25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1745 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1745  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 286 aa  576  1.0000000000000001e-163  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00037341  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0924  ADP-heptose-LPS heptosyltransferase II  73.87 
 
 		 280 aa  416  9.999999999999999e-116  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.708476  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1518  TPR repeat-containing protein  45.18 
 
 		 293 aa  220  1.9999999999999999e-56  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00160085  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0694  TPR repeat-containing protein  44.21 
 
 		 272 aa  206  5e-52  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0490074  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0202  hypothetical protein  36.75 
 
 		 329 aa  184  1.0000000000000001e-45  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0127748  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0121  hypothetical protein  39.38 
 
 		 315 aa  174  9.999999999999999e-43  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000688933  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0109  hypothetical protein  39.38 
 
 		 315 aa  173  2.9999999999999996e-42  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0149  hypothetical protein  39.38 
 
 		 315 aa  173  2.9999999999999996e-42  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000393312  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0522  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.03 
 
 		 306 aa  130  3e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1396  TPR repeat-containing protein  33.44 
 
 		 309 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.565148  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0201  TPR repeat-containing protein  22.13 
 
 		 275 aa  50.1  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000441439  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2158  tol-pal system protein YbgF  29.79 
 
 		 262 aa  47  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.198251  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0757  TPR repeat-containing protein  30.39 
 
 		 264 aa  45.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3542  TPR repeat-containing protein  21.1 
 
 		 271 aa  45.4  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000161801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0750  tol-pal system protein YbgF  25 
 
 		 255 aa  45.4  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000117019  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0753  tol-pal system protein YbgF  30.7 
 
 		 258 aa  44.3  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000204373  normal  0.160376 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0772  tol-pal system protein YbgF  22.65 
 
 		 285 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0818446 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1912  TPR repeat-containing protein  31.03 
 
 		 287 aa  44.7  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1158  TPR repeat-containing protein  21.82 
 
 		 257 aa  43.9  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.188926  normal  0.17642 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1709  tol-pal system protein YbgF  32.88 
 
 		 267 aa  43.9  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000149068  decreased coverage  0.0000715536 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3515  tol-pal system protein YbgF  20.69 
 
 		 283 aa  43.9  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000012222  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3584  tol-pal system protein YbgF  20.8 
 
 		 283 aa  43.9  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0617  hypothetical protein  28.83 
 
 		 267 aa  44.3  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.144875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0862  membrane lipoprotein lipid attachment site  31.9 
 
 		 256 aa  43.5  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.349098  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2365  hypothetical protein  31 
 
 		 173 aa  42.4  0.009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000035405  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>