More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1474 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_03455  penicillin-binding protein 1A  61.05 
 
 		 773 aa  940    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0889  glycosyl transferase family protein  59.49 
 
 		 768 aa  914    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1474  glycosyl transferase family 51  100 
 
 		 772 aa  1613    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0249209  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0176  glycosyltransferase  43.28 
 
 		 762 aa  629  1e-179  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.368405  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0794  penicillin-binding protein 1A, putative  44.3 
 
 		 786 aa  624  1e-177  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0388  glycosyl transferase family 51  44.11 
 
 		 740 aa  607  9.999999999999999e-173  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5029  glycosyl transferase family 51  44.43 
 
 		 765 aa  596  1e-169  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1305  glycosyl transferase family 51  43.72 
 
 		 767 aa  592  1e-168  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.551332 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3131  glycosyltransferase  42.84 
 
 		 759 aa  594  1e-168  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.47312  normal  0.698693 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3074  glycosyl transferase family 51  42.11 
 
 		 854 aa  590  1e-167  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.846458 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1888  glycosyltransferase  42.8 
 
 		 743 aa  585  1e-166  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0246487 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3220  glycosyl transferase family 51  42.97 
 
 		 785 aa  585  1.0000000000000001e-165  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259437  normal  0.206704 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0981  hypothetical protein  39.82 
 
 		 786 aa  584  1.0000000000000001e-165  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.250374 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4764  glycosyl transferase family 51  41.45 
 
 		 850 aa  553  1e-156  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193555  normal  0.0626376 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6609  glycosyl transferase family 51  40.44 
 
 		 794 aa  540  9.999999999999999e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.911258  normal  0.0344936 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1915  glycosyl transferase family 51  35.52 
 
 		 815 aa  488  1e-136  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.70734 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1252  glycosyltransferase  37.78 
 
 		 776 aa  472  1.0000000000000001e-131  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.314687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0274  penicillin-binding protein, 1A family  37.62 
 
 		 783 aa  455  1.0000000000000001e-126  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1120  glycosyl transferase family 51  37.13 
 
 		 907 aa  444  1e-123  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1945  penicillin-binding protein 1A  36.51 
 
 		 752 aa  440  9.999999999999999e-123  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.419198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0590  penicillin-binding protein 1A  37.66 
 
 		 762 aa  438  1e-121  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0242  penicillin-binding protein, 1A family  37.87 
 
 		 730 aa  431  1e-119  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000113999  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0301  1A family penicillin-binding protein  36.32 
 
 		 760 aa  431  1e-119  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0343  penicillin-binding protein, 1A family  35.59 
 
 		 774 aa  428  1e-118  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.314658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0316  penicillin-binding protein, 1A family  36.93 
 
 		 750 aa  425  1e-117  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.223118 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2643  penicillin-binding protein, 1A family  36.06 
 
 		 755 aa  418  9.999999999999999e-116  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4875  peptidoglycan glycosyltransferase  35.5 
 
 		 850 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3899  peptidoglycan glycosyltransferase  35.96 
 
 		 821 aa  405  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2061  glycosyl transferase family protein  35.07 
 
 		 810 aa  402  9.999999999999999e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2081  glycosyl transferase family protein  36.42 
 
 		 846 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.45351  normal  0.431878 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1674  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.27 
 
 		 846 aa  399  1e-109  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.339847  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2329  glycosyl transferase family protein  35.29 
 
 		 801 aa  399  1e-109  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.212398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2469  glycosyl transferase family protein  36.87 
 
 		 846 aa  397  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0192266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3108  peptidoglycan glycosyltransferase  35.69 
 
 		 743 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5259  peptidoglycan glycosyltransferase  35.69 
 
 		 743 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.297119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4244  peptidoglycan glycosyltransferase  35.12 
 
 		 857 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0164258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5014  peptidoglycan glycosyltransferase  35.84 
 
 		 743 aa  395  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0205014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1659  peptidoglycan glycosyltransferase  35.29 
 
 		 862 aa  393  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0514214  normal  0.169753 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5993  peptidoglycan glycosyltransferase  35.25 
 
 		 858 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1363  penicillin-binding protein  37.18 
 
 		 844 aa  391  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2055  1A family penicillin-binding protein  37.18 
 
 		 839 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.635838  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1080  penicillin-binding protein  37.18 
 
 		 844 aa  391  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.366397  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1451  penicillin-binding protein  37.18 
 
 		 928 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.49387  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3229  membrane carboxypeptidase/penicillin-binding protein  37.18 
 
 		 844 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.258839  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0392  peptidoglycan glycosyltransferase  35.55 
 
 		 742 aa  390  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.431383 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2324  1A family penicillin-binding protein  37.5 
 
 		 787 aa  392  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3113  penicillin-binding protein  37.18 
 
 		 839 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.988566  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2346  penicillin-binding protein  37.18 
 
 		 844 aa  391  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3770  peptidoglycan glycosyltransferase  34.98 
 
 		 870 aa  391  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345724  normal  0.277872 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2197  putative penicillin-binding 1 (peptidoglycansynthetase) transmembrane protein, MrcA  35.51 
 
 		 838 aa  389  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.633683  decreased coverage  0.00350534 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4006  peptidoglycan glycosyltransferase  35.38 
 
 		 857 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237546  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5146  peptidoglycan glycosyltransferase  35.47 
 
 		 732 aa  388  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.725403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4361  peptidoglycan glycosyltransferase  35.38 
 
 		 857 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.885871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4835  peptidoglycan glycosyl transferase  35.23 
 
 		 826 aa  384  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.191037  normal  0.0433282 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2013  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.32 
 
 		 834 aa  385  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.155902 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3455  peptidoglycan glycosyltransferase  36.13 
 
 		 787 aa  385  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.19889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4259  peptidoglycan glycosyltransferase  34.71 
 
 		 888 aa  381  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.990931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0887  peptidoglycan glycosyltransferase  34.34 
 
 		 841 aa  382  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.24195 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4618  glycosyl transferase family protein  35.58 
 
 		 728 aa  382  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1773  glycosyl transferase family penicillin-binding protein transpeptidase  33.71 
 
 		 698 aa  349  1e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.488731  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2065  glycosyl transferase family protein  32.15 
 
 		 686 aa  313  5.999999999999999e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.56119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2676  1A family penicillin-binding protein  29.66 
 
 		 795 aa  311  2e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.21019 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2321  1A family penicillin-binding protein  30.84 
 
 		 862 aa  309  1.0000000000000001e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.10527  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4231  penicillin-binding protein 1A  30.36 
 
 		 748 aa  308  4.0000000000000004e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3195  1A family penicillin-binding protein  29.51 
 
 		 773 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2266  1A family penicillin-binding protein  29.12 
 
 		 819 aa  300  9e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4201  putative membrane carboxypeptidase/penicillin-binding protein  30.2 
 
 		 835 aa  298  2e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603081  normal  0.772793 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0754  penicillin-binding protein, 1A family  30.9 
 
 		 796 aa  297  6e-79  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0189  penicillin-binding protein, 1A family  28.2 
 
 		 827 aa  295  2e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0911  putative penicillin-binding protein 1A  29.12 
 
 		 819 aa  295  2e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.477143  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0171  penicillin-binding protein, 1A family  28.5 
 
 		 829 aa  295  3e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000166752 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2852  penicillin-binding protein 1A  28.98 
 
 		 830 aa  293  9e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.456684  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0916  penicillin-binding protein 1A, putative  28.88 
 
 		 819 aa  293  1e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.274618  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0754  penicillin-binding protein, 1A family  29.17 
 
 		 818 aa  293  1e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000281003  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0010  peptidoglycan synthetase; penicillin-binding protein 1A  30.04 
 
 		 797 aa  292  2e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.00000000000000754529  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4669  1A family penicillin-binding protein  29.58 
 
 		 804 aa  292  2e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4359  1A family penicillin-binding protein  28.55 
 
 		 810 aa  290  7e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0354  penicillin-binding protein 1A  27.93 
 
 		 841 aa  288  2e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.75585  normal  0.103015 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3408  1A family penicillin-binding protein  29.62 
 
 		 766 aa  288  2.9999999999999996e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000649652 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2444  penicillin-binding protein 1A  28.28 
 
 		 830 aa  286  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.257563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1716  penicillin-binding protein 1A  28.09 
 
 		 831 aa  285  2.0000000000000002e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0706575  normal  0.372111 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6049  penicillin-binding protein, 1A family  29.12 
 
 		 805 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141532  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0324  penicillin-binding protein 1A  28.97 
 
 		 830 aa  284  6.000000000000001e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3662  1A family penicillin-binding protein  28.27 
 
 		 833 aa  282  1e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5843  1A family penicillin-binding protein  28.59 
 
 		 808 aa  282  2e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.36925  normal  0.15552 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1016  penicillin-binding protein 1A  30.49 
 
 		 778 aa  281  2e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1918  penicillin-binding protein, 1A family  29.83 
 
 		 812 aa  282  2e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.176585  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3955  penicillin-binding protein, 1A family  27.91 
 
 		 805 aa  282  2e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.204833  normal  0.755336 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2056  penicillin-binding protein 1A  28.31 
 
 		 804 aa  281  3e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000993377  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3949  penicillin-binding protein, 1A family  27.78 
 
 		 805 aa  281  4e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.665129 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2730  penicillin-binding protein, 1A family  28.07 
 
 		 832 aa  280  6e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5782  penicillin-binding protein 1A  27.68 
 
 		 823 aa  278  2e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0092  1A family penicillin-binding protein  30.71 
 
 		 778 aa  276  1.0000000000000001e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000436892  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66670  penicillin-binding protein 1A  27.36 
 
 		 823 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0189  penicillin-binding protein, 1A family  29.18 
 
 		 799 aa  275  2.0000000000000002e-72  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.149953  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2534  1A family penicillin-binding protein  27.79 
 
 		 804 aa  276  2.0000000000000002e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.401637  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3007  penicillin-binding protein 1A  27.86 
 
 		 830 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.160235 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0780  penicillin-binding protein 1A  29.33 
 
 		 804 aa  275  2.0000000000000002e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0727  penicillin-binding protein, 1A family  28.63 
 
 		 804 aa  275  3e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0987  hypothetical protein  27.58 
 
 		 794 aa  273  8.000000000000001e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>