More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1966 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1966  lipoyl synthase  100 
 
 		 304 aa  636    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000000953811  normal  0.439511 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0513  lipoyl synthase  72.3 
 
 		 292 aa  437  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.170423  normal  0.0962099 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0446  lipoic acid synthetase  70.77 
 
 		 302 aa  422  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3189  lipoyl synthase  69.4 
 
 		 290 aa  413  1e-114  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.411626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0227  lipoyl synthase  68.12 
 
 		 288 aa  407  1.0000000000000001e-112  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.336471  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1779  lipoyl synthase  64.87 
 
 		 299 aa  402  1e-111  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07861  lipoyl synthase  66.3 
 
 		 290 aa  399  9.999999999999999e-111  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3202  lipoyl synthase  66.32 
 
 		 292 aa  393  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2195  lipoic acid synthetase  58.64 
 
 		 328 aa  382  1e-105  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2080  lipoyl synthase  57.3 
 
 		 298 aa  345  5e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111304  normal  0.264728 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2906  lipoyl synthase  53.15 
 
 		 298 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3051  lipoyl synthase  52.45 
 
 		 298 aa  331  1e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1575  lipoyl synthase  53.24 
 
 		 290 aa  325  8.000000000000001e-88  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00830336  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2548  lipoyl synthase  52.46 
 
 		 321 aa  323  2e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4796  lipoyl synthase  51.24 
 
 		 298 aa  319  3e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000356063  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0124  lipoyl synthase  50.88 
 
 		 298 aa  319  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00208739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3568  lipoyl synthase  51.59 
 
 		 298 aa  319  3.9999999999999996e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1757  lipoyl synthase  53.07 
 
 		 308 aa  317  1e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.43043  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5109  lipoyl synthase  50.88 
 
 		 298 aa  317  1e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4840  lipoyl synthase  50.88 
 
 		 298 aa  317  1e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000478803  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4682  lipoyl synthase  50.88 
 
 		 298 aa  317  1e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000492626  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4698  lipoyl synthase  50.88 
 
 		 298 aa  317  1e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000012904  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5116  lipoyl synthase  50.88 
 
 		 298 aa  317  1e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5205  lipoyl synthase  50.88 
 
 		 298 aa  317  1e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.745622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5076  lipoyl synthase  50.88 
 
 		 298 aa  317  1e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5114  lipoyl synthase  50.88 
 
 		 298 aa  317  1e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000010765  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3704  lipoic acid synthetase  50.35 
 
 		 321 aa  315  5e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.442827  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_002950  PG0504  lipoyl synthase  51.96 
 
 		 282 aa  314  9.999999999999999e-85  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.354667 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1068  lipoyl synthase  50.71 
 
 		 300 aa  308  9e-83  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.595  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4675  lipoyl synthase  48.98 
 
 		 338 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4800  lipoyl synthase  48.98 
 
 		 338 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.269387 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0621  lipoyl synthase  48.98 
 
 		 338 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4853  lipoyl synthase  48.98 
 
 		 338 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2629  lipoyl synthase  50.69 
 
 		 324 aa  306  3e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1586  lipoyl synthase  51.23 
 
 		 331 aa  306  3e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.426522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4358  lipoyl synthase  49.15 
 
 		 335 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.383654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4963  lipoyl synthase  49.48 
 
 		 340 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1966  lipoic acid synthetase  49.48 
 
 		 318 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0096  lipoic acid synthetase  49.1 
 
 		 303 aa  301  7.000000000000001e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2833  lipoic acid synthetase  49.1 
 
 		 303 aa  301  7.000000000000001e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4818  lipoic acid synthetase  49.15 
 
 		 318 aa  301  8.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0490  lipoyl synthase  50.55 
 
 		 297 aa  299  3e-80  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1113  lipoyl synthase  47.96 
 
 		 323 aa  299  3e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1316  lipoyl synthase  49.82 
 
 		 294 aa  299  3e-80  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4487  lipoyl synthase  48.4 
 
 		 304 aa  299  4e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.748624 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2644  lipoyl synthase  52.59 
 
 		 276 aa  298  5e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12130  lipoyl synthase  47.62 
 
 		 327 aa  298  7e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1092  lipoyl synthase  51.64 
 
 		 312 aa  298  9e-80  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00219878  hitchhiker  0.00000000000266656 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0537  lipoyl synthase  50.91 
 
 		 299 aa  296  3e-79  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.587235  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0942  lipoyl synthase  47.9 
 
 		 305 aa  295  5e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0923  lipoyl synthase  47.9 
 
 		 305 aa  295  5e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.263103  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1436  lipoyl synthase  50.35 
 
 		 325 aa  295  5e-79  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00922055  hitchhiker  0.00000261266 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08460  lipoyl synthase  47.8 
 
 		 325 aa  295  6e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0511  lipoyl synthase  47.55 
 
 		 304 aa  294  1e-78  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2751  lipoyl synthase  50.17 
 
 		 351 aa  294  1e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.237631  normal  0.0114913 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2696  lipoyl synthase  48.79 
 
 		 320 aa  293  2e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0893  lipoyl synthase  46.94 
 
 		 298 aa  293  2e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000403544  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3138  lipoyl synthase  46.15 
 
 		 333 aa  292  4e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.718204  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0701  lipoyl synthase  48.36 
 
 		 291 aa  292  5e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2841  lipoyl synthase  46.39 
 
 		 319 aa  292  6e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.176893  hitchhiker  0.000447826 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1041  lipoyl synthase  49.66 
 
 		 320 aa  292  6e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.456596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1277  lipoyl synthase  49.82 
 
 		 287 aa  292  6e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.112928  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0116  lipoyl synthase  50.35 
 
 		 334 aa  291  1e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1213  lipoyl synthase  51.07 
 
 		 292 aa  290  2e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1742  lipoyl synthase  51.43 
 
 		 328 aa  290  2e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0397139 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0610  lipoyl synthase  49.64 
 
 		 283 aa  289  3e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2036  lipoyl synthase  47.7 
 
 		 282 aa  289  4e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0346  lipoyl synthase  49.82 
 
 		 309 aa  289  4e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0538  lipoyl synthase  51.09 
 
 		 317 aa  289  4e-77  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0149329  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1877  lipoyl synthase  47.23 
 
 		 314 aa  289  4e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.329271  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0315  lipoyl synthase  49.12 
 
 		 314 aa  289  4e-77  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2570  lipoyl synthase  49.32 
 
 		 317 aa  289  5.0000000000000004e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0658558  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2200  lipoyl synthase  49.32 
 
 		 317 aa  289  5.0000000000000004e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.810557  normal  0.0342252 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3093  lipoyl synthase  47.95 
 
 		 324 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0504  lipoyl synthase  47.72 
 
 		 335 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0591731 
 
 
-
 
NC_002978  WD0392  lipoyl synthase  47.54 
 
 		 287 aa  288  6e-77  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1376  lipoyl synthase  48.29 
 
 		 315 aa  288  6e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0242  lipoyl synthase  47.7 
 
 		 332 aa  288  7e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2897  lipoyl synthase  47.37 
 
 		 330 aa  288  7e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2272  lipoyl synthase  47.37 
 
 		 330 aa  288  8e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2887  lipoyl synthase  47.37 
 
 		 330 aa  288  8e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2035  lipoic acid synthetase  48.73 
 
 		 333 aa  287  1e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.616606  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0316  lipoyl synthase  47.22 
 
 		 339 aa  288  1e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0479875  normal  0.0232399 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3288  lipoyl synthase  48.36 
 
 		 333 aa  288  1e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0066599 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0417  lipoyl synthase  47.37 
 
 		 330 aa  287  1e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.297091  normal  0.190566 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4212  lipoyl synthase  47.72 
 
 		 334 aa  288  1e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.740031 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0467  lipoyl synthase  49.1 
 
 		 321 aa  288  1e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00091244  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0110  lipoyl synthase  50.52 
 
 		 322 aa  287  2e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1598  lipoyl synthase  47.22 
 
 		 318 aa  286  2e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1083  lipoyl synthase  49.12 
 
 		 323 aa  287  2e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0217  lipoyl synthase  47.37 
 
 		 334 aa  286  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0293  lipoyl synthase  47.89 
 
 		 326 aa  287  2e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1513  lipoic acid synthetase  47.29 
 
 		 341 aa  287  2e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.647542  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0298  lipoyl synthase  47.89 
 
 		 326 aa  287  2e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00132518 
 
 
-
 
NC_004310  BR1124  lipoyl synthase  48.77 
 
 		 322 aa  286  2.9999999999999996e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0362  lipoyl synthase  48.24 
 
 		 332 aa  286  2.9999999999999996e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.297178 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2799  lipoyl synthase  47.37 
 
 		 330 aa  286  4e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0788526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2937  lipoyl synthase  47.37 
 
 		 330 aa  286  4e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0184  lipoyl synthase  45.3 
 
 		 333 aa  286  4e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.336159  normal  0.998847 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0178  lipoyl synthase  45.3 
 
 		 333 aa  285  5e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>