More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1446 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1446  transcriptional regulator  100 
 
 		 449 aa  911    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00281559  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2769  hypothetical protein  60.76 
 
 		 456 aa  555  1e-157  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000274332 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2556  hypothetical protein  59.96 
 
 		 456 aa  551  1e-156  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.665943  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2399  transcriptional regulator  60.76 
 
 		 456 aa  551  1e-155  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.217005  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2640  hypothetical protein  60.76 
 
 		 456 aa  550  1e-155  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000223055  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2599  hypothetical protein  59.73 
 
 		 456 aa  547  1e-154  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.01409e-16 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2409  hypothetical protein  59.87 
 
 		 456 aa  543  1e-153  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0180818  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2363  GntR family transcriptional regulator  59.42 
 
 		 456 aa  537  1e-151  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000127256  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2329  GntR family transcriptional regulator  59.64 
 
 		 456 aa  536  1e-151  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00634643  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2585  hypothetical protein  59.72 
 
 		 443 aa  525  1e-148  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2228  transcriptional regulator  47.98 
 
 		 440 aa  431  1e-119  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000116408  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2597  ralimis  59.88 
 
 		 345 aa  411  1e-113  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00028619  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1264  transcriptional regulator  40 
 
 		 421 aa  249  5e-65  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0162673  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0099  GntR family transcriptional regulator  39.4 
 
 		 415 aa  248  1e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2175  GntR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 477 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2689  GntR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 498 aa  197  3e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00169618  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1857  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  29.65 
 
 		 468 aa  180  4e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2525  transcriptional regulator  26.26 
 
 		 482 aa  169  7e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0126099  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0439  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  24.45 
 
 		 517 aa  169  9e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3364  transcriptional regulator  27.83 
 
 		 498 aa  167  4e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2212  GntR family transcriptional regulator  28.6 
 
 		 468 aa  166  5.9999999999999996e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2742  transcriptional regulator, GntR family  25.79 
 
 		 482 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.254452  hitchhiker  0.00000487111 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1924  GntR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 468 aa  165  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2581  transcriptional regulator, GntR family  25.37 
 
 		 482 aa  162  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2627  GntR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 482 aa  162  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0343754  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2434  GntR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 482 aa  161  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.523883  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2389  GntR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 477 aa  162  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.486375  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2355  GntR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 482 aa  161  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2626  transcriptional regulator, GntR family  25.37 
 
 		 482 aa  161  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000240701 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1910  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.09 
 
 		 462 aa  162  2e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2665  transcriptional regulator, GntR family  25.37 
 
 		 482 aa  161  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.135654  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2609  GntR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 482 aa  161  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10910  putative transcriptional regulator, GntR family  29.32 
 
 		 394 aa  158  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3297  hypothetical protein  27.34 
 
 		 493 aa  155  1e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0920316 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3935  GntR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 503 aa  154  4e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.558201  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2769  transcriptional regulator  27.35 
 
 		 463 aa  153  5e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1208  GntR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 574 aa  152  8e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1952  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  26.36 
 
 		 465 aa  150  5e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00720437  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0591  GntR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 464 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0288  transcriptional regulator  25.77 
 
 		 468 aa  148  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.634833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2738  transcriptional regulator, GntR family  28.68 
 
 		 477 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000175529  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3251  transcriptional regulator  22.48 
 
 		 494 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4100  GntR family transcriptional regulator  22.48 
 
 		 494 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.959861  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4266  GntR family transcriptional regulator  22.48 
 
 		 494 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.501313  normal  0.325137 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2449  transcription regulator GntR  29.56 
 
 		 485 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000025048  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1933  GntR family transcriptional regulator  24.68 
 
 		 490 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4510  transcriptional regulator  22.87 
 
 		 489 aa  145  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.111052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0775  GntR family transcriptional regulator with aminotransferase domain  25.16 
 
 		 484 aa  145  2e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.835406  normal  0.904358 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0621  GntR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 547 aa  145  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2685  transcriptional regulator, GntR family  28.42 
 
 		 477 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000116915 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3694  GntR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 494 aa  144  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.385244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1641  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  23.82 
 
 		 488 aa  144  3e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.119637  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000386  transcriptional regulator GntR family  26.15 
 
 		 471 aa  144  3e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.882947  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2419  GntR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 478 aa  144  4e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.926339  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2617  transcriptional regulator, GntR family  28.42 
 
 		 477 aa  144  5e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000489907 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3373  transcriptional regulator  26.8 
 
 		 484 aa  143  5e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.98747  normal  0.499869 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1143  GntR family transcriptional regulator  24.35 
 
 		 480 aa  143  8e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.130039  normal  0.465175 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1714  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  23.56 
 
 		 488 aa  143  8e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0550689  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4441  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  26.65 
 
 		 490 aa  143  8e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.944559 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2708  GntR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 477 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0205476  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0192  GntR family regulatory protein  24.63 
 
 		 570 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1600  GntR family regulatory protein  24.63 
 
 		 493 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1740  GntR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 494 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.844969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01894  hypothetical protein  24.84 
 
 		 463 aa  141  3e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1925  GntR family transcriptional regulator  23.35 
 
 		 488 aa  140  3e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1682  transcriptional regulator  24.69 
 
 		 493 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0865  putative transcriptional regulator, GntR family  31.93 
 
 		 404 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000909191  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2693  transcriptional regulator, GntR family  29.02 
 
 		 461 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.686412  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0347  GntR family transcriptional regulator  24.06 
 
 		 519 aa  140  6e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3347  transcriptional regulator  24.95 
 
 		 500 aa  139  7.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4136  transcriptional regulator  24.82 
 
 		 515 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.53433  normal  0.112546 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69750  putative transcriptional regulator  27.84 
 
 		 458 aa  139  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.477513  normal  0.557474 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36150  regulatory protein GntR  24.72 
 
 		 472 aa  139  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.70939  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3876  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  29.18 
 
 		 476 aa  138  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3072  GntR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 455 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.536959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0766  GntR family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 383 aa  137  4e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4167  transcriptional regulator  24.62 
 
 		 509 aa  137  4e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.117681  normal  0.924645 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2469  transcriptional regulator  27.76 
 
 		 503 aa  137  5e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0495293  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3611  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  24.32 
 
 		 485 aa  137  5e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.444902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0760  GntR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 490 aa  137  5e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.996679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3202  GntR family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 478 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416739 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1659  2-aminoadipate aminotransferase  27.25 
 
 		 399 aa  136  7.000000000000001e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0665896 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3337  transcriptional regulator, GntR family  26 
 
 		 480 aa  136  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.157491  hitchhiker  0.0000000000000475852 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1892  GntR family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 477 aa  136  8e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6026  GntR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 461 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1152  GntR family transcriptional regulator  25.11 
 
 		 492 aa  135  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0415  GntR family transcriptional regulator  21.02 
 
 		 520 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38250  putative transcriptional regulator  26.19 
 
 		 474 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293552 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1450  GntR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 504 aa  135  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00080879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0103  putative transcriptional regulator, GntR family  25 
 
 		 396 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4510  GntR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 493 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.670433 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1240  transcriptional regulator  25.71 
 
 		 478 aa  135  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3253  putative transcriptional regulator  26.72 
 
 		 474 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0471959  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3289  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  23.8 
 
 		 485 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0367  GntR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 473 aa  135  1.9999999999999998e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3314  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  23.63 
 
 		 494 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1805  GntR family transcriptional regulator  21.99 
 
 		 504 aa  134  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1085  GntR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 475 aa  134  3e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.350273 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003147  GntR-family regulatory protein  25.41 
 
 		 468 aa  134  3e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00323958  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1853  transcriptional regulator  24.42 
 
 		 480 aa  134  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.406204  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>