More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0064 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0064  asparagine synthetase A  100 
 
 
348 aa  719    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0556174  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1140  asparagine synthetase A  83.91 
 
 
364 aa  635    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.304827  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1097  asparagine synthetase A  70.81 
 
 
353 aa  535  1e-151  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.177084 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0757  asparagine synthetase A  68.59 
 
 
353 aa  525  1e-148  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.295749 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0913  asparagine synthetase A  68.01 
 
 
353 aa  519  1e-146  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.100021 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1611  asparagine synthetase A  68.5 
 
 
369 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1659  asparagine synthetase A  34.63 
 
 
319 aa  196  6e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000312923  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1752  asparaginyl-tRNA synthetase  33.66 
 
 
431 aa  188  1e-46  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.271422  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0799  asparaginyl-tRNA synthetase  32.9 
 
 
431 aa  179  4.999999999999999e-44  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0829958  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1342  asparaginyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 
431 aa  178  1e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.658334  normal  0.0839865 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0375  asparaginyl-tRNA synthetase  31.72 
 
 
431 aa  177  3e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0470506 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1133  asparaginyl-tRNA synthetase  31.72 
 
 
431 aa  172  9e-42  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.563116 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4597  asparaginyl-tRNA synthetase  30.06 
 
 
442 aa  163  4.0000000000000004e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1885  asparaginyl-tRNA synthetase  31.72 
 
 
432 aa  160  4e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00255818  normal  0.527696 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1358  asparaginyl-tRNA synthetase  30.23 
 
 
434 aa  154  2e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2363  asparaginyl-tRNA synthetase  30.18 
 
 
447 aa  153  4e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00696467  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1281  asparaginyl-tRNA synthetase  30 
 
 
429 aa  153  5e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2127  asparaginyl-tRNA synthetase  29.48 
 
 
441 aa  153  5e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.619552  normal  0.21905 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0931  asparaginyl-tRNA synthetase  30.45 
 
 
433 aa  152  1e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000235205  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2042  asparaginyl-tRNA synthetase  28.88 
 
 
441 aa  148  1.0000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.109119  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1193  asparaginyl-tRNA synthetase  30.45 
 
 
432 aa  147  2.0000000000000003e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0885  asparaginyl-tRNA synthetase  28.36 
 
 
440 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00274664 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1638  asparaginyl-tRNA synthetase  30.46 
 
 
431 aa  148  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0232  asparaginyl-tRNA synthetase  28.07 
 
 
440 aa  147  3e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0527  asparaginyl-tRNA synthetase  28.85 
 
 
431 aa  144  3e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2111  asparaginyl-tRNA synthetase  28.48 
 
 
430 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000832274  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1900  asparaginyl-tRNA synthetase  27.57 
 
 
440 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.214123  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2728  asparaginyl-tRNA synthetase  32.15 
 
 
434 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.21045  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1677  asparaginyl-tRNA synthetase  29.28 
 
 
435 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0508  asparaginyl-tRNA synthetase  29.11 
 
 
431 aa  140  3e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2912  asparaginyl-tRNA synthetase  32.15 
 
 
434 aa  139  7e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0488196  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2020  asparaginyl-tRNA synthetase  27.67 
 
 
447 aa  137  3.0000000000000003e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.441721  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2720  asparaginyl-tRNA synthetase  32.15 
 
 
434 aa  137  4e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1886  asparaginyl-tRNA synthetase  28.53 
 
 
432 aa  136  4e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000291835  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0848  asparaginyl-tRNA synthetase  30.42 
 
 
430 aa  137  4e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2820  asparaginyl-tRNA synthetase  31.83 
 
 
434 aa  136  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2273  asparaginyl-tRNA synthetase  30.84 
 
 
454 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.112363  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1136  asparaginyl-tRNA synthetase  26.96 
 
 
449 aa  134  1.9999999999999998e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.197161  hitchhiker  0.00686956 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1097  asparaginyl-tRNA synthetase  28.53 
 
 
434 aa  134  3e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1833  asparagine synthetase A  29.77 
 
 
323 aa  134  3e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1542  asparaginyl-tRNA synthetase  27.97 
 
 
430 aa  131  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1513  asparaginyl-tRNA synthetase  27.97 
 
 
430 aa  131  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0809423  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_42247  predicted protein  28.65 
 
 
467 aa  130  3e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2287  aspartyl-tRNA synthetase  31.82 
 
 
423 aa  130  4.0000000000000003e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0265879  hitchhiker  0.000764626 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1024  asparaginyl-tRNA synthetase  27.22 
 
 
430 aa  130  5.0000000000000004e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1884  aspartyl-tRNA synthetase  30.92 
 
 
423 aa  129  6e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.455138  normal  0.718248 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2087  asparaginyl-tRNA synthetase  28.95 
 
 
471 aa  129  8.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1066  aspartyl-tRNA synthetase  28.39 
 
 
428 aa  129  9.000000000000001e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0864  asparaginyl-tRNA synthetase  27.04 
 
 
448 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.756998  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4685  asparaginyl-tRNA synthetase  29.74 
 
 
463 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000178591  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0526  asparaginyl-tRNA synthetase  26.71 
 
 
448 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4670  asparaginyl-tRNA synthetase  29.74 
 
 
463 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.135639  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0099  asparaginyl-tRNA synthetase  29.12 
 
 
461 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0623  aspartyl-tRNA synthetase  29.08 
 
 
434 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0512708  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4685  asparaginyl-tRNA synthetase  29.45 
 
 
463 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.765592  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4454  asparaginyl-tRNA synthetase  29.45 
 
 
463 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4302  asparaginyl-tRNA synthetase  29.45 
 
 
463 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.678889  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4802  asparaginyl-tRNA synthetase  29.45 
 
 
463 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.457701  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4673  asparaginyl-tRNA synthetase  29.45 
 
 
463 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0858100000000003e-18 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0846  asparaginyl-tRNA synthetase  29.68 
 
 
430 aa  126  5e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0205  aspartyl-tRNA synthetase  28.2 
 
 
429 aa  126  6e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.398842  normal  0.035256 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1028  asparaginyl-tRNA synthetase  26.52 
 
 
432 aa  126  6e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00241255  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4292  asparaginyl-tRNA synthetase  28.86 
 
 
463 aa  125  7e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0001  asparaginyl-tRNA synthetase  30 
 
 
461 aa  125  1e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3247  asparaginyl-tRNA synthetase  29.15 
 
 
463 aa  124  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0569  asparaginyl-tRNA synthetase  28.86 
 
 
463 aa  123  6e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00666077  normal  0.0252712 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4390  asparaginyl-tRNA synthetase  28.86 
 
 
463 aa  123  6e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0583  asparaginyl-tRNA synthetase  25.87 
 
 
481 aa  122  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3597  asparaginyl-tRNA synthetase  27.74 
 
 
430 aa  120  3e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1527  aspartyl-tRNA synthetase  28.66 
 
 
433 aa  120  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00133042 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04580  asparaginyl-tRNA synthetase  27.11 
 
 
467 aa  120  3.9999999999999996e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000141691  unclonable  0.00000000215103 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1719  asparaginyl-tRNA synthetase  27.99 
 
 
463 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00602659  normal  0.38448 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0796  aspartyl-tRNA synthetase  29.14 
 
 
439 aa  119  4.9999999999999996e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.740603  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2442  asparaginyl-tRNA synthetase  27.65 
 
 
479 aa  119  7e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3176  asparaginyl-tRNA synthetase  27.35 
 
 
464 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.534078 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33068  Asparaginyl-tRNA synthetase, cytoplasmic (Asparagine--tRNA ligase) (AsnRS)  27.27 
 
 
553 aa  118  1.9999999999999998e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0370  asparaginyl-tRNA synthetase  26.82 
 
 
467 aa  117  1.9999999999999998e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1381  asparaginyl-tRNA synthetase  23.96 
 
 
435 aa  118  1.9999999999999998e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0878825  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1785  asparaginyl-tRNA synthetase  27.03 
 
 
466 aa  117  3e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00203512  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0465  aspartyl-tRNA synthetase  30.82 
 
 
428 aa  116  6.9999999999999995e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2057  asparaginyl-tRNA synthetase  26.73 
 
 
466 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.187857  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4215  asparaginyl-tRNA synthetase  26.89 
 
 
479 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.37177  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0039  aspartyl-tRNA synthetase  28.1 
 
 
429 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.227314  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1139  tRNA synthetase class II (D K and N)  28.22 
 
 
441 aa  114  3e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.221596  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0374  asparaginyl-tRNA synthetase  26.46 
 
 
476 aa  114  3e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.551961  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4889  Aspartate--tRNA ligase  28.34 
 
 
447 aa  114  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1870  Aspartate--tRNA ligase  29.39 
 
 
428 aa  112  8.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.465433 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0824  asparaginyl-tRNA synthetase  25.51 
 
 
454 aa  112  8.000000000000001e-24  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3465  asparaginyl-tRNA synthetase  27.09 
 
 
475 aa  112  8.000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00748  asparaginyl-tRNA synthetase  27.7 
 
 
464 aa  111  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.430236  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8755  predicted protein  30.77 
 
 
501 aa  111  2.0000000000000002e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0260  asparaginyl-tRNA synthetase  26.92 
 
 
460 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2483  asparaginyl-tRNA synthetase  25.22 
 
 
462 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0370887  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0028  aspartyl-tRNA synthetase  27.12 
 
 
438 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1151  aspartyl-tRNA synthetase  26.67 
 
 
429 aa  110  3e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2592  asparaginyl-tRNA synthetase  27.35 
 
 
464 aa  110  3e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.258167 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08140  asparaginyl-tRNA synthetase  25.59 
 
 
463 aa  110  3e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2681  aspartyl-tRNA synthetase  27.74 
 
 
434 aa  110  3e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003150  asparaginyl-tRNA synthetase  27.3 
 
 
472 aa  110  4.0000000000000004e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000140895  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2558  asparaginyl-tRNA synthetase  26.13 
 
 
466 aa  110  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000121156  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>