzlC family protein  78.5 
 
 
249 aa  323  2e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.557844  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3399  AzlC family protein  78.5 
 
 
249 aa  322  3e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.780663  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4691  AzlC family protein  65.82 
 
 
288 aa  288  1e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4080  AzlC family protein  68.4 
 
 
252 aa  253  3e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0287  hypothetical protein  59.58 
 
 
267 aa  248  7e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.475037  normal  0.0161119 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0353  AzlC family protein  55.51 
 
 
259 aa  214  1.9999999999999998e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.16576 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0497  AzlC-like protein  45.02 
 
 
266 aa  199  5e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.896063  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0563  AzlC-like  48.02 
 
 
276 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.973282  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4637  AzlC-like  52.46 
 
 
255 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.621968  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3876  AzlC family protein  53.1 
 
 
249 aa  187  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0568  hypothetical protein  46.4 
 
 
265 aa  186  3e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2019  AzlC-like  46.19 
 
 
272 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2630  AzlC family protein  46.19 
 
 
272 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.805391  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0668  AzlC family protein  47.53 
 
 
251 aa  181  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.69294 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2659  AzlC family protein  47.53 
 
 
251 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.334456  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5110  AzlC family protein  49.79 
 
 
246 aa  180  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0256895  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2677  AzlC family protein  47.53 
 
 
251 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.820347  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2550  AzlC family protein  47.98 
 
 
251 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.121866  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0457  AzlC family protein  46.22 
 
 
251 aa  179  7e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.279448 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0488  AzlC family protein  44.92 
 
 
264 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.116445  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0687  branched chain amino acid efflux pump LivE  44.92 
 
 
248 aa  171  9e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.264369 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0835  AzlC family protein  48.5 
 
 
249 aa  169  5e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.327675  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0993  AzlC family protein  48.5 
 
 
249 aa  169  6e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.486943  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0831  AzlC family protein  48.5 
 
 
249 aa  169  6e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5961  AzlC-like efflux pump  47.98 
 
 
251 aa  167  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0475  AzlC family protein  45.49 
 
 
264 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0661  AzlC family protein  48 
 
 
253 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.428637  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0294  AzlC family protein  48 
 
 
249 aa  166  5e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.871513  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0589  AzlC family protein  48 
 
 
249 aa  166  5e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2422  AzlC family protein  48 
 
 
249 aa  166  5e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0035  AzlC family protein  48 
 
 
249 aa  166  5e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1274  AzlC family protein  41.59 
 
 
241 aa  164  1.0000000000000001e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3279  AzlC family protein  46.77 
 
 
248 aa  155  6e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.981424  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3535  AzlC family protein  36.45 
 
 
234 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.485711  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1381  AzlC family protein  35.09 
 
 
234 aa  122  7e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.690005  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0092  AzlC family protein  33.48 
 
 
228 aa  116  5e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0434  AzlC-like protein  35.14 
 
 
265 aa  106  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.72937  normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0007  AzlC family protein  34.31 
 
 
246 aa  105  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1415  AzlC family protein  31.4 
 
 
240 aa  103  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.430613  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0495  AzlC-like  33.19 
 
 
257 aa  102  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.294752  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3606  AzlC family protein  32.42 
 
 
228 aa  97.8  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3295  AzlC family protein  32.89 
 
 
258 aa  92.4  7e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0404  AzlC family protein  33.48 
 
 
242 aa  90.9  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.54377 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1048  branched chain amino acid efflux pump LivE  32.74 
 
 
253 aa  90.1  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0218893  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4071  AzlC family protein  31.9 
 
 
247 aa  90.1  4e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3971  AzlC family protein  31.51 
 
 
244 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312774  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3757  AzlC-like  31.56 
 
 
242 aa  87.8  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2936  AzlC family protein  32.3 
 
 
253 aa  85.5  8e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000187359  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0389  AzlC family protein  32.61 
 
 
242 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0461  AzlC-like  27.66 
 
 
240 aa  83.2  0.000000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4125  AzlC-like  32.14 
 
 
233 aa  83.2  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3612  AzlC family protein  27.59 
 
 
244 aa  82  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.271764  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0513  hypothetical protein  30.7 
 
 
242 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0568797 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4209  branched chain amino acid efflux pump, AzlCD (extrudes azaleucine)  30.77 
 
 
255 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000558659  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3800  AzlC family protein  29.67 
 
 
244 aa  80.1  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2107  AzlC family protein  27.1 
 
 
244 aa  79  0.00000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000413868 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1962  AzlC family protein  29.02 
 
 
240 aa  79  0.00000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2851  AzlC-like protein  31.98 
 
 
243 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.537039  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2539  branched-chain amino acid transport protein AzlC  27.59 
 
 
250 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0525733  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2207  AzlC family protein  30.16 
 
 
292 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0109045  normal  0.696476 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0617  AzlC-like  30.04 
 
 
280 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.152652  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1096  AzlC family protein  30.57 
 
 
255 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000023066  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0804  AzlC family protein  30.71 
 
 
255 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0112465  normal  0.194655 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0429  AzlC family protein  28.99 
 
 
258 aa  72.8  0.000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.000397006  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1055  AzlC family protein  30.13 
 
 
250 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0170281  normal  0.980601 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3078  AzlC family protein  27.43 
 
 
234 aa  72  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0739  branched chain amino acid efflux pump, large (AzlC) subunit  28.33 
 
 
235 aa  69.3  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2393  AzlC family protein  28.33 
 
 
235 aa  69.3  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1691  AzlC family protein  32.52 
 
 
249 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0039071  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1598  AzlC family protein  29.05 
 
 
242 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.829588  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4092  AzlC family protein  26.96 
 
 
242 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1599  AzlC family protein  30.68 
 
 
241 aa  65.1  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.732241  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1562  branched-chain amino acid transport protein  30.68 
 
 
241 aa  65.1  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1551  branched-chain amino acid transport protein  30.68 
 
 
241 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1722  AzlC family protein  30.68 
 
 
241 aa  65.1  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1241  AzlC-like  28.7 
 
 
240 aa  65.5  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2443  branched-chain amino acid exporter, LIV- E family  30.3 
 
 
246 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.324306 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1459  AzlC family protein  23.63 
 
 
293 aa  65.1  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.878975  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1795  AzlC family protein  31.36 
 
 
241 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1772  AzlC family protein  30.68 
 
 
241 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1741  AzlC family protein  30.11 
 
 
241 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2457  AzlC family protein  25.97 
 
 
235 aa  64.7  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.201604  normal  0.404255 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1850  AzlC family protein  29 
 
 
241 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3602  AzlC family protein  30.77 
 
 
241 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2528  AzlC family protein  22.27 
 
 
255 aa  62.8  0.000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0575  AzlC family protein  26.09 
 
 
237 aa  62.8  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1603  AzlC family protein  22.09 
 
 
238 aa  62  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315939  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2051  branched-chain amino acid transport protein AzlC, putative  28.45 
 
 
230 aa  61.2  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2782  AzlC family protein  21.62 
 
 
285 aa  60.8  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.568271  normal  0.166375 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2694  AzlC family protein  21.89 
 
 
255 aa  61.6  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1025  AzlC family protein  21 
 
 
238 aa  61.2  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0979622  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3237  AzlC family protein  20.23 
 
 
286 aa  60.8  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000344272  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1721  branched-chain amino acid permease (azaleucine resistance)  30 
 
 
235 aa  60.5  0.00000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000124363  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0976  AzlC family protein  29.38 
 
 
257 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000153015  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1561  AzlC family protein  22.18 
 
 
273 aa  60.8  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0311  AzlC family protein  22.09 
 
 
238 aa  60.1  0.00000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1598  AzlC family protein  21.62 
 
 
273 aa  60.1  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.185514  normal  0.410872 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2854  putative branched-chain amino acid transport protein AzlC  23.92 
 
 
242 aa  59.7  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.608526  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0972  AzlC family protein  29.38 
 
 
257 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00116086  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>