More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_2399 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011772  BCG9842_B2769  hypothetical protein  81.58 
 
 
456 aa  766    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000274332 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2409  hypothetical protein  78.51 
 
 
456 aa  740    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0180818  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2363  GntR family transcriptional regulator  79.17 
 
 
456 aa  744    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000127256  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2329  GntR family transcriptional regulator  79.17 
 
 
456 aa  743    Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00634643  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2556  hypothetical protein  81.58 
 
 
456 aa  768    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.665943  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2585  hypothetical protein  78.56 
 
 
443 aa  717    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2599  hypothetical protein  78.73 
 
 
456 aa  742    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.01409e-16 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2640  hypothetical protein  80.04 
 
 
456 aa  753    Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000223055  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2399  transcriptional regulator  100 
 
 
456 aa  928    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.217005  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1446  transcriptional regulator  60.76 
 
 
449 aa  541  1e-153  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00281559  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2597  ralimis  76.23 
 
 
345 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00028619  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2228  transcriptional regulator  49.11 
 
 
440 aa  438  9.999999999999999e-123  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000116408  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0099  GntR family transcriptional regulator  42.31 
 
 
415 aa  266  4e-70  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1264  transcriptional regulator  37.66 
 
 
421 aa  262  8.999999999999999e-69  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0162673  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2175  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 
477 aa  209  8e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2689  GntR family transcriptional regulator  29.11 
 
 
498 aa  195  1e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00169618  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1857  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  29.65 
 
 
468 aa  190  5e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0439  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  25.83 
 
 
517 aa  173  5e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1924  GntR family transcriptional regulator  30.69 
 
 
468 aa  169  8e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2212  GntR family transcriptional regulator  30.2 
 
 
468 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3297  hypothetical protein  24.35 
 
 
493 aa  166  1.0000000000000001e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0920316 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3373  transcriptional regulator  25.84 
 
 
484 aa  160  4e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.98747  normal  0.499869 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2665  transcriptional regulator, GntR family  26.6 
 
 
482 aa  159  8e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.135654  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2627  GntR family transcriptional regulator  26.6 
 
 
482 aa  158  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0343754  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2434  GntR family transcriptional regulator  26.38 
 
 
482 aa  159  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.523883  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2389  GntR family transcriptional regulator  26.38 
 
 
477 aa  159  1e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.486375  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2355  GntR family transcriptional regulator  26.38 
 
 
482 aa  159  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2609  GntR family transcriptional regulator  26.38 
 
 
482 aa  159  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2626  transcriptional regulator, GntR family  26.38 
 
 
482 aa  159  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000240701 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3364  transcriptional regulator  26.05 
 
 
498 aa  158  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2581  transcriptional regulator, GntR family  26.17 
 
 
482 aa  157  3e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2525  transcriptional regulator  26.38 
 
 
482 aa  157  3e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0126099  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2742  transcriptional regulator, GntR family  26.6 
 
 
482 aa  157  4e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.254452  hitchhiker  0.00000487111 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1143  GntR family transcriptional regulator  24.34 
 
 
480 aa  155  1e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.130039  normal  0.465175 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1910  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  28.57 
 
 
462 aa  155  2e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2708  GntR family transcriptional regulator  29.4 
 
 
477 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0205476  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2738  transcriptional regulator, GntR family  28.87 
 
 
477 aa  152  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000175529  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1952  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  25.11 
 
 
465 aa  150  4e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00720437  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3202  GntR family transcriptional regulator  25.35 
 
 
478 aa  150  5e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00416739 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2685  transcriptional regulator, GntR family  29.13 
 
 
477 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000116915 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10910  putative transcriptional regulator, GntR family  28.53 
 
 
394 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2617  transcriptional regulator, GntR family  28.35 
 
 
477 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000489907 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2449  transcription regulator GntR  28.35 
 
 
485 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000025048  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2419  GntR family transcriptional regulator  28.87 
 
 
478 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.926339  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3329  GntR family transcriptional regulator  24.41 
 
 
515 aa  146  6e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.895754  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1972  GntR family transcriptional regulator  27.88 
 
 
397 aa  146  8.000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1892  GntR family transcriptional regulator  25.27 
 
 
477 aa  145  1e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4344  GntR family transcriptional regulator  24.33 
 
 
476 aa  144  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.266344  normal  0.249969 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1641  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  24.2 
 
 
488 aa  144  3e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.119637  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3694  GntR family transcriptional regulator  23 
 
 
494 aa  144  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.385244  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3251  transcriptional regulator  23.33 
 
 
494 aa  144  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4100  GntR family transcriptional regulator  23.33 
 
 
494 aa  143  5e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.959861  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0347  GntR family transcriptional regulator  24.17 
 
 
519 aa  143  5e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4266  GntR family transcriptional regulator  23.33 
 
 
494 aa  143  5e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.501313  normal  0.325137 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1714  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  24.2 
 
 
488 aa  142  8e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0550689  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0775  GntR family transcriptional regulator with aminotransferase domain  24.74 
 
 
484 aa  142  8e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.835406  normal  0.904358 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1902  aromatic amino acid aminotransferase / 2-aminoadipate aminotransferase  26.22 
 
 
397 aa  142  9.999999999999999e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2693  transcriptional regulator, GntR family  28.73 
 
 
461 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.686412  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1208  GntR family transcriptional regulator  24.01 
 
 
574 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1688  GntR family transcriptional regulator  24.73 
 
 
491 aa  141  3e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.82306  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0356  GntR family transcriptional regulator  23.74 
 
 
520 aa  140  3e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.716166  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0310  GntR family transcriptional regulator  24.87 
 
 
397 aa  140  3.9999999999999997e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000040274  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0621  GntR family transcriptional regulator  22.55 
 
 
547 aa  140  6e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003147  GntR-family regulatory protein  24.05 
 
 
468 aa  140  6e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00323958  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1584  GntR family transcriptional regulator  28.76 
 
 
393 aa  139  7.999999999999999e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01894  hypothetical protein  24.25 
 
 
463 aa  139  7.999999999999999e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1152  GntR family transcriptional regulator  22.93 
 
 
492 aa  139  8.999999999999999e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1600  GntR family regulatory protein  24.42 
 
 
493 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0192  GntR family regulatory protein  23.54 
 
 
570 aa  139  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4479  GntR family transcriptional regulator  20.8 
 
 
477 aa  139  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2903  GntR family transcriptional regulator  23.48 
 
 
497 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3949  GntR family transcriptional regulator  27.49 
 
 
473 aa  138  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.905833  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4167  transcriptional regulator  22.57 
 
 
509 aa  138  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.117681  normal  0.924645 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1682  transcriptional regulator  23.54 
 
 
493 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0760  GntR family transcriptional regulator  23.2 
 
 
490 aa  137  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.996679  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1740  GntR family transcriptional regulator  24.22 
 
 
494 aa  137  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.844969  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1725  GntR family transcriptional regulator  25.78 
 
 
483 aa  137  5e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.809338  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4441  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  23.41 
 
 
490 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.944559 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3935  GntR family transcriptional regulator  24.21 
 
 
503 aa  136  8e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.558201  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0421  GntR family transcriptional regulator  27.82 
 
 
403 aa  136  8e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.493071  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0222  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  24.34 
 
 
464 aa  136  9e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1095  GntR family transcriptional regulator  26.47 
 
 
395 aa  136  9e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.435284  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3105  GntR family transcriptional regulator  24.89 
 
 
501 aa  135  9.999999999999999e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3055  putative transcriptional regulator, GntR family  26.76 
 
 
394 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1659  2-aminoadipate aminotransferase  27.03 
 
 
399 aa  135  9.999999999999999e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0665896 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1853  transcriptional regulator  25.05 
 
 
480 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.406204  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2469  transcriptional regulator  26.77 
 
 
503 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0495293  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03480  GntR family transcriptional regulator  22.41 
 
 
473 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000129974 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0109  putative transcriptional regulator, GntR family  28.32 
 
 
396 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2188  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  26.38 
 
 
483 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0027297 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2847  GntR family transcriptional regulator  26.17 
 
 
480 aa  134  3e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0865  putative transcriptional regulator, GntR family  29.23 
 
 
404 aa  134  3e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000909191  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3062  GntR family transcriptional regulator  26.17 
 
 
480 aa  134  3e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3091  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  26.17 
 
 
480 aa  134  3e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0045104  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2363  GntR family transcriptional regulator  23.11 
 
 
459 aa  134  3e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1334  transcriptional regulator  24.63 
 
 
501 aa  134  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3093  GntR family transcriptional regulator  25.96 
 
 
480 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0883302  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1217  GntR family transcriptional regulator  24.89 
 
 
501 aa  134  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0064  aminotransferase, class I  27.95 
 
 
397 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2781  GntR family transcriptional regulator  26.17 
 
 
480 aa  134  5e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>