156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0862 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0862  membrane lipoprotein lipid attachment site  100 
 
 		 256 aa  514  1.0000000000000001e-145  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.349098  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0750  tol-pal system protein YbgF  65.42 
 
 		 255 aa  318  3.9999999999999996e-86  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000117019  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2158  tol-pal system protein YbgF  57.03 
 
 		 262 aa  301  8.000000000000001e-81  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.198251  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0617  hypothetical protein  46.33 
 
 		 267 aa  229  2e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.144875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1912  TPR repeat-containing protein  43.21 
 
 		 287 aa  229  5e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0753  tol-pal system protein YbgF  38.87 
 
 		 258 aa  176  5e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000204373  normal  0.160376 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1709  tol-pal system protein YbgF  34.48 
 
 		 267 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000149068  decreased coverage  0.0000715536 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2208  Tol-Pal system YbgF  29.93 
 
 		 275 aa  109  5e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00178877  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3542  TPR repeat-containing protein  27.99 
 
 		 271 aa  103  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000161801  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0023  TPR domain-containing protein  31.43 
 
 		 278 aa  102  5e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.165753  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3515  tol-pal system protein YbgF  27.56 
 
 		 283 aa  89.4  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000012222  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0757  TPR repeat-containing protein  26.87 
 
 		 264 aa  87.8  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3584  tol-pal system protein YbgF  27.56 
 
 		 283 aa  87.4  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3038  TPR domain-containing protein  25.78 
 
 		 272 aa  85.1  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0201  TPR repeat-containing protein  37.07 
 
 		 275 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000441439  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2973  TPR domain-containing protein  28.85 
 
 		 266 aa  82.8  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.485874  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0826  tol-pal system protein YbgF  25.9 
 
 		 271 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000523116  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0388  tol-pal system protein YbgF  38.94 
 
 		 325 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0022084  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1580  TPR domain-containing protein  33.33 
 
 		 263 aa  76.3  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0635876  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0484  tol-pal system protein YbgF  26.17 
 
 		 318 aa  73.6  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2020  hypothetical protein  29.52 
 
 		 322 aa  72.8  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2025  hypothetical protein  29.46 
 
 		 322 aa  71.6  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1237  TPR repeat-containing protein  23.13 
 
 		 312 aa  69.7  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.638629  normal  0.0592665 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1114  tol-pal system protein YbgF  34.48 
 
 		 292 aa  69.7  0.00000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.875403  normal  0.0458265 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3692  tetratricopeptide domain-containing protein  29.52 
 
 		 239 aa  67  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000893452  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0772  tol-pal system protein YbgF  29.41 
 
 		 285 aa  65.5  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0818446 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0641  tol-pal system protein YbgF  27.72 
 
 		 232 aa  65.5  0.0000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000302592  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0590  TPR repeat-containing protein  34.38 
 
 		 294 aa  63.5  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1158  TPR repeat-containing protein  30.61 
 
 		 257 aa  62.4  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.188926  normal  0.17642 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2084  hypothetical protein  36.46 
 
 		 254 aa  62  0.000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000361839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0500  tol-pal system protein YbgF  29.09 
 
 		 343 aa  61.6  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003911  TPR repeat-containing protein  35.51 
 
 		 250 aa  61.2  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.100041  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1281  tol-pal system protein YbgF  36.46 
 
 		 266 aa  61.2  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000295525  decreased coverage  0.00000450337 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0263  tol-pal system protein YbgF  30.43 
 
 		 333 aa  59.3  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.067735 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4088  TPR repeat-containing protein  34.34 
 
 		 1057 aa  58.5  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.475202  normal  0.216306 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2196  Tol-Pal system YbgF  26.45 
 
 		 262 aa  58.5  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.114347  normal  0.506103 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01613  hypothetical protein  33.64 
 
 		 188 aa  58.2  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2145  TPR domain-containing protein  28.36 
 
 		 335 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0848355  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0301  tol-pal system protein YbgF  26.07 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.658955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2124  Tol-Pal system YbgF  25.26 
 
 		 301 aa  57.8  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.186495  normal  0.327311 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1278  tol-pal system protein YbgF  26.64 
 
 		 229 aa  57  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2893  tol-pal system protein YbgF  31.25 
 
 		 263 aa  56.6  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  7.77215e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0845  tol-pal system protein YbgF  31.25 
 
 		 263 aa  56.6  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000128041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0909  tol-pal system protein YbgF  32.29 
 
 		 262 aa  56.6  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000119726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0786  tol-pal system protein YbgF  32.29 
 
 		 262 aa  56.6  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000180184  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1697  tetratricopeptide domain-containing protein  31.52 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000000538849  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0813  tol-pal system protein YbgF  32.29 
 
 		 262 aa  56.6  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0133975  normal  0.688577 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0877  tol-pal system protein YbgF  32.29 
 
 		 262 aa  56.6  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000691126  normal  0.439363 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0846  tol-pal system protein YbgF  32.29 
 
 		 262 aa  56.6  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00125289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0765  tol-pal system protein YbgF  31.25 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000135641  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00702  hypothetical protein  31.25 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000422433  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0664  tol-pal system protein YbgF  31.25 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000123566  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00691  hypothetical protein  31.25 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000612768  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0796  tol-pal system protein YbgF  31.25 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  5.27837e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0771  tol-pal system protein YbgF  31.25 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000973622  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2913  tol-pal system protein YbgF  31.25 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000329093  normal  0.329929 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2866  tol-pal system protein YbgF  32.29 
 
 		 269 aa  55.8  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.8827e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1399  tol-pal system protein YbgF  32.29 
 
 		 269 aa  55.8  0.0000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000306098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2954  tol-pal system protein YbgF  32.29 
 
 		 269 aa  55.8  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000655346  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1396  tetratricopeptide TPR_2  33.33 
 
 		 261 aa  55.5  0.0000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000108782  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0147  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 257 aa  55.1  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0924  ADP-heptose-LPS heptosyltransferase II  30.07 
 
 		 280 aa  55.1  0.000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.708476  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2562  Tol-Pal system YbgF  31.25 
 
 		 241 aa  54.7  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000429972  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0016  hypothetical protein  30.82 
 
 		 293 aa  54.7  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.436683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3269  tol-pal system protein YbgF  31.13 
 
 		 248 aa  54.3  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00753149  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1859  TPR repeat-containing protein  30.21 
 
 		 242 aa  54.3  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000136736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2366  hypothetical protein  28.12 
 
 		 250 aa  53.5  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000582291  normal  0.169259 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2438  hypothetical protein  28.12 
 
 		 250 aa  53.5  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000167584  normal  0.413869 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0465  TPR repeat-containing protein  29.47 
 
 		 377 aa  53.9  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2529  hypothetical protein  28.12 
 
 		 250 aa  53.5  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000104047  normal  0.0224917 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0965  tol-pal system protein YbgF  26.6 
 
 		 487 aa  53.5  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.666424  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1609  tetratricopeptide domain-containing protein  28.12 
 
 		 249 aa  53.1  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000616267  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2536  tol-pal system protein YbgF  28.12 
 
 		 249 aa  52.8  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000911459  hitchhiker  0.000142623 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2746  hypothetical protein  28.12 
 
 		 250 aa  52.8  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1748  TPR repeat-containing protein  28.12 
 
 		 249 aa  52.8  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000756054  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1744  Tol-Pal system YbgF  28.12 
 
 		 249 aa  52.8  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000201827  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1787  tol-pal system protein YbgF  28.12 
 
 		 249 aa  52.8  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000124758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2729  tol-pal system protein YbgF  30.21 
 
 		 243 aa  52.4  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000699161  hitchhiker  0.0000235132 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2227  hypothetical protein  31.25 
 
 		 265 aa  51.6  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0729  TPR repeat-containing protein  30.21 
 
 		 255 aa  51.6  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.032974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1240  tol-pal system protein YbgF  26.23 
 
 		 264 aa  52  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000229086  normal  0.061063 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0737  hypothetical protein  24.64 
 
 		 274 aa  50.4  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.790435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0675  hypothetical protein  24.23 
 
 		 249 aa  50.4  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0840445  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2589  tol-pal system protein YbgF  24.36 
 
 		 249 aa  50.4  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1427  hypothetical protein  30.69 
 
 		 254 aa  50.1  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610917  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4051  hypothetical protein  23.7 
 
 		 243 aa  49.7  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0692  tol-pal system protein YbgF  22.97 
 
 		 249 aa  49.7  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000467208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1855  tetratricopeptide TPR_2  31.18 
 
 		 254 aa  49.3  0.00006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2673  TPR repeat-containing protein  23.33 
 
 		 252 aa  49.3  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00423772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0686  tol-pal system protein YbgF  23.19 
 
 		 261 aa  48.5  0.00009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.379534  normal  0.398306 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01566  tol-pal system protein YbgF, putative  23.87 
 
 		 268 aa  48.1  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.405212  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2083  hypothetical protein  25.15 
 
 		 234 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3258  TPR repeat-containing protein  25.15 
 
 		 249 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1070  hypothetical protein  25.45 
 
 		 271 aa  48.1  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.387649  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0825  hypothetical protein  25.15 
 
 		 249 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2659  hypothetical protein  25.15 
 
 		 249 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.238854  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3205  tol-pal system protein YbgF  25.15 
 
 		 249 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3243  tol-pal system protein YbgF  25.15 
 
 		 249 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1951  tol-pal system protein YbgF  25.15 
 
 		 249 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0730  tol-pal system protein YbgF  23.19 
 
 		 261 aa  48.5  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.18828  normal  0.147951 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>