35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1396 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1396  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 309 aa  613  9.999999999999999e-175  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.565148  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0109  hypothetical protein  36.25 
 
 		 315 aa  159  6e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0149  hypothetical protein  36.25 
 
 		 315 aa  159  6e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000393312  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0121  hypothetical protein  37.58 
 
 		 315 aa  154  1e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000688933  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0202  hypothetical protein  32.52 
 
 		 329 aa  145  7.0000000000000006e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0127748  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1518  TPR repeat-containing protein  33.78 
 
 		 293 aa  144  3e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00160085  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0522  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.91 
 
 		 306 aa  139  7.999999999999999e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0694  TPR repeat-containing protein  35.88 
 
 		 272 aa  138  1e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0490074  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1745  TPR repeat-containing protein  33.44 
 
 		 286 aa  130  4.0000000000000003e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00037341  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0924  ADP-heptose-LPS heptosyltransferase II  31.61 
 
 		 280 aa  119  4.9999999999999996e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.708476  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0201  TPR repeat-containing protein  28.32 
 
 		 275 aa  49.7  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000441439  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1580  TPR domain-containing protein  32.5 
 
 		 263 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0635876  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1912  TPR repeat-containing protein  29.75 
 
 		 287 aa  47.8  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0757  TPR repeat-containing protein  27.16 
 
 		 264 aa  47  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1158  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 257 aa  46.6  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.188926  normal  0.17642 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3692  tetratricopeptide domain-containing protein  23.71 
 
 		 239 aa  44.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000893452  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0750  tol-pal system protein YbgF  31.65 
 
 		 255 aa  44.7  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000117019  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3402  Tol-Pal system YbgF  27.45 
 
 		 291 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.517203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2124  Tol-Pal system YbgF  30.38 
 
 		 301 aa  44.3  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.186495  normal  0.327311 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0965  tol-pal system protein YbgF  32.05 
 
 		 487 aa  43.9  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.666424  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2746  hypothetical protein  28.24 
 
 		 250 aa  43.1  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2025  hypothetical protein  21.31 
 
 		 322 aa  43.5  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2366  hypothetical protein  27.91 
 
 		 250 aa  43.1  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000582291  normal  0.169259 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2438  hypothetical protein  27.91 
 
 		 250 aa  43.1  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000167584  normal  0.413869 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2529  hypothetical protein  27.91 
 
 		 250 aa  43.1  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000104047  normal  0.0224917 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1396  tetratricopeptide TPR_2  26.61 
 
 		 261 aa  43.1  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000108782  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1787  tol-pal system protein YbgF  28.24 
 
 		 249 aa  42.7  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000124758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1744  Tol-Pal system YbgF  27.91 
 
 		 249 aa  42.7  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000201827  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2536  tol-pal system protein YbgF  27.91 
 
 		 249 aa  42.7  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000911459  hitchhiker  0.000142623 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0772  tol-pal system protein YbgF  28.57 
 
 		 285 aa  42.7  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0818446 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3624  tol-pal system protein YbgF  29.47 
 
 		 333 aa  42.7  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1748  TPR repeat-containing protein  27.91 
 
 		 249 aa  42.7  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000756054  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0729  TPR repeat-containing protein  32.14 
 
 		 255 aa  42.4  0.009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.032974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2973  TPR domain-containing protein  22.73 
 
 		 266 aa  42.4  0.01  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.485874  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1437  MCP methyltransferase, CheR-type with Tpr repeats  29.35 
 
 		 406 aa  42.4  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>