250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3781 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0480  cytochrome c assembly protein  35.05 
 
 
1045 aa  649    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.379709  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2951  cytochrome c assembly protein  34.83 
 
 
1074 aa  655    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.693523  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3781  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  100 
 
 
1054 aa  2169    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000633001  normal  0.0119892 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09813  hypothetical protein  35.65 
 
 
1054 aa  644    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0916  cytochrome c assembly protein  34.12 
 
 
1041 aa  612  9.999999999999999e-175  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.307598  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0404  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  34.08 
 
 
1024 aa  595  1e-168  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1116  cytochrome c biogenesis protein, CcmF/CycK/CcsA family  33.15 
 
 
1076 aa  581  1e-164  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1335  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  34.6 
 
 
1017 aa  581  1e-164  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.927141  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0197  outer membrane lipoprotein MapA  33.11 
 
 
1027 aa  561  1e-158  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1461  cytochrome C assembly protein  34.97 
 
 
1031 aa  557  1e-157  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1760  cytochrome c assembly protein  39.32 
 
 
889 aa  513  1e-144  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.790958  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1157  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  38.77 
 
 
1081 aa  493  9.999999999999999e-139  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1032  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  38.9 
 
 
1081 aa  493  9.999999999999999e-139  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0775  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  38.38 
 
 
1081 aa  486  1e-135  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.239289  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0066  cytochrome c biogenesis protein  39.11 
 
 
901 aa  481  1e-134  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0708  cytochrome c assembly protein  37.59 
 
 
791 aa  466  9.999999999999999e-131  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0809  cytochrome c biogenesis protein  35.38 
 
 
899 aa  456  1.0000000000000001e-126  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.747072  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0699  cytochrome c assembly protein  38.21 
 
 
898 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00244296  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1875  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  34.8 
 
 
873 aa  399  1e-109  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0577395  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2194  cytochrome c assembly protein  29.94 
 
 
749 aa  217  8e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0128686  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1754  cytochrome c assembly protein  29.55 
 
 
748 aa  213  1e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.133127  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1683  cytochrome c assembly protein  28.73 
 
 
760 aa  201  5e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.00910499  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2747  cytochrome c assembly protein  27.5 
 
 
782 aa  196  1e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.250515  normal  0.330673 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0695  cytochrome c assembly protein  37.24 
 
 
283 aa  144  9e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00968755  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0023  cytochrome c assembly protein  24.97 
 
 
1211 aa  142  1.9999999999999998e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.182494  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1103  cytochrome c assembly protein  36.76 
 
 
278 aa  135  5e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0208072  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1231  heme transporter  36.8 
 
 
304 aa  135  5e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.892503  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3481  cytochrome c assembly protein  37.25 
 
 
396 aa  134  7.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0171  putative heme transporter  36.12 
 
 
315 aa  134  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3034  cytochrome c assembly family protein  36.84 
 
 
396 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0301  cytochrome c assembly protein  37.25 
 
 
396 aa  134  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.816512  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0283  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  37.25 
 
 
396 aa  134  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.19464  normal  0.962379 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0310  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  37.25 
 
 
396 aa  134  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.269517 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0361  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  36.84 
 
 
396 aa  133  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.342475  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2597  cytochrome c assembly family protein  36.84 
 
 
396 aa  133  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3741  cytochrome c assembly family protein  36.84 
 
 
408 aa  133  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124691  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3512  cytochrome C assembly protein  36.84 
 
 
396 aa  133  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2725  cytochrome c assembly protein  36.84 
 
 
396 aa  133  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0382  cytochrome c assembly protein  36.84 
 
 
396 aa  133  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3135  cytochrome C assembly protein  36.84 
 
 
396 aa  133  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08031  putative heme transporter  35.98 
 
 
315 aa  133  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.966125 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1958  cytochrome C assembly protein  36.84 
 
 
396 aa  133  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.32068  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3712  cytochrome C assembly protein  36.84 
 
 
396 aa  133  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3770  cytochrome C assembly protein  36.84 
 
 
396 aa  133  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1528  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  35.18 
 
 
394 aa  132  4.0000000000000003e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.890342  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0185  putative transmembrane cytochrome C-type biogenesis transmembrane protein  34.01 
 
 
379 aa  130  2.0000000000000002e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.107492  normal  0.161414 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0234  cytochrome c assembly protein  35.37 
 
 
381 aa  130  2.0000000000000002e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0348  cytochrome c assembly protein  36.59 
 
 
403 aa  130  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00374335 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3609  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  36.18 
 
 
401 aa  129  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.122456  hitchhiker  0.00000004022 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2805  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  36.65 
 
 
405 aa  128  5e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3841  cytochrome c assembly protein  37.5 
 
 
282 aa  128  7e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000353743  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1248  heme transporter  37.22 
 
 
304 aa  128  7e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.771877  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2200  cytochrome c assembly protein  35.54 
 
 
276 aa  127  8.000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.418476 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08251  putative heme transporter  35.56 
 
 
309 aa  127  9e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.379611  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08271  putative heme transporter  35.56 
 
 
309 aa  126  2e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.958198  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4515  cytochrome c assembly protein  36.13 
 
 
330 aa  125  3e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00609835 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2900  cytochrome c assembly protein  35.08 
 
 
284 aa  125  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000276179  normal  0.563922 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2514  cytochrome c assembly protein  38.11 
 
 
284 aa  125  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000017273  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3263  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  34.78 
 
 
395 aa  125  4e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147783  normal  0.312102 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2071  cytochrome c assembly protein  25.54 
 
 
883 aa  125  4e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.183227 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4095  cytochrome c assembly protein  35.02 
 
 
325 aa  124  7e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.16923  normal  0.451277 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3145  cytochrome c assembly protein  34 
 
 
401 aa  124  8e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0773  putative heme transporter  34.15 
 
 
309 aa  124  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.694231  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3282  cytochrome c assembly protein  34.8 
 
 
407 aa  124  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2587  cytochrome c assembly protein  36.47 
 
 
284 aa  124  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.192397  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3519  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  35.52 
 
 
282 aa  124  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00186818 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2985  putative transmembrane cytochrome C-type biogenesis transmembrane protein  34.65 
 
 
395 aa  123  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3453  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  36.36 
 
 
282 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0684308  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6712  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  34.45 
 
 
321 aa  123  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2756  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  35.74 
 
 
283 aa  123  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00415775  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2916  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  34.65 
 
 
395 aa  123  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.652315  hitchhiker  0.00362581 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0614  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  35.66 
 
 
283 aa  122  3.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0547  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  34.55 
 
 
282 aa  122  4.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16811  putative heme transporter  34.65 
 
 
318 aa  121  6e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.89752 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2228  ABC-type transport system, permease component  34.51 
 
 
285 aa  120  9e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.062571  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2701  CcsB  34.88 
 
 
329 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.223788  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4406  cytochrome c assembly protein  33.56 
 
 
645 aa  120  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.220802  normal  0.265917 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0703  cytochrome c assembly protein  31.38 
 
 
283 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0272  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  36.48 
 
 
323 aa  119  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.480455  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09971  putative heme transporter  35.96 
 
 
311 aa  119  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.671585  normal  0.218138 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3357  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  34.8 
 
 
284 aa  119  3.9999999999999997e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000743711  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3232  cytochrome c assembly protein  33.92 
 
 
271 aa  118  6e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00268584  normal  0.260264 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2821  cytochrome c assembly protein  28.4 
 
 
651 aa  118  6e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.846936  hitchhiker  0.00990009 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0513  cytochrome c assembly protein  33.21 
 
 
397 aa  118  6.9999999999999995e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.525112  normal  0.322787 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2168  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  35.43 
 
 
405 aa  117  7.999999999999999e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2200  cytochrome c assembly protein  32.92 
 
 
327 aa  117  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1049  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.72 
 
 
310 aa  116  2.0000000000000002e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000143982  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0692  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.52 
 
 
330 aa  116  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0232519  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5011  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  33.48 
 
 
330 aa  117  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0511  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis permease component-like  33.68 
 
 
325 aa  115  4.0000000000000004e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0049  cytochrome c assembly protein  34.3 
 
 
391 aa  115  5e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00321304  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2995  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.52 
 
 
328 aa  115  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2103  cytochrome c assembly protein  31.14 
 
 
605 aa  115  6e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.387061  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08181  putative heme transporter  33.47 
 
 
312 aa  115  6e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0824  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.4 
 
 
357 aa  114  8.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.341691  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02970  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  34.7 
 
 
333 aa  114  9e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2588  cytochrome c assembly protein  31.88 
 
 
616 aa  113  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.463531  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1773  cytochrome c assembly protein  30.84 
 
 
605 aa  113  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.00408104  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3702  cytochrome c assembly protein  29.72 
 
 
326 aa  113  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0575  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis permease component-like protein  32.87 
 
 
320 aa  113  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>