More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3607 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3607  peptidase M23B  100 
 
 		 469 aa  958    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0610326  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1048  peptidase M23B  32.84 
 
 		 379 aa  194  2e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.038603  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3063  peptidase M23B  64.62 
 
 		 377 aa  192  7e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000502081  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  29.64 
 
 		 376 aa  172  1e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  30.36 
 
 		 377 aa  170  6e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0286  peptidase M23B  29.44 
 
 		 374 aa  165  2.0000000000000002e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3071  peptidase M23B  27.72 
 
 		 374 aa  162  1e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000167566  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  29.75 
 
 		 375 aa  158  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2905  Peptidase M23  30.28 
 
 		 375 aa  156  7e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202823  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  27.67 
 
 		 379 aa  155  2e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1867  peptidase, M23/M37 family protein  29.43 
 
 		 441 aa  153  5e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0957526  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0734  peptidase M23B  29 
 
 		 373 aa  143  6e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0522246  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  28.17 
 
 		 377 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0247  peptidase M23B  28.57 
 
 		 379 aa  140  4.999999999999999e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000105297  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1788  Peptidase M23  27.55 
 
 		 402 aa  140  7e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1587  peptidase, M23/M37 family protein  28.5 
 
 		 431 aa  139  1e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454077  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  26.55 
 
 		 372 aa  138  2e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  30.05 
 
 		 399 aa  133  5e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  29.48 
 
 		 399 aa  131  3e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  41.14 
 
 		 375 aa  130  7.000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2875  Peptidase M23  37.97 
 
 		 282 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.571881  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2194  Peptidase M23  25.9 
 
 		 412 aa  127  6e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000181252  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5144  peptidase M23  25.46 
 
 		 404 aa  125  1e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  48 
 
 		 309 aa  123  7e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2752  Peptidase M23  48.46 
 
 		 482 aa  123  8e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.76088  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1037  Peptidase M23  27.84 
 
 		 477 aa  122  1.9999999999999998e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.501943  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0183  peptidase M23B  25.45 
 
 		 400 aa  119  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956572  normal  0.0114349 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0855  Fe-S type hydro-lyases tartrate/fumarate alpha region  48.25 
 
 		 310 aa  117  3.9999999999999997e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000487918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2444  peptidase M23B  45.69 
 
 		 318 aa  117  3.9999999999999997e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000108635  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3929  peptidase M23B  29.82 
 
 		 319 aa  117  5e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  43.75 
 
 		 430 aa  117  6e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0717  peptidase M23B  44.36 
 
 		 541 aa  116  7.999999999999999e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0030  Peptidase M23  37.2 
 
 		 445 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0827  peptidase M23B  28.05 
 
 		 327 aa  115  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  31.05 
 
 		 301 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1223  Peptidase M23  40 
 
 		 414 aa  114  5e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  44.26 
 
 		 411 aa  113  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0060  Peptidase M23  42.41 
 
 		 320 aa  113  9e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00481353  hitchhiker  0.00293385 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0417  peptidase M23B  43.97 
 
 		 299 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000018485  hitchhiker  0.000198891 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0778  Peptidase M23  42.65 
 
 		 305 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.266342  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3446  peptidase M23B  43.97 
 
 		 299 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000175079  unclonable  0.00000226335 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4526  peptidase M23B  44.83 
 
 		 299 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000111133  unclonable  0.0000000250462 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2745  putative transmembrane protein  43.44 
 
 		 332 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.170207  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0483  M23/M37 peptidase domain-containing protein  44.26 
 
 		 312 aa  111  3e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0302091  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  40.62 
 
 		 404 aa  111  3e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2106  M24/M37 family peptidase  38.04 
 
 		 328 aa  111  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  41.79 
 
 		 455 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1788  peptidase M23B  41.46 
 
 		 423 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1270  peptidase M23B  29.43 
 
 		 419 aa  110  5e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.339813  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2484  peptidase M23B  44.8 
 
 		 313 aa  110  7.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4732  peptidase M23B  46.96 
 
 		 394 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0130567  normal  0.138326 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5846  peptidase M23B  43.65 
 
 		 415 aa  109  9.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1477  peptidase M23B  40.37 
 
 		 442 aa  109  9.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.707432  normal  0.0152979 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2472  peptidase M23B  45.16 
 
 		 446 aa  109  9.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000997494  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5408  Peptidase M23  44.35 
 
 		 538 aa  109  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0758  Peptidase M23  44.54 
 
 		 290 aa  108  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3187  Peptidase M23  27.79 
 
 		 432 aa  108  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3173  peptidase M23B  41.84 
 
 		 314 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000536198  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5898  Peptidase M23  37.58 
 
 		 332 aa  108  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.941404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2849  peptidase M23B  41.79 
 
 		 455 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.649835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0362  peptidase M23B  42.98 
 
 		 299 aa  108  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000004833  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2565  metalloendopeptidase-like membrane protein  40.8 
 
 		 304 aa  108  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.966222  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0361  peptidase M23B  41.38 
 
 		 299 aa  108  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000166445  unclonable  0.00000779697 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03251  peptidase, M23/M37 family protein  43.97 
 
 		 292 aa  107  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00183313  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2912  peptidase M23B  27.3 
 
 		 330 aa  108  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.471591  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5824  Peptidase M23  39.49 
 
 		 681 aa  108  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1202  Peptidase M23  41.6 
 
 		 367 aa  108  3e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3798  peptidase M23B  39.49 
 
 		 676 aa  107  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.24711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2733  Peptidase M23  42.28 
 
 		 456 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2852  peptidase M23B  45.61 
 
 		 315 aa  107  4e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0621759  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  32.31 
 
 		 524 aa  107  4e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1023  peptidase M23B  40.14 
 
 		 697 aa  107  4e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.490188 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1150  Peptidase M23  40.14 
 
 		 697 aa  107  5e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.812424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0025  peptidase M23B  43.97 
 
 		 402 aa  107  5e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.025775 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4726  M24/M37 family peptidase  48.94 
 
 		 498 aa  107  6e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2159  Peptidase M23  36.14 
 
 		 299 aa  106  9e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.409272  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4836  Peptidase M23  41.22 
 
 		 230 aa  106  9e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000639661  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3804  peptidase M23B  41.38 
 
 		 299 aa  105  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000819764  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4212  M24/M37 family peptidase  42.28 
 
 		 299 aa  105  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3209  Peptidase M23  41.46 
 
 		 392 aa  106  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.626752  normal  0.571204 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0190  Peptidase M23  42.64 
 
 		 582 aa  105  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6051  Peptidase M23  43.9 
 
 		 382 aa  105  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.72546  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2447  peptidase M23B  41.04 
 
 		 459 aa  106  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3563  peptidase M23B  42.28 
 
 		 299 aa  105  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000153251  hitchhiker  0.0000000453788 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0393  peptidase M23B  42.28 
 
 		 299 aa  105  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000111959  unclonable  0.0000262337 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3736  peptidase M23B  42.28 
 
 		 299 aa  105  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000766225  hitchhiker  0.000000231142 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0955  Peptidase M23  39.46 
 
 		 699 aa  106  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2121  Peptidase M23  36.73 
 
 		 262 aa  105  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1671  peptidase M23B  40.65 
 
 		 454 aa  105  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1641  peptidase M23B  44.72 
 
 		 433 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000435092  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3002  Peptidase M23  25.99 
 
 		 448 aa  105  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00185035  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  43.44 
 
 		 452 aa  105  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2398  Peptidase M23  25.23 
 
 		 474 aa  105  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0487248 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2702  Peptidase M23  44.72 
 
 		 433 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000811311  hitchhiker  0.0000822209 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3541  peptidase M23B  42.48 
 
 		 527 aa  105  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59745  normal  0.860043 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1656  peptidase M23B  44.72 
 
 		 433 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000516182  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1678  peptidase M23B  44.72 
 
 		 433 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0411923  normal  0.669465 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0332  peptidase M23B  22.9 
 
 		 434 aa  104  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0795  peptidase M23B  43.7 
 
 		 316 aa  104  3e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.325789  normal  0.244316 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2235  peptidase M23B  43.86 
 
 		 288 aa  104  3e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000416895  normal  0.108975 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>