More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6609 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0388  glycosyl transferase family 51  46.18 
 
 		 740 aa  644    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6609  glycosyl transferase family 51  100 
 
 		 794 aa  1647    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.911258  normal  0.0344936 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0889  glycosyl transferase family protein  41.66 
 
 		 768 aa  585  1.0000000000000001e-165  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0176  glycosyltransferase  42.08 
 
 		 762 aa  582  1e-164  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.368405  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03455  penicillin-binding protein 1A  39.84 
 
 		 773 aa  562  1.0000000000000001e-159  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0981  hypothetical protein  41.84 
 
 		 786 aa  560  1e-158  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.250374 
 
 
-
 
NC_002950  PG0794  penicillin-binding protein 1A, putative  41.13 
 
 		 786 aa  551  1e-155  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1474  glycosyl transferase family 51  39.89 
 
 		 772 aa  547  1e-154  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0249209  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3131  glycosyltransferase  40.48 
 
 		 759 aa  548  1e-154  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.47312  normal  0.698693 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1888  glycosyltransferase  40.67 
 
 		 743 aa  542  1e-153  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0246487 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5029  glycosyl transferase family 51  40.35 
 
 		 765 aa  540  9.999999999999999e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3220  glycosyl transferase family 51  40.16 
 
 		 785 aa  537  1e-151  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259437  normal  0.206704 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1305  glycosyl transferase family 51  39.52 
 
 		 767 aa  526  1e-148  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.551332 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4764  glycosyl transferase family 51  38.58 
 
 		 850 aa  503  1e-141  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193555  normal  0.0626376 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1915  glycosyl transferase family 51  38.58 
 
 		 815 aa  502  1e-140  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.70734 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3074  glycosyl transferase family 51  39.08 
 
 		 854 aa  488  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.846458 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1252  glycosyltransferase  36.9 
 
 		 776 aa  481  1e-134  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.314687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0242  penicillin-binding protein, 1A family  38.33 
 
 		 730 aa  455  1.0000000000000001e-126  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000113999  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1945  penicillin-binding protein 1A  39.48 
 
 		 752 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.419198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0590  penicillin-binding protein 1A  37.86 
 
 		 762 aa  444  1e-123  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0274  penicillin-binding protein, 1A family  37.52 
 
 		 783 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0301  1A family penicillin-binding protein  37.73 
 
 		 760 aa  439  9.999999999999999e-123  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1120  glycosyl transferase family 51  36.64 
 
 		 907 aa  438  1e-121  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2643  penicillin-binding protein, 1A family  37.1 
 
 		 755 aa  435  1e-120  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0316  penicillin-binding protein, 1A family  37.11 
 
 		 750 aa  433  1e-120  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.223118 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0343  penicillin-binding protein, 1A family  36.29 
 
 		 774 aa  431  1e-119  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.314658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2061  glycosyl transferase family protein  35.99 
 
 		 810 aa  420  1e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2197  putative penicillin-binding 1 (peptidoglycansynthetase) transmembrane protein, MrcA  35.83 
 
 		 838 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.633683  decreased coverage  0.00350534 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3455  peptidoglycan glycosyltransferase  36.64 
 
 		 787 aa  410  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.19889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0392  peptidoglycan glycosyltransferase  36.2 
 
 		 742 aa  412  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.431383 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4875  peptidoglycan glycosyltransferase  35.54 
 
 		 850 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1659  peptidoglycan glycosyltransferase  35.59 
 
 		 862 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0514214  normal  0.169753 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4835  peptidoglycan glycosyl transferase  35.81 
 
 		 826 aa  409  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.191037  normal  0.0433282 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3899  peptidoglycan glycosyltransferase  35.64 
 
 		 821 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2013  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.31 
 
 		 834 aa  405  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.155902 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5259  peptidoglycan glycosyltransferase  36.15 
 
 		 743 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.297119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2329  glycosyl transferase family protein  36.24 
 
 		 801 aa  403  1e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.212398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3108  peptidoglycan glycosyltransferase  36.15 
 
 		 743 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5014  peptidoglycan glycosyltransferase  35.92 
 
 		 743 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0205014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4259  peptidoglycan glycosyltransferase  36.39 
 
 		 888 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.990931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5993  peptidoglycan glycosyltransferase  35.5 
 
 		 858 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4006  peptidoglycan glycosyltransferase  35.54 
 
 		 857 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237546  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4244  peptidoglycan glycosyltransferase  35.25 
 
 		 857 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0164258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3770  peptidoglycan glycosyltransferase  35.25 
 
 		 870 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345724  normal  0.277872 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4361  peptidoglycan glycosyltransferase  35.54 
 
 		 857 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.885871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1080  penicillin-binding protein  35.02 
 
 		 844 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.366397  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2346  penicillin-binding protein  35.02 
 
 		 844 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2055  1A family penicillin-binding protein  35.02 
 
 		 839 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.635838  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3113  penicillin-binding protein  35.02 
 
 		 839 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.988566  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1451  penicillin-binding protein  35.02 
 
 		 928 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.49387  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2324  1A family penicillin-binding protein  35.81 
 
 		 787 aa  399  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1363  penicillin-binding protein  35.02 
 
 		 844 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3229  membrane carboxypeptidase/penicillin-binding protein  35.02 
 
 		 844 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.258839  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5146  peptidoglycan glycosyltransferase  36.2 
 
 		 732 aa  393  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.725403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0887  peptidoglycan glycosyltransferase  34.49 
 
 		 841 aa  393  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.24195 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2469  glycosyl transferase family protein  35.66 
 
 		 846 aa  394  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0192266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1674  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.35 
 
 		 846 aa  390  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.339847  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2081  glycosyl transferase family protein  35.49 
 
 		 846 aa  392  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.45351  normal  0.431878 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4618  glycosyl transferase family protein  36.16 
 
 		 728 aa  392  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1773  glycosyl transferase family penicillin-binding protein transpeptidase  35.9 
 
 		 698 aa  379  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.488731  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2676  1A family penicillin-binding protein  29.22 
 
 		 795 aa  314  4.999999999999999e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.21019 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3195  1A family penicillin-binding protein  30.75 
 
 		 773 aa  313  1e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4231  penicillin-binding protein 1A  32.55 
 
 		 748 aa  312  2e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4406  1A family penicillin-binding protein  29.32 
 
 		 818 aa  306  1.0000000000000001e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000928316  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0354  penicillin-binding protein 1A  29.72 
 
 		 841 aa  302  2e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.75585  normal  0.103015 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0171  penicillin-binding protein, 1A family  28.71 
 
 		 829 aa  295  2e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000166752 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0189  penicillin-binding protein, 1A family  28.59 
 
 		 827 aa  294  4e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0754  penicillin-binding protein, 1A family  27.41 
 
 		 818 aa  286  1.0000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000281003  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3133  1A family penicillin-binding protein  28.84 
 
 		 796 aa  285  3.0000000000000004e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0754  penicillin-binding protein, 1A family  29.45 
 
 		 796 aa  277  4e-73  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5843  1A family penicillin-binding protein  30.27 
 
 		 808 aa  277  7e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.36925  normal  0.15552 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0324  penicillin-binding protein 1A  28.59 
 
 		 830 aa  275  3e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6049  penicillin-binding protein, 1A family  30.41 
 
 		 805 aa  273  7e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141532  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3949  penicillin-binding protein, 1A family  30.28 
 
 		 805 aa  271  4e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.665129 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0780  penicillin-binding protein 1A  28.81 
 
 		 804 aa  271  5e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2462  penicillin-binding protein 1A  29.69 
 
 		 791 aa  270  5.9999999999999995e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5582  1A family penicillin-binding protein  27.98 
 
 		 824 aa  269  2e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2326  1A family penicillin-binding protein  28.21 
 
 		 807 aa  268  2.9999999999999995e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.774073  unclonable  0.0000291309 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3408  1A family penicillin-binding protein  28.25 
 
 		 766 aa  267  5.999999999999999e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000649652 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4359  1A family penicillin-binding protein  28.4 
 
 		 810 aa  266  8.999999999999999e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  30.98 
 
 		 765 aa  266  1e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2321  1A family penicillin-binding protein  28.46 
 
 		 862 aa  266  1e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.10527  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0698  penicillin-binding protein, 1A family  29.48 
 
 		 779 aa  266  1e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0729  1A family penicillin-binding protein  29.26 
 
 		 794 aa  265  2e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.239456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3662  1A family penicillin-binding protein  29.77 
 
 		 833 aa  265  3e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3955  penicillin-binding protein, 1A family  29.77 
 
 		 805 aa  265  4e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.204833  normal  0.755336 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3274  penicillin-binding protein 1A  28.09 
 
 		 792 aa  264  4e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2754  1A family penicillin-binding protein  28.51 
 
 		 800 aa  264  6e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0201  peptidoglycan glycosyltransferase  28.57 
 
 		 793 aa  263  1e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.558494 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2444  penicillin-binding protein 1A  28.25 
 
 		 830 aa  263  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.257563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4090  1A family penicillin-binding protein  26.16 
 
 		 844 aa  261  3e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0324  penicillin-binding protein, 1A family  27.98 
 
 		 802 aa  261  3e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1716  penicillin-binding protein 1A  27.21 
 
 		 831 aa  261  4e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0706575  normal  0.372111 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0280  penicillin-binding protein 1A  25.94 
 
 		 839 aa  261  5.0000000000000005e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0241  1A family penicillin-binding protein  25.82 
 
 		 839 aa  260  7e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0803  penicillin-binding protein, 1A  27.6 
 
 		 823 aa  260  7e-68  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3704  1A family penicillin-binding protein  25.7 
 
 		 839 aa  259  9e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.2288  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3136  penicillin-binding protein 1A  27.62 
 
 		 791 aa  259  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0934  1A family penicillin-binding protein  28.95 
 
 		 803 aa  259  1e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.305447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0671  1A family penicillin-binding protein  27.76 
 
 		 805 aa  259  1e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.152404 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>