118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_0013 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_0013  Carotenoid oxygenase  100 
 
 
468 aa  965  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.768827  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5321  Carotenoid oxygenase  64.22 
 
 
477 aa  644  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0015  Carotenoid oxygenase  100 
 
 
468 aa  965  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2168  retinal pigment epithelial membrane protein  58.01 
 
 
472 aa  563  1e-159  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.123356 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3688  carotenoid oxygenase  55.11 
 
 
485 aa  557  1e-157  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3964  Carotenoid oxygenase  54.21 
 
 
486 aa  510  1e-143  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.99286  normal  0.591573 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5459  Carotenoid oxygenase  34.68 
 
 
514 aa  271  1e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176097  normal  0.349671 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3212  carotenoid oxygenase  34.22 
 
 
489 aa  266  7e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.415925  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1236  retinal pigment epithelial membrane protein  35.51 
 
 
510 aa  261  2e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0229916  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4402  9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase  35.22 
 
 
495 aa  255  1e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000371573 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0196  Beta-carotene 15,15'-dioxygenase  35.81 
 
 
493 aa  255  1e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4340  Carotenoid oxygenase  34.86 
 
 
495 aa  253  4e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0449  Carotenoid oxygenase  33.91 
 
 
491 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4222  Carotenoid oxygenase  32.85 
 
 
501 aa  243  5e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0865656 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03071  retinal pigment epithelial membrane protein  32.99 
 
 
495 aa  231  1e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0221  lignostilbene-alpha,beta-dioxygenase and related enzyme-like  31.67 
 
 
488 aa  231  2e-59  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25111  retinal pigment epithelial membrane protein  32.36 
 
 
507 aa  227  4e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0248  lignostilbene-alpha,beta-dioxygenase and related enzyme-like  31.32 
 
 
489 aa  225  1e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0203  carotenoid oxygenase  31.06 
 
 
464 aa  218  1e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.297924  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2446  twin-arginine translocation pathway signal  32.83 
 
 
517 aa  215  1e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.41259e-07  normal  0.858746 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03601  retinal pigment epithelial membrane protein  30.64 
 
 
497 aa  209  1e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1646  retinal pigment epithelial membrane protein  31.06 
 
 
497 aa  208  2e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3359  carotenoid oxygenase  30.71 
 
 
502 aa  205  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.120702  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03041  retinal pigment epithelial membrane protein  30.02 
 
 
494 aa  204  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03031  retinal pigment epithelial membrane protein  29.81 
 
 
494 aa  203  5e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3417  dioxygenase, putative  30.18 
 
 
509 aa  203  6e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3952  Carotenoid oxygenase  30.36 
 
 
499 aa  200  4e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.273513  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0282  retinal pigment epithelial membrane protein  29.48 
 
 
494 aa  200  4e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0182948  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03131  retinal pigment epithelial membrane protein  29.19 
 
 
495 aa  189  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.608355  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05214  dioxygenase signal peptide protein  29.05 
 
 
520 aa  188  1e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4033  Carotenoid oxygenase  27.21 
 
 
508 aa  187  3e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.804116  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3919  Carotenoid oxygenase  27.21 
 
 
508 aa  187  3e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3944  Carotenoid oxygenase  29.51 
 
 
481 aa  186  8e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0352  Carotenoid oxygenase  30 
 
 
487 aa  184  3e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0359  Carotenoid oxygenase  30.43 
 
 
487 aa  181  4e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.235865  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2047  retinal pigment epithelial membrane protein  29.96 
 
 
765 aa  177  5e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.211058  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2656  carotenoid oxygenase  28.63 
 
 
477 aa  175  2e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0935  Carotenoid oxygenase  29.36 
 
 
488 aa  167  3e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.934106 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4841  Carotenoid oxygenase  29.65 
 
 
464 aa  163  5e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.659326 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2824  carotenoid oxygenase  28.63 
 
 
504 aa  162  2e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0441  carotenoid oxygenase  26.65 
 
 
460 aa  160  6e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.786971  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3710  retinal pigment epithelial membrane protein  28.73 
 
 
463 aa  159  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1535  9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase  28.38 
 
 
483 aa  157  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.194369  normal  0.146884 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5235  carotenoid oxygenase  30.02 
 
 
451 aa  157  4e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.751022 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1536  carotenoid oxygenase  27.74 
 
 
467 aa  155  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0771367  normal  0.379655 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4867  carotenoid oxygenase  29.8 
 
 
451 aa  154  3e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1216  carotenoid oxygenase  26.33 
 
 
467 aa  154  3e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.548821 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4956  carotenoid oxygenase  29.8 
 
 
451 aa  154  3e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3052  carotenoid oxygenase  27.31 
 
 
515 aa  154  4e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28795  predicted protein  26.17 
 
 
556 aa  152  1e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.813535  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5477  putative carotenoid oxygenase  25.61 
 
 
467 aa  151  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5460  carotenoid oxygenase  28.86 
 
 
459 aa  150  4e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.645484 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1401  Carotenoid oxygenase  25.33 
 
 
467 aa  150  6e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1317  carotenoid oxygenase  25.22 
 
 
467 aa  146  6e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1244  carotenoid oxygenase  24.28 
 
 
556 aa  147  6e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0442261  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1288  carotenoid oxygenase  24.57 
 
 
554 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.528505  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1322  carotenoid oxygenase  24.52 
 
 
556 aa  146  1e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00487019 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3794  carotenoid oxygenase  29.45 
 
 
464 aa  144  4e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0662225  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48408  predicted protein  27.4 
 
 
577 aa  142  1e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1036  lignostilbene-alpha,beta-dioxygenase  25.21 
 
 
470 aa  141  2e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5644  carotenoid oxygenase  26.32 
 
 
478 aa  141  2e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.427984 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4862  Beta-carotene 15,15'-monooxygenase  26.78 
 
 
470 aa  139  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.169022  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1332  carotenoid oxygenase  27.81 
 
 
444 aa  137  5e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.447717 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5950  crocetin dialdehyde  25.77 
 
 
488 aa  137  5e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.444357  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3399  retinal pigment epithelial membrane protein  28.57 
 
 
443 aa  136  8e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.452417  normal  0.802561 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3066  Carotenoid oxygenase  30.07 
 
 
558 aa  135  1e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.061004  hitchhiker  1.32751e-08 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0091  Carotenoid oxygenase  24.5 
 
 
477 aa  135  1e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.848261  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0611  carotenoid oxygenase  25.9 
 
 
481 aa  134  3e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.951978 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5723  9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase  25.39 
 
 
441 aa  133  8e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00560936  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1233  putative carotenoid 9,10-9',10' cleavage dioxygenase  27.95 
 
 
443 aa  132  1e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0130033  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3058  carotenoid 9,10-9',10' cleavage dioxygenase, putative  27.95 
 
 
443 aa  132  1e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1562  putative dioxygenase  27.95 
 
 
443 aa  132  1e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1459  putative carotenoid 9,10-9',10' cleavage dioxygenase  27.95 
 
 
443 aa  132  1e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0635  putative carotenoid 9,10-9',10' cleavage dioxygenase  27.95 
 
 
443 aa  132  1e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.617766  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0518  putative carotenoid 9,10-9',10' cleavage dioxygenase  27.95 
 
 
443 aa  132  1e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.615695  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_3050  predicted protein  26.58 
 
 
467 aa  132  2e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.601284  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30717  predicted protein  24.69 
 
 
533 aa  132  2e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.990452 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2111  carotenoid oxygenase  25.69 
 
 
480 aa  129  1e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.457029 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1428  putative carotenoid 9,10-9',10' cleavage dioxygenase  27.73 
 
 
443 aa  129  1e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0219  carotenoid oxygenase  27.47 
 
 
445 aa  128  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0227  carotenoid oxygenase  27.25 
 
 
445 aa  126  9e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  2.05038e-06 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0300  carotenoid oxygenase  27.75 
 
 
445 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.473918  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2806  carotenoid oxygenase  27.75 
 
 
445 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.561211  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4083  Carotenoid oxygenase  25 
 
 
472 aa  125  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2946  9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase  26.39 
 
 
473 aa  124  3e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000652034  hitchhiker  0.000168571 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43490  predicted protein  25.78 
 
 
630 aa  124  4e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.416955  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0281  carotenoid oxygenase  27.53 
 
 
445 aa  123  7e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.772775  hitchhiker  0.000581153 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01643  lignostilbene dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G01500)  26.42 
 
 
480 aa  117  3e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.600702  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6035  carotenoid oxygenase  25.5 
 
 
479 aa  117  5e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.96012  normal  0.0939223 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3269  9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase  24.78 
 
 
419 aa  115  2e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4595  carotenoid oxygenase  23.25 
 
 
479 aa  112  1e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_48352  predicted protein  24.95 
 
 
551 aa  112  1e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1698  carotenoid oxygenase  24.13 
 
 
480 aa  112  1e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.459113  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2484  9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase  24.95 
 
 
461 aa  112  2e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.217647  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1008  carotenoid oxygenase  24.62 
 
 
498 aa  111  2e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0158946  normal  0.495511 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119472  Carotenoid dioxygenase plastidic fusion protein, putative  26.32 
 
 
914 aa  110  5e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0452333  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0802  carotenoid oxygenase  23.21 
 
 
494 aa  110  5e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.957651  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3580  carotenoid oxygenase  24.5 
 
 
469 aa  109  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_86865  predicted protein  23.99 
 
 
554 aa  108  3e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.241734 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_4021  predicted protein  40.85 
 
 
163 aa  106  9e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.274127  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>