More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1436 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1436  3-dehydroquinate dehydratase  100 
 
 
151 aa  307  2.9999999999999997e-83  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.767902  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1210  3-dehydroquinate dehydratase  83.33 
 
 
151 aa  253  4e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1119  3-dehydroquinate dehydratase  78.91 
 
 
153 aa  243  4.9999999999999997e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1544  3-dehydroquinate dehydratase  74.32 
 
 
166 aa  228  2e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0932  3-dehydroquinate dehydratase  72.79 
 
 
151 aa  219  8e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0784  3-dehydroquinate dehydratase  70.75 
 
 
173 aa  218  1.9999999999999999e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.559355  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1172  3-dehydroquinate dehydratase  68.92 
 
 
162 aa  212  1.9999999999999998e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00149838  normal  0.362195 
 
 
-
 
NC_002950  PG1731  3-dehydroquinate dehydratase  54.01 
 
 
141 aa  151  4e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2703  3-dehydroquinate dehydratase  49.3 
 
 
145 aa  149  1e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0204  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50 
 
 
147 aa  148  3e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0662  3-dehydroquinate dehydratase  55.48 
 
 
147 aa  147  7e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1050  3-dehydroquinate dehydratase  53.1 
 
 
147 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000995076  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1505  3-dehydroquinate dehydratase  47.3 
 
 
159 aa  144  4.0000000000000006e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0744  3-dehydroquinate dehydratase  49.67 
 
 
153 aa  142  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00682582  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0715  3-dehydroquinate dehydratase  49.67 
 
 
153 aa  142  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1823  3-dehydroquinate dehydratase  50.35 
 
 
144 aa  142  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000527848  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0032  3-dehydroquinate dehydratase  53.47 
 
 
149 aa  141  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1538  3-dehydroquinate dehydratase  52.52 
 
 
145 aa  141  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2695  3-dehydroquinate dehydratase, type II  51.37 
 
 
145 aa  140  5e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.800528 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3469  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50.34 
 
 
152 aa  140  6e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.411498 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1733  3-dehydroquinate dehydratase  55 
 
 
161 aa  140  6e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0846239 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0370  3-dehydroquinate dehydratase  47.3 
 
 
159 aa  140  6e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00140278  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1474  3-dehydroquinate dehydratase, type II  51.03 
 
 
152 aa  139  9e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00136549  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2796  3-dehydroquinate dehydratase, type II  47.45 
 
 
138 aa  139  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.396749  normal  0.170402 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0128  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50.36 
 
 
137 aa  138  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.297868  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0230  3-dehydroquinate dehydratase  44.52 
 
 
160 aa  139  1.9999999999999998e-32  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0290  3-dehydroquinate dehydratase, type II  49.32 
 
 
160 aa  137  3e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.347415  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2547  3-dehydroquinate dehydratase, type II  54.29 
 
 
142 aa  138  3e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.758716  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0364  3-dehydroquinate dehydratase  45.95 
 
 
159 aa  137  3.9999999999999997e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0718569  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1732  3-dehydroquinate dehydratase  51.08 
 
 
145 aa  137  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676815  normal  0.0717581 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0063  3-dehydroquinate dehydratase  44.52 
 
 
159 aa  137  6e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0104  3-dehydroquinate dehydratase  44.52 
 
 
159 aa  137  6e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3637  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50.72 
 
 
142 aa  137  7e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1721  3-dehydroquinate dehydratase  47.59 
 
 
145 aa  136  8.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3500  3-dehydroquinate dehydratase  50.34 
 
 
155 aa  135  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.651593 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0849  3-dehydroquinate dehydratase  51.05 
 
 
142 aa  136  1e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00904578  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4272  3-dehydroquinate dehydratase  48.63 
 
 
146 aa  135  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1540  3-dehydroquinate dehydratase  55.47 
 
 
156 aa  135  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0606879 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4329  3-dehydroquinate dehydratase  48.63 
 
 
146 aa  135  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0076  3-dehydroquinate dehydratase  43.84 
 
 
159 aa  135  2e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4219  3-dehydroquinate dehydratase  48.63 
 
 
146 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4103  3-dehydroquinate dehydratase  48.63 
 
 
146 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.478145  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3941  3-dehydroquinate dehydratase  48.63 
 
 
146 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3952  3-dehydroquinate dehydratase  48.63 
 
 
146 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.405359  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1924  3-dehydroquinate dehydratase  51.45 
 
 
142 aa  134  3.0000000000000003e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.132739  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4423  3-dehydroquinate dehydratase  48.63 
 
 
146 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2345  3-dehydroquinate dehydratase, type II  48.92 
 
 
137 aa  135  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.660798  normal  0.653044 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2893  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 
146 aa  134  3.0000000000000003e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0307948  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4052  3-dehydroquinate dehydratase  49.32 
 
 
146 aa  134  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0687  3-dehydroquinate dehydratase  45.21 
 
 
160 aa  134  4e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.715219  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1211  3-dehydroquinate dehydratase, type II  46.26 
 
 
155 aa  134  5e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04491  3-dehydroquinate dehydratase  44.83 
 
 
146 aa  133  6.0000000000000005e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.609687  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4309  3-dehydroquinate dehydratase  48.63 
 
 
146 aa  133  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04381  3-dehydroquinate dehydratase  46.21 
 
 
145 aa  133  7.000000000000001e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0561971  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2190  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50 
 
 
150 aa  133  8e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.369696  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1595  3-dehydroquinate dehydratase, type II  49.65 
 
 
144 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2664  3-dehydroquinate dehydratase  48.61 
 
 
150 aa  132  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1789  3-dehydroquinate dehydratase  50.7 
 
 
145 aa  133  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1003  3-dehydroquinate dehydratase  53.68 
 
 
150 aa  132  1.9999999999999998e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2300  3-dehydroquinate dehydratase  48.63 
 
 
148 aa  132  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.562117  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0981  3-dehydroquinate dehydratase  47.62 
 
 
150 aa  131  3e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00261283  normal  0.0932644 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04071  3-dehydroquinate dehydratase  43.97 
 
 
147 aa  131  3e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04381  3-dehydroquinate dehydratase  43.97 
 
 
147 aa  131  3e-30  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0925  3-dehydroquinate dehydratase  49.29 
 
 
146 aa  130  5e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1028  3-dehydroquinate dehydratase  47.92 
 
 
151 aa  130  6.999999999999999e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3731  3-dehydroquinate dehydratase  49.65 
 
 
157 aa  130  6.999999999999999e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.318206  hitchhiker  0.00144149 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1044  3-dehydroquinate dehydratase  46.31 
 
 
148 aa  129  9e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.983383  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0211  3-dehydroquinate dehydratase  44.9 
 
 
149 aa  129  1.0000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.324309  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2228  3-dehydroquinate dehydratase, type II  48.2 
 
 
149 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2022  3-dehydroquinate dehydratase  47.22 
 
 
150 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1952  3-dehydroquinate dehydratase  44.44 
 
 
154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000216086  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4097  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50 
 
 
165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.517045  normal  0.0424658 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0026  3-dehydroquinate dehydratase  49.34 
 
 
152 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1698  3-dehydroquinate dehydratase, type II  45.83 
 
 
145 aa  128  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06130  3-dehydroquinate dehydratase, type II  42.95 
 
 
148 aa  128  3e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3121  3-dehydroquinate dehydratase, type II  45.65 
 
 
149 aa  127  4.0000000000000003e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15470  3-dehydroquinate dehydratase  49.26 
 
 
143 aa  127  4.0000000000000003e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.363675  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1223  3-dehydroquinate dehydratase  47.22 
 
 
151 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2973  3-dehydroquinate dehydratase  45.11 
 
 
144 aa  127  4.0000000000000003e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.013509  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2657  3-dehydroquinate dehydratase  47.86 
 
 
149 aa  127  4.0000000000000003e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000254633 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11973  3-dehydroquinate dehydratase  43.06 
 
 
144 aa  127  5.0000000000000004e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2207  3-dehydroquinate dehydratase  49.28 
 
 
144 aa  127  6e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.121431  normal  0.285231 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3940  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 
141 aa  127  7.000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000739911  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2097  3-dehydroquinate dehydratase  47.79 
 
 
153 aa  127  7.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1521  3-dehydroquinate dehydratase  42.76 
 
 
148 aa  126  8.000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1306  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 
149 aa  126  8.000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.203754  normal  0.0551942 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5032  3-dehydroquinate dehydratase  48.63 
 
 
151 aa  126  9.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2438  3-dehydroquinate dehydratase type II  48.95 
 
 
146 aa  125  1.0000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0996759  normal  0.483602 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0571  3-dehydroquinate dehydratase  45.21 
 
 
144 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000293441  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1053  3-dehydroquinate dehydratase  44.76 
 
 
147 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000000105156  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3520  3-dehydroquinate dehydratase  46.58 
 
 
145 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000267198  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0189  3-dehydroquinate dehydratase  48.55 
 
 
156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0586  3-dehydroquinate dehydratase  45.21 
 
 
144 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3151  3-dehydroquinate dehydratase  45.19 
 
 
147 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3392  3-dehydroquinate dehydratase  47.48 
 
 
158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1094  3-dehydroquinate dehydratase  46.9 
 
 
191 aa  125  3e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0915  3-dehydroquinate dehydratase  44.83 
 
 
149 aa  125  3e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.249833  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2435  3-dehydroquinate dehydratase, type II  49.28 
 
 
142 aa  125  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.476649 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1588  3-dehydroquinate dehydratase  47.86 
 
 
153 aa  125  3e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0231  3-dehydroquinate dehydratase  42.57 
 
 
149 aa  125  3e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.447722  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>