122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0441 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0441  carotenoid oxygenase  100 
 
 		 460 aa  951    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.786971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5477  putative carotenoid oxygenase  55.02 
 
 		 467 aa  474  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1216  carotenoid oxygenase  52.08 
 
 		 467 aa  455  1e-127  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.548821 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1317  carotenoid oxygenase  51.74 
 
 		 467 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1401  Carotenoid oxygenase  50.65 
 
 		 467 aa  455  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1536  carotenoid oxygenase  50.98 
 
 		 467 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0771367  normal  0.379655 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5644  carotenoid oxygenase  53.61 
 
 		 478 aa  442  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.427984 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2656  carotenoid oxygenase  45.63 
 
 		 477 aa  416  9.999999999999999e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5950  crocetin dialdehyde  37.79 
 
 		 488 aa  314  1.9999999999999998e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.444357  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3710  retinal pigment epithelial membrane protein  38.51 
 
 		 463 aa  313  5.999999999999999e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4841  Carotenoid oxygenase  36.96 
 
 		 464 aa  306  4.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.659326 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0802  carotenoid oxygenase  37.26 
 
 		 494 aa  300  3e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.957651  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3794  carotenoid oxygenase  35.62 
 
 		 464 aa  276  4e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0662225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2047  retinal pigment epithelial membrane protein  34.96 
 
 		 765 aa  273  7e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.211058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1332  carotenoid oxygenase  37.89 
 
 		 444 aa  261  1e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.447717 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5235  carotenoid oxygenase  36.64 
 
 		 451 aa  261  2e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.751022 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4867  carotenoid oxygenase  36.34 
 
 		 451 aa  259  1e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4956  carotenoid oxygenase  36.34 
 
 		 451 aa  259  1e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1535  9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase  34.86 
 
 		 483 aa  254  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.194369  normal  0.146884 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07062  conserved hypothetical protein  34.1 
 
 		 555 aa  250  4e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5460  carotenoid oxygenase  36.29 
 
 		 459 aa  249  6e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.645484 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0281  carotenoid oxygenase  36.54 
 
 		 445 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.772775  hitchhiker  0.000581153 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3399  retinal pigment epithelial membrane protein  37.83 
 
 		 443 aa  243  5e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.452417  normal  0.802561 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2806  carotenoid oxygenase  36.54 
 
 		 445 aa  242  1e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.561211  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0300  carotenoid oxygenase  36.54 
 
 		 445 aa  242  1e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.473918  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3580  carotenoid oxygenase  36.75 
 
 		 469 aa  237  4e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2809  carotenoid oxygenase  34.92 
 
 		 497 aa  235  1.0000000000000001e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.220593  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2111  carotenoid oxygenase  34.86 
 
 		 480 aa  231  1e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.457029 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0227  carotenoid oxygenase  36.46 
 
 		 445 aa  232  1e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000205038 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5723  9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase  35.18 
 
 		 441 aa  231  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00560936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0219  carotenoid oxygenase  36.46 
 
 		 445 aa  230  4e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2484  9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase  34.75 
 
 		 461 aa  229  8e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.217647  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01643  lignostilbene dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G01500)  33.68 
 
 		 480 aa  221  3e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.600702  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3058  carotenoid 9,10-9',10' cleavage dioxygenase, putative  36.3 
 
 		 443 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1562  putative dioxygenase  36.3 
 
 		 443 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1233  putative carotenoid 9,10-9',10' cleavage dioxygenase  36.3 
 
 		 443 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0130033  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0635  putative carotenoid 9,10-9',10' cleavage dioxygenase  36.3 
 
 		 443 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.617766  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1459  putative carotenoid 9,10-9',10' cleavage dioxygenase  36.3 
 
 		 443 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0518  putative carotenoid 9,10-9',10' cleavage dioxygenase  36.3 
 
 		 443 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.615695  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0352  Carotenoid oxygenase  28.57 
 
 		 487 aa  216  8e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0935  Carotenoid oxygenase  29.27 
 
 		 488 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.934106 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1428  putative carotenoid 9,10-9',10' cleavage dioxygenase  35.87 
 
 		 443 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0359  Carotenoid oxygenase  28.85 
 
 		 487 aa  212  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.235865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4222  Carotenoid oxygenase  33.26 
 
 		 501 aa  210  5e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0865656 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4595  carotenoid oxygenase  32.53 
 
 		 479 aa  207  3e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1698  carotenoid oxygenase  34.13 
 
 		 480 aa  207  5e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.459113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0611  carotenoid oxygenase  32.85 
 
 		 481 aa  202  9.999999999999999e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.951978 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4402  9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase  29.62 
 
 		 495 aa  202  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000371573 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2946  9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase  32.14 
 
 		 473 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000652034  hitchhiker  0.000168571 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4340  Carotenoid oxygenase  29.2 
 
 		 495 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4053  Carotenoid oxygenase  31.4 
 
 		 466 aa  200  3e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10667  dioxygenase  32.15 
 
 		 501 aa  201  3e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.181912  normal  0.435726 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2446  twin-arginine translocation pathway signal  31.7 
 
 		 517 aa  199  7e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000341259  normal  0.858746 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0203  carotenoid oxygenase  32.33 
 
 		 464 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.297924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0449  Carotenoid oxygenase  28.88 
 
 		 491 aa  197  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3417  dioxygenase, putative  31.56 
 
 		 509 aa  195  1e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1236  retinal pigment epithelial membrane protein  28.25 
 
 		 510 aa  196  1e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0229916  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4033  Carotenoid oxygenase  32.53 
 
 		 508 aa  193  6e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.804116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3919  Carotenoid oxygenase  32.53 
 
 		 508 aa  193  6e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3212  carotenoid oxygenase  29.32 
 
 		 489 aa  189  5.999999999999999e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.415925  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6035  carotenoid oxygenase  31.77 
 
 		 479 aa  188  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.96012  normal  0.0939223 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0196  Beta-carotene 15,15'-dioxygenase  30.38 
 
 		 493 aa  187  4e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3269  9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase  32.84 
 
 		 419 aa  186  6e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3118  carotenoid oxygenase  31.32 
 
 		 496 aa  186  9e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.704266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3098  carotenoid oxygenase  31.47 
 
 		 496 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3158  carotenoid oxygenase  31.47 
 
 		 496 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.350488 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1008  carotenoid oxygenase  27.43 
 
 		 498 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0158946  normal  0.495511 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3944  Carotenoid oxygenase  31.84 
 
 		 481 aa  179  8e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05214  dioxygenase signal peptide protein  31.96 
 
 		 520 aa  179  9e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1272  carotenoid oxygenase  30.51 
 
 		 487 aa  177  3e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.261404  hitchhiker  0.00803245 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119472  Carotenoid dioxygenase plastidic fusion protein, putative  29.07 
 
 		 914 aa  175  9.999999999999999e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0452333  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10931  dioxygenase  30.25 
 
 		 502 aa  173  5e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3952  Carotenoid oxygenase  32.33 
 
 		 499 aa  171  4e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.273513  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03071  retinal pigment epithelial membrane protein  28.54 
 
 		 495 aa  169  7e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1807  carotenoid oxygenase  31.42 
 
 		 512 aa  168  2e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.581411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4940  carotenoid oxygenase  30.1 
 
 		 537 aa  164  3e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.97423  normal  0.0157069 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0221  lignostilbene-alpha,beta-dioxygenase and related enzyme-like  30.3 
 
 		 488 aa  164  4.0000000000000004e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3359  carotenoid oxygenase  29.28 
 
 		 502 aa  162  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.120702  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0013  Carotenoid oxygenase  26.65 
 
 		 468 aa  160  6e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.768827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0015  Carotenoid oxygenase  26.65 
 
 		 468 aa  160  6e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3964  Carotenoid oxygenase  27.43 
 
 		 486 aa  159  9e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.99286  normal  0.591573 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25111  retinal pigment epithelial membrane protein  30.11 
 
 		 507 aa  159  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_3050  predicted protein  28.33 
 
 		 467 aa  158  2e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.601284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1646  retinal pigment epithelial membrane protein  26.6 
 
 		 497 aa  156  6e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03601  retinal pigment epithelial membrane protein  26.33 
 
 		 497 aa  155  1e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0248  lignostilbene-alpha,beta-dioxygenase and related enzyme-like  28.35 
 
 		 489 aa  153  5e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2168  retinal pigment epithelial membrane protein  27.07 
 
 		 472 aa  145  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.123356 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2824  carotenoid oxygenase  29.87 
 
 		 504 aa  142  9.999999999999999e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03131  retinal pigment epithelial membrane protein  28.43 
 
 		 495 aa  140  3e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.608355  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0282  retinal pigment epithelial membrane protein  27.48 
 
 		 494 aa  140  6e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0182948  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5321  Carotenoid oxygenase  27.75 
 
 		 477 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03041  retinal pigment epithelial membrane protein  27.48 
 
 		 494 aa  137  5e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03031  retinal pigment epithelial membrane protein  26.72 
 
 		 494 aa  136  8e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4862  Beta-carotene 15,15'-monooxygenase  28.35 
 
 		 470 aa  136  9e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.169022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3052  carotenoid oxygenase  26.4 
 
 		 515 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1322  carotenoid oxygenase  26.67 
 
 		 556 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487019 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3688  carotenoid oxygenase  25.43 
 
 		 485 aa  128  2.0000000000000002e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0091  Carotenoid oxygenase  28.08 
 
 		 477 aa  127  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.848261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30717  predicted protein  26.24 
 
 		 533 aa  128  3e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.990452 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5459  Carotenoid oxygenase  27.33 
 
 		 514 aa  128  3e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176097  normal  0.349671 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>