More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0384 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_0384  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 
127 aa  252  1.0000000000000001e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3657  transcriptional regulator, ArsR family  81.1 
 
 
127 aa  204  4e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2665  transcriptional regulator, ArsR family  69.67 
 
 
127 aa  173  7e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374254  normal  0.232487 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4723  transcriptional regulator, ArsR family  66.02 
 
 
131 aa  141  3e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.383157  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3742  ArsR family transcriptional regulator  60.78 
 
 
116 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3375  transcriptional regulator, ArsR family  57.14 
 
 
129 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0206443  hitchhiker  0.00373778 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0501  regulatory protein ArsR  65.35 
 
 
127 aa  129  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567681  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0211  ArsR family transcriptional regulator  56.88 
 
 
125 aa  128  3e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3217  regulatory protein, ArsR  67.06 
 
 
95 aa  126  9.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3347  transcriptional regulator, ArsR family  60 
 
 
120 aa  126  1.0000000000000001e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14690  transcriptional regulator, ArsR family  56.86 
 
 
116 aa  123  7e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0563  ArsR family transcriptional regulator  51.67 
 
 
132 aa  118  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  55.56 
 
 
125 aa  118  3e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  57.29 
 
 
125 aa  117  6e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3239  ArsR family transcriptional regulator  59.14 
 
 
136 aa  116  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.366453 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0103  transcriptional regulator, ArsR family  61.22 
 
 
124 aa  115  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18440  predicted transcriptional regulator  70.67 
 
 
108 aa  114  5e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.347123 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4496  putative transcriptional regulator, ArsR family  51.96 
 
 
113 aa  114  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.698258  normal  0.92567 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1856  transcriptional regulator, ArsR family  54.37 
 
 
137 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0222  transcriptional regulator, ArsR family  51.46 
 
 
116 aa  110  5e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3223  regulatory protein, ArsR  52.83 
 
 
122 aa  110  5e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.741691  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2695  regulatory protein ArsR  54.74 
 
 
123 aa  110  9e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.260827  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  56.99 
 
 
125 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0131  ArsR family transcriptional regulator  55.91 
 
 
125 aa  107  4.0000000000000004e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000212185 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12660  ArsR family transcriptional regulator  49.53 
 
 
126 aa  107  5e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000762014  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20610  transcriptional regulator, ArsR family  54.95 
 
 
121 aa  105  1e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26420  transcriptional regulator, ArsR family  61.11 
 
 
109 aa  105  2e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.169574 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31180  transcriptional regulator, ArsR family  47.93 
 
 
121 aa  105  2e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6418  transcriptional regulator, ArsR family  46.96 
 
 
124 aa  105  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  50.98 
 
 
127 aa  104  5e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1441  ArsR family transcriptional regulator  48.57 
 
 
120 aa  103  8e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.541049 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2949  regulatory protein, ArsR  46.9 
 
 
126 aa  103  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.394398  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4523  ArsR family transcriptional regulator  50.51 
 
 
125 aa  103  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4967  putative transcriptional regulator, ArsR family  48 
 
 
115 aa  102  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.968943  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4610  ArsR family transcriptional regulator  50.51 
 
 
125 aa  103  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4906  ArsR family transcriptional regulator  50.51 
 
 
125 aa  103  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  54.17 
 
 
119 aa  102  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  54.35 
 
 
183 aa  102  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4613  ArsR family transcriptional regulator  51.04 
 
 
120 aa  99.8  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.296682 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1722  transcriptional regulator, ArsR family  54.74 
 
 
116 aa  98.2  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.416614 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 
104 aa  98.2  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8614  transcriptional regulator, ArsR family  51.55 
 
 
123 aa  98.2  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00781131  normal  0.130567 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  51.58 
 
 
123 aa  97.8  4e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8609  transcriptional regulator, ArsR family  47.96 
 
 
118 aa  97.4  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.498066 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5418  transcriptional regulator, ArsR family  48.48 
 
 
124 aa  95.1  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0794  regulatory protein ArsR  57.33 
 
 
120 aa  94  6e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2685  regulatory protein ArsR  57.33 
 
 
120 aa  93.6  8e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0240981  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5422  transcriptional regulator, ArsR family  45.92 
 
 
112 aa  92  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.424313 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0590  transcriptional regulator, ArsR family  41.38 
 
 
117 aa  90.9  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.506747 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4499  putative transcriptional regulator, ArsR family  48.81 
 
 
105 aa  90.5  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0367  transcriptional regulator, ArsR family  48.31 
 
 
337 aa  89.7  1e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3175  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 
126 aa  89  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.164371  hitchhiker  0.000124748 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14660  protein-tyrosine-phosphatase  50.65 
 
 
336 aa  87.4  5e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3653  transcriptional regulator, ArsR family  54.41 
 
 
347 aa  85.9  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0711  ArsR family transcriptional regulator  68.52 
 
 
68 aa  84.7  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.265588 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0388  transcriptional regulator, ArsR family  44.68 
 
 
349 aa  84.7  4e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2662  transcriptional regulator, ArsR family  51.43 
 
 
337 aa  81.6  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0788  regulatory protein ArsR  42.45 
 
 
120 aa  82  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0112  ArsR family transcriptional regulator  45.56 
 
 
119 aa  80.1  0.000000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2579  transcriptional regulator, ArsR family  48 
 
 
120 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3014  ArsR family transcriptional regulator  44.9 
 
 
119 aa  77.8  0.00000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0824395  normal  0.0135705 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0822  ArsR family transcriptional regulator  42.2 
 
 
118 aa  77  0.00000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3045  ArsR family transcriptional regulator  44.9 
 
 
119 aa  77  0.00000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2999  ArsR family transcriptional regulator  44.9 
 
 
130 aa  77  0.00000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2679  regulatory protein ArsR  41.94 
 
 
120 aa  76.3  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00320886  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1223  regulatory protein, ArsR  41.3 
 
 
131 aa  76.3  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0337905  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3210  arsenical resistence operon repressor ArsR  39.47 
 
 
101 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.14764  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3189  arsenical resistance operon repressor  40.79 
 
 
101 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2901  arsenical resistance operon repressor  39.47 
 
 
101 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1291  ArsR family transcriptional regulator  39.53 
 
 
121 aa  75.5  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000700515  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3224  arsenical resistance operon repressor  39.47 
 
 
101 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.336922  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3326  transcriptional regulator, ArsR family  44.58 
 
 
115 aa  75.5  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2974  arsenical resistance operon repressor  39.47 
 
 
101 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00402764  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2966  arsenical resistance operon repressor  39.47 
 
 
101 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0446  ArsR family transcriptional regulator  39.58 
 
 
107 aa  75.1  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.613441  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1847  ArsR family transcriptional regulator  45.88 
 
 
105 aa  75.1  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  hitchhiker  0.006299  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3199  arsenical resistance operon repressor  39.47 
 
 
101 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0264  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
114 aa  75.1  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.88486  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2922  ArsR family transcriptional regulator  39.47 
 
 
101 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0200183  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11041  regulatory proteins, ArsR family protein  52 
 
 
92 aa  74.7  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.74054 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3204  arsenical resistance operon repressor  39.47 
 
 
101 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2774  ArsR family transcriptional regulator  45 
 
 
108 aa  74.3  0.0000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.111393  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0315  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
103 aa  73.9  0.0000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0726  ArsR family transcriptional regulator  44.12 
 
 
90 aa  74.3  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.676551  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11581  ArsR family regulatory protein  39.58 
 
 
107 aa  73.9  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0535916 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2059  arsenical resistance operon repressor  39.47 
 
 
101 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  41.3 
 
 
117 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2322  transcriptional regulator, ArsR family  49.25 
 
 
111 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5377  transcriptional regulator, ArsR family  48.1 
 
 
109 aa  72.4  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0576  transcriptional regulator, ArsR family  37.18 
 
 
108 aa  72.4  0.000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00300248  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2373  transcriptional regulator, ArsR family  49.25 
 
 
111 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000354964  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12351  ArsR family regulatory protein  42.03 
 
 
90 aa  72.4  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2310  ArsR family transcriptional regulator  39.78 
 
 
121 aa  72  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3429  transcriptional regulator, ArsR family  47.44 
 
 
108 aa  71.6  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.336331  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2290  transcription repressor SmtB-like protein  43.02 
 
 
119 aa  70.9  0.000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0771617  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3471  regulatory protein, ArsR  42 
 
 
135 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.508363 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3114  transcriptional regulator, ArsR family  37.84 
 
 
110 aa  70.5  0.000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.114989  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1211  transcriptional regulator, ArsR family  39.51 
 
 
117 aa  70.1  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2588  putative cadmium resistance transcriptional regulator CadC  41.86 
 
 
119 aa  69.7  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1191  transcriptional regulator, ArsR family  39.13 
 
 
105 aa  68.9  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000014482  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>