29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0109 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE0109  hypothetical protein  100 
 
 		 315 aa  624  1e-178  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0149  hypothetical protein  100 
 
 		 315 aa  624  1e-178  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000393312  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0121  hypothetical protein  98.1 
 
 		 315 aa  615  1e-175  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000688933  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0202  hypothetical protein  51.53 
 
 		 329 aa  322  4e-87  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0127748  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1518  TPR repeat-containing protein  40.92 
 
 		 293 aa  204  1e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00160085  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1745  TPR repeat-containing protein  39.38 
 
 		 286 aa  176  7e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00037341  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0924  ADP-heptose-LPS heptosyltransferase II  37.42 
 
 		 280 aa  167  2e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.708476  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1396  TPR repeat-containing protein  36.94 
 
 		 309 aa  161  1e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.565148  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0522  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.74 
 
 		 306 aa  159  4e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0694  TPR repeat-containing protein  35.56 
 
 		 272 aa  146  5e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0490074  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0617  hypothetical protein  31.31 
 
 		 267 aa  47  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.144875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0757  TPR repeat-containing protein  29.33 
 
 		 264 aa  46.2  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0201  TPR repeat-containing protein  30.12 
 
 		 275 aa  45.4  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000441439  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0826  tol-pal system protein YbgF  32.88 
 
 		 271 aa  45.4  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000523116  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1737  hypothetical protein  28.12 
 
 		 257 aa  45.1  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.332134  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0772  tol-pal system protein YbgF  32.05 
 
 		 285 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0818446 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2208  Tol-Pal system YbgF  31.51 
 
 		 275 aa  44.7  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00178877  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0023  TPR domain-containing protein  28.75 
 
 		 278 aa  44.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.165753  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1912  TPR repeat-containing protein  34.72 
 
 		 287 aa  44.7  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3515  tol-pal system protein YbgF  30.67 
 
 		 283 aa  43.9  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000012222  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3584  tol-pal system protein YbgF  30.67 
 
 		 283 aa  44.3  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0813  tol-pal system protein YbgF  21.86 
 
 		 262 aa  43.5  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0133975  normal  0.688577 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0877  tol-pal system protein YbgF  21.86 
 
 		 262 aa  43.5  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000691126  normal  0.439363 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2694  tol-pal system protein YbgF  32.5 
 
 		 249 aa  43.5  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.799703  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2158  tol-pal system protein YbgF  31.51 
 
 		 262 aa  43.5  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.198251  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0786  tol-pal system protein YbgF  21.86 
 
 		 262 aa  43.5  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000180184  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0846  tol-pal system protein YbgF  21.86 
 
 		 262 aa  43.5  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00125289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0750  tol-pal system protein YbgF  26.55 
 
 		 255 aa  43.1  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000117019  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2145  TPR domain-containing protein  31.58 
 
 		 335 aa  43.1  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0848355  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>