61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0807 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0014  hypothetical protein  51.76 
 
 		 670 aa  724    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0064  cytochrome c family protein  62.46 
 
 		 689 aa  912    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0807  cytochrome c family protein  100 
 
 		 688 aa  1434    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2603  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like protein  43.33 
 
 		 729 aa  441  9.999999999999999e-123  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.18944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0095  hypothetical protein  37.99 
 
 		 616 aa  366  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000209926  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0125  hypothetical protein  37.19 
 
 		 618 aa  362  2e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000548778  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2063  hypothetical protein  37.72 
 
 		 615 aa  361  2e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.97808  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0077  hypothetical protein  37.46 
 
 		 616 aa  362  2e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.09082e-34 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0274  cytochrome c family protein  36.23 
 
 		 619 aa  352  2e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00552346  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0100  cytochrome c family protein  36.65 
 
 		 618 aa  335  2e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000214934  normal  0.444755 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4073  cytochrome c family protein  35.5 
 
 		 662 aa  323  7e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0551  cytochrome c family protein  36.4 
 
 		 688 aa  320  3.9999999999999996e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0762772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1404  cytochrome c family protein  32.98 
 
 		 655 aa  283  6.000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.352447  normal  0.0404574 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0109  hypothetical protein  30.12 
 
 		 571 aa  202  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0116  hypothetical protein  27.83 
 
 		 566 aa  197  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.7686  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0127  hypothetical protein  27.11 
 
 		 566 aa  194  5e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0113  hypothetical protein  27.44 
 
 		 577 aa  192  1e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.020056  normal  0.620455 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2713  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like  27.29 
 
 		 658 aa  169  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.151641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0845  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like protein  24.37 
 
 		 757 aa  154  4e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.763615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3925  hypothetical protein  36.07 
 
 		 236 aa  148  4.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1962  deca-heme C-type cytochrome-like protein  32.35 
 
 		 241 aa  130  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.282752  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2001  deca-heme C-type cytochrome-like  32.35 
 
 		 241 aa  130  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1877  deca-heme C-type cytochrome-like protein  32.35 
 
 		 241 aa  130  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.14633  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1806  deca-heme C-type cytochrome-like protein  34.45 
 
 		 247 aa  126  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.655576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0349  rhodanese domain-containing protein  45.19 
 
 		 141 aa  92.8  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1338  cytochrome c family protein  61.97 
 
 		 75 aa  90.1  1e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.207335  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0480  hypothetical protein  33.57 
 
 		 146 aa  82  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4001  rhodanese domain-containing protein  40.59 
 
 		 146 aa  80.9  0.00000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4476  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 142 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3363  rhodanese domain-containing protein  39.6 
 
 		 146 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0494  hypothetical protein  32.84 
 
 		 142 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3876  rhodanese domain-containing protein  38.61 
 
 		 147 aa  78.6  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0480  rhodanese domain-containing protein  37.74 
 
 		 142 aa  79  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0489  rhodanese domain-containing protein  38.46 
 
 		 147 aa  77.8  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0490  rhodanese domain-containing protein  39.6 
 
 		 147 aa  77.8  0.0000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3541  rhodanese domain-containing protein  38.46 
 
 		 147 aa  77  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4455  rhodanese domain-containing protein  32.17 
 
 		 143 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0504  rhodanese domain-containing protein  31.47 
 
 		 152 aa  75.1  0.000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1805  cytochrome C family protein  27.62 
 
 		 346 aa  74.3  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.126894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0483  rhodanese domain-containing protein  36.63 
 
 		 151 aa  74.3  0.000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1961  cytochrome C family protein  25.24 
 
 		 346 aa  67.8  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.613696  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1876  cytochrome C family protein  25.24 
 
 		 346 aa  67.8  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2002  cytochrome c family protein  25.24 
 
 		 346 aa  67.8  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3926  hypothetical protein  29.41 
 
 		 211 aa  64.7  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2739  hypothetical protein  24.12 
 
 		 471 aa  52.8  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000852444  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1455  putative formate dehydrogenase  29.88 
 
 		 339 aa  52.4  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0431  flavodoxin domain-containing protein  25.6 
 
 		 883 aa  52  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4269  formate dehydrogenase, gamma subunit  25.69 
 
 		 227 aa  50.4  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.308563  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1118  formate dehydrogenase, cytochrome B556 subunit  28.4 
 
 		 357 aa  49.7  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0797  formate dehydrogenase gamma subunit  24.59 
 
 		 229 aa  48.5  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.205396  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02280  formate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  27.8 
 
 		 350 aa  47.8  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003492  formate dehydrogenase -O gamma subunit  28.22 
 
 		 350 aa  47  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.227866  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0679  rhodanese-like protein  30.61 
 
 		 363 aa  47  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.117873  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2887  cytochrome c family protein  22.36 
 
 		 884 aa  47.4  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0141387  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0086  formate dehydrogenase-O subunit gamma  23.65 
 
 		 211 aa  46.2  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0959  multiheme cytochrome  25.56 
 
 		 447 aa  45.8  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0580  hypothetical protein  23.78 
 
 		 195 aa  45.8  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000209593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2149  cytochrome c family protein  26.75 
 
 		 304 aa  45.1  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0950345  normal  0.491991 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0598  PKD  22.7 
 
 		 806 aa  45.1  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00146483  normal  0.752324 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1552  beta ketoacyl-acyl carrier protein synthase II  24.06 
 
 		 456 aa  44.3  0.007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0956  multihaem cytochrome  25.14 
 
 		 446 aa  43.9  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>