More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0039 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_0039  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  100 
 
 
278 aa  561  1e-159  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0156  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  54.12 
 
 
291 aa  274  1e-72  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0138  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  53.46 
 
 
296 aa  270  1e-71  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0179  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  52.69 
 
 
296 aa  270  1e-71  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0094  periplasmic solute binding protein  41.61 
 
 
296 aa  232  6e-60  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000753569  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0516  periplasmic solute binding protein  39.39 
 
 
299 aa  221  8e-57  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1793  putative carbon storage regulator-like protein  39.46 
 
 
302 aa  219  4e-56  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.265514  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0131  periplasmic solute binding protein  40.89 
 
 
285 aa  211  1e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0119  periplasmic solute binding protein  35.07 
 
 
344 aa  194  1e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.527461 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3938  periplasmic solute binding protein  37.55 
 
 
310 aa  189  3e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.165215 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3888  periplasmic solute binding protein  37.17 
 
 
310 aa  188  8e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0400  periplasmic solute binding protein  34.89 
 
 
302 aa  188  9e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0993  zinc ABC transporter, zinc-binding protein  36.05 
 
 
323 aa  184  1e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.27598  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0624  periplasmic solute binding protein  31.02 
 
 
310 aa  179  5e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.17894  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1015  solute binding protein  34.3 
 
 
310 aa  176  4e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1891  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  35.41 
 
 
288 aa  173  2e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0024  periplasmic solute binding protein  32.23 
 
 
312 aa  172  5e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.229432  normal  0.178577 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1015  periplasmic solute binding protein  35.22 
 
 
293 aa  169  4e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1725  periplasmic solute binding protein  31.43 
 
 
335 aa  169  5e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2423  periplasmic solute binding protein  32.82 
 
 
296 aa  167  2e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.890095  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0025  periplasmic solute binding protein  31.13 
 
 
293 aa  160  2e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0604  periplasmic solute binding protein  30.58 
 
 
290 aa  158  9e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_572  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  32.65 
 
 
290 aa  154  2e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2317  periplasmic solute binding protein  29.48 
 
 
300 aa  153  3e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0631  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  32.53 
 
 
290 aa  152  5e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3026  ABC-type transport system, periplasmic component  29 
 
 
302 aa  152  7e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1102  periplasmic solute binding protein  29.41 
 
 
282 aa  150  2e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0816  periplasmic solute binding protein  30.12 
 
 
300 aa  149  5e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.313747  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1731  periplasmic solute binding protein  39.34 
 
 
469 aa  141  1e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0205  periplasmic solute binding protein  29.96 
 
 
300 aa  140  2e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.767408  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2476  periplasmic solute binding protein  27.96 
 
 
313 aa  135  9e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00202006  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2998  periplasmic solute binding protein  30.08 
 
 
328 aa  135  9e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  6.88581e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0195  periplasmic solute binding protein  29.03 
 
 
292 aa  134  2e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.591767  normal  0.474509 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1674  adhesion protein, putative  27.72 
 
 
311 aa  133  4e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0484174  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4439  periplasmic solute binding protein  28.96 
 
 
339 aa  132  9e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.914781  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0139  adhesion protein, putative  28.62 
 
 
294 aa  130  3e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0377699  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2088  periplasmic solute binding protein  27.87 
 
 
323 aa  129  4e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.245809  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0185  periplasmic solute binding protein  26.22 
 
 
307 aa  127  1e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3284  putative adhesion lipoprotein  30.57 
 
 
316 aa  127  2e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0895  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  30.6 
 
 
514 aa  127  2e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00479451  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2025  putative adhesion lipoprotein  30.57 
 
 
316 aa  126  4e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3805  periplasmic solute binding protein  31.84 
 
 
298 aa  125  7e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0163421  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1841  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  30.57 
 
 
316 aa  124  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.18542  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  30.95 
 
 
309 aa  124  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2035  adhesion lipoprotein  30.57 
 
 
316 aa  123  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1885  periplasmic solute binding protein  30.94 
 
 
316 aa  123  3e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0182568  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1889  adhesion lipoprotein  30.57 
 
 
316 aa  123  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.994637  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1851  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  30.28 
 
 
316 aa  122  6e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.623587  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2645  periplasmic solute binding protein  31.37 
 
 
317 aa  122  9e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2103  adhesion lipoprotein  30.57 
 
 
316 aa  121  1e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2136  putative adhesion lipoprotein  30.57 
 
 
316 aa  121  1e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1216  periplasmic solute binding protein  32.47 
 
 
278 aa  120  2e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1526  periplasmic solute binding protein  28.72 
 
 
316 aa  120  3e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4568  periplasmic solute-binding protein  27.31 
 
 
322 aa  119  7e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.328746  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2226  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  28.03 
 
 
323 aa  117  2e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.118705  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1759  adhesion protein, putative  25 
 
 
315 aa  115  1e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0833  periplasmic solute binding protein  26.84 
 
 
345 aa  112  6e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4951  periplasmic solute binding protein  27.37 
 
 
317 aa  111  1e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2066  putative adhesion lipoprotein  29.92 
 
 
265 aa  111  2e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1128  periplasmic solute binding protein  27.64 
 
 
296 aa  110  2e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.29041 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2413  ABC transporter, substrate-binding protein  29.83 
 
 
298 aa  110  2e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423087  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2125  ABC transporter, substrate-binding protein  29.83 
 
 
298 aa  110  2e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.570615  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1681  periplasmic solute binding protein  29.84 
 
 
277 aa  109  6e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1578  periplasmic solute binding protein  26.69 
 
 
314 aa  107  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0930  periplasmic solute binding protein  26.83 
 
 
292 aa  107  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.933909  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0989  periplasmic solute binding protein  33.09 
 
 
295 aa  107  3e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0547  periplasmic solute binding protein  28.27 
 
 
318 aa  106  4e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.624279  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11141  hypothetical protein  30.33 
 
 
324 aa  106  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.201387 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2043  periplasmic solute binding protein  27.82 
 
 
353 aa  105  6e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  1.0108e-06  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0057  periplasmic solute binding protein  24.52 
 
 
276 aa  105  6e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2656  periplasmic solute binding protein  27.75 
 
 
301 aa  104  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.149358 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1655  periplasmic solute binding protein  28.63 
 
 
306 aa  103  2e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3534  periplasmic solute binding protein  25.19 
 
 
304 aa  103  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04310  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  27.03 
 
 
349 aa  102  6e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0224  periplasmic solute binding protein  26.46 
 
 
368 aa  102  6e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2190  periplasmic solute binding protein  29.49 
 
 
287 aa  101  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  3.21353e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0461  periplasmic solute binding protein  28.97 
 
 
313 aa  101  2e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3600  periplasmic solute binding protein  24.81 
 
 
304 aa  100  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0534  periplasmic solute binding protein  25.29 
 
 
293 aa  100  4e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1470  periplasmic solute binding protein  25.66 
 
 
298 aa  99.4  6e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0700113  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2781  periplasmic solute binding protein  24.58 
 
 
318 aa  99  8e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0580  periplasmic solute binding protein  27.76 
 
 
328 aa  98.6  9e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1999  periplasmic solute binding protein  24.23 
 
 
292 aa  98.2  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.870733  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2050  high-affinity zinc transporter periplasmic component  25.09 
 
 
314 aa  98.2  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.153419  normal  0.0811015 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2105  high-affinity zinc transporter periplasmic component  25.09 
 
 
314 aa  98.2  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.060713  normal  0.639588 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1357  high-affinity zinc transporter periplasmic component  25.09 
 
 
314 aa  98.2  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00461561 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2045  high-affinity zinc transporter periplasmic component  25.09 
 
 
314 aa  98.2  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.279295  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1233  high-affinity zinc transporter periplasmic component  25.09 
 
 
314 aa  98.2  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00176582  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1142  periplasmic solute binding protein  28.27 
 
 
307 aa  96.7  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.987303  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2791  periplasmic solute binding protein  30.7 
 
 
314 aa  97.1  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  4.35611e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0928  periplasmic solute binding protein  28.57 
 
 
305 aa  96.7  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.664518  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0046  periplasmic solute binding protein  26.54 
 
 
316 aa  96.7  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0852  high-affinity zinc uptake system protein ZnuA precursor  28.39 
 
 
297 aa  95.9  6e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0338292  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2051  periplasmic solute binding protein  29.77 
 
 
303 aa  95.9  7e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0478383  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2065  periplasmic solute binding protein  28.36 
 
 
304 aa  95.5  8e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3227  periplasmic solute binding protein  23.16 
 
 
312 aa  95.1  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0202963  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1938  adhesion lipoprotein  27.37 
 
 
307 aa  94.7  1e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1972  periplasmic solute binding protein  28.74 
 
 
303 aa  94.7  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0535  zinc ABC transporter, zinc-binding adhesion liprotein  26.62 
 
 
506 aa  92.4  6e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0968782  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2183  periplasmic solute binding protein  23.67 
 
 
311 aa  92  8e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.143573 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>