More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0745 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0745  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 408 aa  833    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0786  histidyl-tRNA synthetase  75.74 
 
 		 408 aa  611  9.999999999999999e-175  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00313764  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1247  histidyl-tRNA synthetase  75 
 
 		 408 aa  607  9.999999999999999e-173  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0392037  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0856  histidyl-tRNA synthetase  73.28 
 
 		 408 aa  598  1e-170  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1272  histidyl-tRNA synthetase  66.01 
 
 		 408 aa  548  1e-155  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0694221  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0894  histidyl-tRNA synthetase  64.55 
 
 		 409 aa  539  9.999999999999999e-153  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0307852  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0925  histidyl-tRNA synthetase  62.1 
 
 		 410 aa  531  1e-150  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1288  histidyl-tRNA synthetase  57.43 
 
 		 402 aa  482  1e-135  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.373559  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1130  histidyl-tRNA synthetase  56.25 
 
 		 403 aa  461  9.999999999999999e-129  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0629126  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2838  histidyl-tRNA synthetase  41.36 
 
 		 417 aa  334  1e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1913  histidyl-tRNA synthetase  41.79 
 
 		 413 aa  333  3e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.282682  hitchhiker  0.000195117 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1659  histidyl-tRNA synthetase  41.91 
 
 		 413 aa  332  6e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0302823  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2313  histidyl-tRNA synthetase  42.05 
 
 		 415 aa  329  4e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.335262 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0669  histidyl-tRNA synthetase  38.98 
 
 		 423 aa  328  9e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000705937  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0013  histidyl-tRNA synthetase  41.29 
 
 		 419 aa  325  1e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1166  histidyl-tRNA synthetase  40.84 
 
 		 416 aa  323  3e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000433915 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1887  histidyl-tRNA synthetase  40.69 
 
 		 415 aa  323  4e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1041  histidyl-tRNA synthetase  39.27 
 
 		 419 aa  322  7e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000286548  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3096  histidyl-tRNA synthetase  40.69 
 
 		 416 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000698115  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1381  histidyl-tRNA synthetase  40.1 
 
 		 414 aa  318  9e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.158923  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3303  histidyl-tRNA synthetase  39.41 
 
 		 421 aa  318  1e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.375458 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0622  histidyl-tRNA synthetase  41.81 
 
 		 426 aa  317  2e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2445  histidyl-tRNA synthetase  40.34 
 
 		 414 aa  317  3e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.228667  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2357  histidyl-tRNA synthetase  40.34 
 
 		 414 aa  316  5e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.99285  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3013  histidyl-tRNA synthetase  39.18 
 
 		 424 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0289  histidyl-tRNA synthetase  39.66 
 
 		 422 aa  313  2.9999999999999996e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1119  histidyl-tRNA synthetase  38.94 
 
 		 424 aa  313  2.9999999999999996e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0730  histidyl-tRNA synthetase  40.88 
 
 		 424 aa  312  7.999999999999999e-84  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1259  histidyl-tRNA synthetase  38.94 
 
 		 424 aa  311  1e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.544922  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1332  histidyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 		 417 aa  310  2e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000373388  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004348  histidyl-tRNA synthetase  40.99 
 
 		 422 aa  310  2.9999999999999997e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0011  histidyl-tRNA synthetase  39.51 
 
 		 417 aa  310  4e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3608  histidyl-tRNA synthetase  38.82 
 
 		 424 aa  306  3e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.602511 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02980  histidyl-tRNA synthetase  40.43 
 
 		 427 aa  306  4.0000000000000004e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.651371  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1761  histidyl-tRNA synthetase  39.16 
 
 		 419 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.210094  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01068  histidyl-tRNA synthetase  40.2 
 
 		 422 aa  306  6e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1510  histidyl-tRNA synthetase  40.34 
 
 		 426 aa  305  8.000000000000001e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.707902  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0027  histidyl-tRNA synthetase  39.3 
 
 		 417 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.583474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2037  histidyl-tRNA synthetase  38.2 
 
 		 426 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1169  histidyl-tRNA synthetase  40.44 
 
 		 448 aa  304  2.0000000000000002e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0566185  normal  0.367142 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2651  histidyl-tRNA synthetase  40.1 
 
 		 425 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1433  histidyl-tRNA synthetase  39.8 
 
 		 424 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00243432  normal  0.636484 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2364  histidyl-tRNA synthetase  39.1 
 
 		 424 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00827358  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1677  histidyl-tRNA synthetase  38.24 
 
 		 423 aa  303  4.0000000000000003e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0038851 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1291  histidyl-tRNA synthetase  37.83 
 
 		 421 aa  302  7.000000000000001e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0371866  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3311  histidyl-tRNA synthetase  39.51 
 
 		 425 aa  302  8.000000000000001e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3125  histidyl-tRNA synthetase  39.81 
 
 		 426 aa  302  9e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0624144  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0884  histidyl-tRNA synthetase  39 
 
 		 429 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.265271  normal  0.401715 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0854  histidyl-tRNA synthetase  39 
 
 		 429 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4324  histidyl-tRNA synthetase  39 
 
 		 429 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.439284  hitchhiker  0.0000000761597 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12150  histidyl-tRNA synthetase  39.23 
 
 		 419 aa  301  1e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000175223  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3587  histidyl-tRNA synthetase  37.32 
 
 		 424 aa  301  1e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000170234  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0897  histidyl-tRNA synthetase  39 
 
 		 429 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.475429  hitchhiker  0.000000578873 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2736  histidyl-tRNA synthetase  38.33 
 
 		 424 aa  300  4e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3004  histidyl-tRNA synthetase  39.85 
 
 		 426 aa  300  4e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0149184  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2989  histidyl-tRNA synthetase  39.85 
 
 		 426 aa  300  4e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.212301  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1374  histidyl-tRNA synthetase  39.85 
 
 		 426 aa  300  4e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0595731  normal  0.400844 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3147  histidyl-tRNA synthetase  39.6 
 
 		 426 aa  298  9e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00958807 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1257  histidyl-tRNA synthetase  39.85 
 
 		 424 aa  298  1e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0282832  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0485  histidyl-tRNA synthetase  40.29 
 
 		 415 aa  297  2e-79  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1261  histidyl-tRNA synthetase  43.09 
 
 		 410 aa  298  2e-79  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.848478  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1294  histidyl-tRNA synthetase  37.74 
 
 		 424 aa  297  2e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0417  histidyl-tRNA synthetase  37.74 
 
 		 424 aa  297  2e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143012 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4600  histidyl-tRNA synthetase  39.25 
 
 		 429 aa  297  3e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1187  histidyl-tRNA synthetase  37.74 
 
 		 424 aa  296  4e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.557803  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1068  histidyl-tRNA synthetase  40.1 
 
 		 414 aa  296  4e-79  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1230  histidyl-tRNA synthetase  39.27 
 
 		 425 aa  296  6e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1300  histidyl-tRNA synthetase  39.27 
 
 		 425 aa  295  7e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1249  histidyl-tRNA synthetase  39.23 
 
 		 429 aa  295  8e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0462121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1229  histidyl-tRNA synthetase  39.27 
 
 		 425 aa  295  8e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.322745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1357  histidyl-tRNA synthetase  40.1 
 
 		 424 aa  295  8e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000835199 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0902  histidyl-tRNA synthetase, class IIA  37.53 
 
 		 423 aa  295  1e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.717157  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1136  histidyl-tRNA synthetase  40.89 
 
 		 414 aa  295  1e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.850642  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0811  histidine--tRNA ligase  42.29 
 
 		 422 aa  295  1e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000276292  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1472  histidyl-tRNA synthetase  40.82 
 
 		 418 aa  295  1e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000135965  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1435  histidyl-tRNA synthetase  39.23 
 
 		 429 aa  294  2e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14890  histidyl-tRNA synthetase  36.6 
 
 		 429 aa  293  3e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1306  histidyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 424 aa  293  4e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000890962  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1788  histidyl-tRNA synthetase  37.04 
 
 		 423 aa  293  5e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3008  histidyl-tRNA synthetase  38.08 
 
 		 424 aa  292  6e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0009  histidyl-tRNA synthetase  39.41 
 
 		 416 aa  292  7e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0511453  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2716  histidyl-tRNA synthetase  37.59 
 
 		 424 aa  292  8e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2890  histidyl-tRNA synthetase  37.59 
 
 		 424 aa  292  8e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.112536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2760  histidyl-tRNA synthetase  37.59 
 
 		 424 aa  292  9e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.580022 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2673  histidyl-tRNA synthetase  37.59 
 
 		 424 aa  292  9e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2779  histidyl-tRNA synthetase  37.59 
 
 		 424 aa  291  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1545  histidyl-tRNA synthetase  39.71 
 
 		 424 aa  291  1e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000365747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0744  histidyl-tRNA synthetase  40.29 
 
 		 419 aa  290  2e-77  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100604  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1291  histidyl-tRNA synthetase  39.45 
 
 		 423 aa  290  2e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0897904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2889  histidyl-tRNA synthetase  37.59 
 
 		 424 aa  289  8e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.731565  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02406  histidyl-tRNA synthetase  37.59 
 
 		 424 aa  288  1e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.820666  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1154  histidyl-tRNA synthetase  37.59 
 
 		 424 aa  288  1e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.708603  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2665  histidyl-tRNA synthetase  37.59 
 
 		 424 aa  288  1e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0415954  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2798  histidyl-tRNA synthetase  37.59 
 
 		 424 aa  288  1e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0241493  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0969  histidyl-tRNA synthetase  38.33 
 
 		 411 aa  288  1e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0491418  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02368  hypothetical protein  37.59 
 
 		 424 aa  288  1e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.965235  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1163  histidyl-tRNA synthetase  37.59 
 
 		 424 aa  288  1e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.878668  normal  0.0105907 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3738  histidyl-tRNA synthetase  37.59 
 
 		 424 aa  288  1e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2666  histidyl-tRNA synthetase  37.59 
 
 		 424 aa  288  1e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.557016  normal  0.28458 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0564  histidyl-tRNA synthetase  40.89 
 
 		 406 aa  288  1e-76  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>