More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1264 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_1264  transcriptional regulator  100 
 
 		 421 aa  864    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0162673  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0099  GntR family transcriptional regulator  45.87 
 
 		 415 aa  371  1e-101  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2409  hypothetical protein  42.42 
 
 		 456 aa  281  2e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0180818  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2599  hypothetical protein  42.42 
 
 		 456 aa  280  2e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.01409e-16 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2363  GntR family transcriptional regulator  41.29 
 
 		 456 aa  280  4e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000127256  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2769  hypothetical protein  41.62 
 
 		 456 aa  278  1e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000274332 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2585  hypothetical protein  42.61 
 
 		 443 aa  277  3e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2640  hypothetical protein  40.88 
 
 		 456 aa  276  6e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000223055  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2329  GntR family transcriptional regulator  41.29 
 
 		 456 aa  273  6e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00634643  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2556  hypothetical protein  40.61 
 
 		 456 aa  269  7e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.665943  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2228  transcriptional regulator  40.55 
 
 		 440 aa  263  3e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000116408  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2399  transcriptional regulator  37.66 
 
 		 456 aa  262  8e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.217005  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1446  transcriptional regulator  40 
 
 		 449 aa  251  3e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00281559  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2597  ralimis  43.85 
 
 		 345 aa  209  7e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00028619  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2175  GntR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 477 aa  178  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2689  GntR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 498 aa  160  5e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00169618  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1857  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  28.11 
 
 		 468 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1910  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.27 
 
 		 462 aa  146  7.0000000000000006e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1952  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  28.19 
 
 		 465 aa  145  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00720437  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0439  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  25.3 
 
 		 517 aa  139  7e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0775  GntR family transcriptional regulator with aminotransferase domain  25.55 
 
 		 484 aa  139  1e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.835406  normal  0.904358 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0621  GntR family transcriptional regulator  25.07 
 
 		 547 aa  137  4e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2212  GntR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 468 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1924  GntR family transcriptional regulator  28.84 
 
 		 468 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3364  transcriptional regulator  25.74 
 
 		 498 aa  129  7.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1152  GntR family transcriptional regulator  25.11 
 
 		 492 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2093  GntR family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 473 aa  128  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.132381  normal  0.73636 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0130  GntR family transcriptional regulator  23.38 
 
 		 490 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69750  putative transcriptional regulator  26.42 
 
 		 458 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.477513  normal  0.557474 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2665  transcriptional regulator, GntR family  26.2 
 
 		 482 aa  125  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.135654  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6026  GntR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 461 aa  124  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2627  GntR family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 482 aa  124  4e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0343754  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3297  hypothetical protein  23.13 
 
 		 493 aa  123  5e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0920316 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10910  putative transcriptional regulator, GntR family  31.09 
 
 		 394 aa  123  6e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2611  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  27.13 
 
 		 479 aa  123  7e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.892437  normal  0.704953 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1892  GntR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 477 aa  123  8e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4479  GntR family transcriptional regulator  25 
 
 		 477 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3927  GntR family transcriptional regulator  25 
 
 		 477 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.510298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0910  GntR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 474 aa  121  3e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2434  GntR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 482 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.523883  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1337  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  25.57 
 
 		 487 aa  120  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2355  GntR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 482 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2609  GntR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 482 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2626  transcriptional regulator, GntR family  25.44 
 
 		 482 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000240701 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0403  GntR family transcriptional regulator  23.76 
 
 		 473 aa  120  6e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0790125 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4014  transcriptional regulator  25.07 
 
 		 461 aa  120  6e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.920353  normal  0.229974 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3725  GntR family transcriptional regulator  23.5 
 
 		 481 aa  120  6e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4391  transcriptional regulator  24.76 
 
 		 477 aa  120  6e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.046272 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2389  GntR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 477 aa  119  7e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.486375  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1451  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  24.14 
 
 		 490 aa  120  7e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2793  GntR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 444 aa  119  7e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.102841 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2525  transcriptional regulator  25.93 
 
 		 482 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0126099  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2742  transcriptional regulator, GntR family  26.19 
 
 		 482 aa  119  9e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.254452  hitchhiker  0.00000487111 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0411  aminotransferase  27.3 
 
 		 405 aa  119  9e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.894171  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3795  regulatory protein GntR HTH  26.75 
 
 		 471 aa  119  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1725  GntR family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 483 aa  119  9.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.809338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0591  GntR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 464 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3442  GntR family transcriptional regulator  24.02 
 
 		 481 aa  119  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0677812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3373  transcriptional regulator  25.07 
 
 		 484 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.98747  normal  0.499869 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3842  GntR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 485 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2184  transcriptional regulator, GntR family  24.95 
 
 		 466 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1933  GntR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 490 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3504  GntR family transcriptional regulator  24.8 
 
 		 461 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0494  GntR family transcriptional regulator  24.15 
 
 		 471 aa  118  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.416299 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5809  transcriptional regulator  25.49 
 
 		 477 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4495  GntR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 477 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5076  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  26.8 
 
 		 472 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3874  GntR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 477 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2122  GntR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 473 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1143  GntR family transcriptional regulator  24.54 
 
 		 480 aa  117  3e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.130039  normal  0.465175 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3935  GntR family transcriptional regulator  23.83 
 
 		 503 aa  117  3e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.558201  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1450  GntR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 504 aa  117  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00080879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2454  transcriptional regulator  24.53 
 
 		 481 aa  117  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.201497  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01396  fused predicted DNA-binding transcriptional regulator/predicted amino transferase  26.49 
 
 		 468 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2207  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  26.49 
 
 		 468 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1618  GntR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 468 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3115  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  28.29 
 
 		 485 aa  117  3.9999999999999997e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.77087  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2220  transcriptional regulator  26.49 
 
 		 468 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.94237 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01407  hypothetical protein  26.49 
 
 		 468 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2581  transcriptional regulator, GntR family  25.66 
 
 		 482 aa  117  5e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2769  transcriptional regulator  27.12 
 
 		 463 aa  117  5e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2044  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, classes I and II  26.49 
 
 		 468 aa  117  5e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00402201  hitchhiker  0.0000000000000583102 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003147  GntR-family regulatory protein  26.97 
 
 		 468 aa  117  6e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00323958  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4233  GntR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 498 aa  116  6e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2858  transcriptional regulator  26.63 
 
 		 472 aa  117  6e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.640766 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01894  hypothetical protein  25.65 
 
 		 463 aa  116  8.999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1523  GntR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 468 aa  116  8.999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3750  GntR family transcriptional regulator  24.25 
 
 		 477 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.144993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3915  transcriptional regulator, GntR family  24.55 
 
 		 444 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0753496 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3876  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  23.96 
 
 		 476 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2617  transcriptional regulator, GntR family  24.08 
 
 		 477 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000489907 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3840  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  25.19 
 
 		 499 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36150  regulatory protein GntR  22.68 
 
 		 472 aa  114  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.70939  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2075  transcriptional regulator, GntR family  26.79 
 
 		 471 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1713  aminotransferase, classes I and II superfamily  26.3 
 
 		 474 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1716  aminotransferase, classes I and II superfamily  26.3 
 
 		 474 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1562  aminotransferase, classes I and II superfamily  26.3 
 
 		 474 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0568  GntR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 473 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1735  GntR family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 468 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.453488  hitchhiker  0.0000000000634797 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4020  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  25.58 
 
 		 499 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.703474  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>