31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0924 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0924  ADP-heptose-LPS heptosyltransferase II  100 
 
 		 280 aa  564  1e-160  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.708476  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1745  TPR repeat-containing protein  73.87 
 
 		 286 aa  416  9.999999999999999e-116  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00037341  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1518  TPR repeat-containing protein  42.18 
 
 		 293 aa  218  7.999999999999999e-56  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00160085  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0694  TPR repeat-containing protein  41.3 
 
 		 272 aa  206  3e-52  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0490074  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0202  hypothetical protein  34.44 
 
 		 329 aa  175  9e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0127748  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0121  hypothetical protein  36.71 
 
 		 315 aa  168  1e-40  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000688933  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0109  hypothetical protein  36.59 
 
 		 315 aa  165  8e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0149  hypothetical protein  36.59 
 
 		 315 aa  165  8e-40  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000393312  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0522  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.82 
 
 		 306 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1396  TPR repeat-containing protein  31.61 
 
 		 309 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.565148  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3584  tol-pal system protein YbgF  25.88 
 
 		 283 aa  63.9  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3515  tol-pal system protein YbgF  25 
 
 		 283 aa  60.5  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000012222  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0201  TPR repeat-containing protein  23.28 
 
 		 275 aa  57.4  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000441439  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0023  TPR domain-containing protein  29.93 
 
 		 278 aa  56.2  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.165753  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0862  membrane lipoprotein lipid attachment site  30.07 
 
 		 256 aa  55.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.349098  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2158  tol-pal system protein YbgF  29.5 
 
 		 262 aa  52.8  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.198251  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3038  TPR domain-containing protein  24.37 
 
 		 272 aa  52.4  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1912  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 		 287 aa  51.6  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3542  TPR repeat-containing protein  22.91 
 
 		 271 aa  52  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000161801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3198  tol-pal system protein YbgF  23.01 
 
 		 329 aa  51.2  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0753  tol-pal system protein YbgF  31.58 
 
 		 258 aa  48.9  0.00008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000204373  normal  0.160376 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0772  tol-pal system protein YbgF  23.98 
 
 		 285 aa  48.9  0.00008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0818446 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1709  tol-pal system protein YbgF  34.25 
 
 		 267 aa  48.9  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000149068  decreased coverage  0.0000715536 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0617  hypothetical protein  29.63 
 
 		 267 aa  48.5  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.144875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0750  tol-pal system protein YbgF  27.12 
 
 		 255 aa  47.4  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000117019  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0826  tol-pal system protein YbgF  32 
 
 		 271 aa  46.2  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000523116  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0757  TPR repeat-containing protein  28.77 
 
 		 264 aa  45.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0965  tol-pal system protein YbgF  26.67 
 
 		 487 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.666424  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3493  tol-pal system protein YbgF  25.5 
 
 		 328 aa  43.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.250731  normal  0.0902147 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0531  putative lipoprotein  32.63 
 
 		 236 aa  42.7  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1158  TPR repeat-containing protein  26.55 
 
 		 257 aa  42.4  0.009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.188926  normal  0.17642 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>