More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2228 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2228  transcriptional regulator  100 
 
 		 440 aa  902    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000116408  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2409  hypothetical protein  49.89 
 
 		 456 aa  449  1e-125  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0180818  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2599  hypothetical protein  49.89 
 
 		 456 aa  448  1e-125  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.01409e-16 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2363  GntR family transcriptional regulator  49.44 
 
 		 456 aa  443  1e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000127256  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2399  transcriptional regulator  49.11 
 
 		 456 aa  438  9.999999999999999e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.217005  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2329  GntR family transcriptional regulator  49.66 
 
 		 456 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00634643  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2585  hypothetical protein  50 
 
 		 443 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2640  hypothetical protein  48.98 
 
 		 456 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000223055  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2556  hypothetical protein  49.44 
 
 		 456 aa  433  1e-120  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.665943  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2769  hypothetical protein  49.44 
 
 		 456 aa  433  1e-120  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000274332 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1446  transcriptional regulator  47.53 
 
 		 449 aa  429  1e-119  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00281559  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2597  ralimis  49.4 
 
 		 345 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00028619  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0099  GntR family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 415 aa  266  4e-70  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1264  transcriptional regulator  40.55 
 
 		 421 aa  263  3e-69  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0162673  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2689  GntR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 498 aa  199  7e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00169618  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2175  GntR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 477 aa  191  2e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0439  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  25.76 
 
 		 517 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2212  GntR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 468 aa  172  1e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1924  GntR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 468 aa  170  6e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1857  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  26.22 
 
 		 468 aa  168  2e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1208  GntR family transcriptional regulator  23.43 
 
 		 574 aa  156  6e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1952  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  27 
 
 		 465 aa  155  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00720437  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1910  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  26.88 
 
 		 462 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2742  transcriptional regulator, GntR family  24.57 
 
 		 482 aa  152  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.254452  hitchhiker  0.00000487111 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3297  hypothetical protein  25.73 
 
 		 493 aa  152  1e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0920316 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2581  transcriptional regulator, GntR family  24.84 
 
 		 482 aa  151  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0775  GntR family transcriptional regulator with aminotransferase domain  26.51 
 
 		 484 aa  151  3e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.835406  normal  0.904358 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5076  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  24.63 
 
 		 472 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0064  aminotransferase, class I  29.65 
 
 		 397 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2903  GntR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 497 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2627  GntR family transcriptional regulator  24.04 
 
 		 482 aa  147  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0343754  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0222  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  26.04 
 
 		 464 aa  147  3e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2626  transcriptional regulator, GntR family  24.04 
 
 		 482 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000240701 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2434  GntR family transcriptional regulator  24.04 
 
 		 482 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.523883  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2355  GntR family transcriptional regulator  24.04 
 
 		 482 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2609  GntR family transcriptional regulator  24.04 
 
 		 482 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2389  GntR family transcriptional regulator  24.04 
 
 		 477 aa  147  5e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.486375  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2665  transcriptional regulator, GntR family  24.04 
 
 		 482 aa  147  5e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.135654  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2363  GntR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 459 aa  146  6e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3364  transcriptional regulator  23.72 
 
 		 498 aa  146  6e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3935  GntR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 503 aa  146  7.0000000000000006e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.558201  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05334  transcriptional regulator  26.87 
 
 		 470 aa  146  7.0000000000000006e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3202  GntR family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 478 aa  145  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416739 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3694  GntR family transcriptional regulator  22.93 
 
 		 494 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.385244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1972  GntR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 397 aa  145  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3251  transcriptional regulator  23.52 
 
 		 494 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2525  transcriptional regulator  23.98 
 
 		 482 aa  145  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0126099  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1143  GntR family transcriptional regulator  24.51 
 
 		 480 aa  145  2e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.130039  normal  0.465175 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1600  GntR family regulatory protein  23.59 
 
 		 493 aa  144  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1740  GntR family transcriptional regulator  23.09 
 
 		 494 aa  144  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.844969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3373  transcriptional regulator  26.03 
 
 		 484 aa  144  4e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.98747  normal  0.499869 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4100  GntR family transcriptional regulator  23.09 
 
 		 494 aa  144  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.959861  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4266  GntR family transcriptional regulator  23.09 
 
 		 494 aa  144  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.501313  normal  0.325137 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1892  GntR family transcriptional regulator  25.35 
 
 		 477 aa  143  5e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0192  GntR family regulatory protein  22.76 
 
 		 570 aa  142  9e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1682  transcriptional regulator  22.76 
 
 		 493 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0073  putative transcriptional regulator, GntR family  28.3 
 
 		 397 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0068  putative transcriptional regulator, GntR family  26.58 
 
 		 397 aa  141  3e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4167  transcriptional regulator  22.48 
 
 		 509 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.117681  normal  0.924645 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36150  regulatory protein GntR  27.72 
 
 		 472 aa  141  3e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.70939  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000554  transcriptional regulator GntR family/aminotransferase class-i  27.07 
 
 		 481 aa  141  3e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1925  GntR family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 488 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1714  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  22.17 
 
 		 488 aa  140  6e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0550689  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0423  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  23.63 
 
 		 494 aa  139  7e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10910  putative transcriptional regulator, GntR family  26.37 
 
 		 394 aa  139  7e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1933  GntR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 490 aa  139  8.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0494  GntR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 471 aa  139  8.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.416299 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0288  transcriptional regulator  25.65 
 
 		 468 aa  139  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.634833  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4054  putative transcriptional regulator, GntR family  25.5 
 
 		 394 aa  139  1e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03480  GntR family transcriptional regulator  22.61 
 
 		 473 aa  139  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000129974 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1641  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  21.71 
 
 		 488 aa  138  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.119637  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3060  putative transcriptional regulator, GntR family  27.06 
 
 		 464 aa  138  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0347  GntR family transcriptional regulator  24.95 
 
 		 519 aa  138  2e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2769  transcriptional regulator  28.81 
 
 		 463 aa  138  2e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01894  hypothetical protein  24.63 
 
 		 463 aa  137  3.0000000000000003e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2013  GntR family transcriptional regulator  22.63 
 
 		 498 aa  137  4e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0205  transcriptional regulator, GntR family  25.22 
 
 		 463 aa  137  4e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146418 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1659  2-aminoadipate aminotransferase  27.52 
 
 		 399 aa  137  5e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0665896 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1688  GntR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 491 aa  137  5e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.82306  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3750  GntR family transcriptional regulator  23.58 
 
 		 477 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.144993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1450  GntR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 504 aa  136  7.000000000000001e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00080879  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3726  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  25.94 
 
 		 479 aa  136  8e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1028  GntR family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 399 aa  135  9.999999999999999e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000302984 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4510  GntR family transcriptional regulator  23.34 
 
 		 493 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.670433 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2738  transcriptional regulator, GntR family  23.8 
 
 		 477 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000175529  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0493  GntR family transcriptional regulator  25.33 
 
 		 466 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.393759  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0495  GntR family transcriptional regulator  25.33 
 
 		 466 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0044  GntR family transcriptional regulator  22.14 
 
 		 493 aa  135  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3125  GntR family transcriptional regulator  23.3 
 
 		 393 aa  134  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1584  GntR family transcriptional regulator  27.3 
 
 		 393 aa  135  1.9999999999999998e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3347  transcriptional regulator  23.83 
 
 		 500 aa  135  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0073  putative transcriptional regulator, GntR family  22.74 
 
 		 402 aa  134  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2449  transcription regulator GntR  24.63 
 
 		 485 aa  134  3e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000025048  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4240  aminotransferase, class I and II  23.9 
 
 		 406 aa  134  3e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3329  GntR family transcriptional regulator  23.95 
 
 		 515 aa  134  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.895754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2685  transcriptional regulator, GntR family  24.84 
 
 		 477 aa  134  3e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000116915 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2529  GntR family transcriptional regulator  24.42 
 
 		 487 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2153  transcriptional regulator  23.58 
 
 		 502 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0387109 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4344  GntR family transcriptional regulator  25.07 
 
 		 476 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.266344  normal  0.249969 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3504  GntR family transcriptional regulator  23.3 
 
 		 461 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>