More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2408 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_2408  CheW protein  100 
 
 
152 aa  300  4.0000000000000003e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.492759  normal  0.123205 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0039  putative CheW protein  46.67 
 
 
154 aa  128  3e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4203  CheW protein  49.28 
 
 
163 aa  125  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.017726  normal  0.169541 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  35.21 
 
 
163 aa  94.7  3e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  32.06 
 
 
170 aa  91.7  4e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1525  CheW protein  34.07 
 
 
152 aa  89.4  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.361906  normal  0.649363 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1734  CheW protein  34.93 
 
 
163 aa  90.1  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3155  CheW protein  33.81 
 
 
164 aa  85.9  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1992  CheW domain protein  29.93 
 
 
169 aa  85.5  3e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0722  CheW protein  38.32 
 
 
143 aa  85.1  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1106  CheW protein  33.81 
 
 
164 aa  84.3  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2324  CheW protein  37.29 
 
 
144 aa  83.6  8e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1078  CheW protein  34.75 
 
 
160 aa  83.6  9e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.603821  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1135  CheW protein  34.65 
 
 
145 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2991  putative CheW protein  35.25 
 
 
169 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.5403  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2421  CheW protein  32.14 
 
 
178 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.726921  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0635  CheW protein  36.69 
 
 
162 aa  82.4  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1142  purine-binding chemotaxis protein CheW  30.82 
 
 
164 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0223438  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  28.68 
 
 
183 aa  80.9  0.000000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  31.25 
 
 
161 aa  80.5  0.000000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  32.58 
 
 
168 aa  80.1  0.000000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0992  CheW protein  30 
 
 
162 aa  80.1  0.000000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0071906  normal  0.764949 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  28.97 
 
 
159 aa  80.1  0.000000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1609  CheW protein  30.94 
 
 
157 aa  80.1  0.000000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0995  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  32.56 
 
 
157 aa  79.7  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000995513  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0644  CheW protein  35.97 
 
 
162 aa  79.7  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.35775  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2186  CheW protein  38.39 
 
 
194 aa  79.7  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0684  purine-binding chemotaxis protein CheW  30 
 
 
164 aa  79  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260325  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  30.23 
 
 
164 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2986  putative CheW protein  32.19 
 
 
162 aa  79  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.344963  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0659  CheW protein  34.69 
 
 
161 aa  79  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.575233  normal  0.716686 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04752  chemotaxis protein  32.14 
 
 
171 aa  78.6  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.841581  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0610  CheW protein  35.25 
 
 
162 aa  78.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  28.68 
 
 
164 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30980  CheW protein  31.85 
 
 
139 aa  77.8  0.00000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  30.3 
 
 
168 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0751  CheW protein  32.09 
 
 
169 aa  77.8  0.00000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  34.19 
 
 
159 aa  77.8  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0744  CheW protein  41.98 
 
 
155 aa  77.4  0.00000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1381  CheW protein  35.33 
 
 
181 aa  77.4  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.916051  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  34.07 
 
 
165 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3300  putative CheW protein  28.78 
 
 
160 aa  77.4  0.00000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  34.07 
 
 
165 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0876  CheW protein  33.33 
 
 
164 aa  77.4  0.00000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000145541  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2027  CheW protein  33.08 
 
 
163 aa  77.4  0.00000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2817  CheW protein  32.33 
 
 
141 aa  77.4  0.00000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  29.46 
 
 
163 aa  77  0.00000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  29.46 
 
 
161 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  32 
 
 
163 aa  77  0.00000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1299  purine-binding chemotaxis protein CheW  29.17 
 
 
164 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.125322  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2220  chemotaxis protein CheW  30.43 
 
 
159 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  29.46 
 
 
163 aa  76.6  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0637  CheW protein  35.07 
 
 
150 aa  76.6  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.424922  normal  0.132097 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1763  CheW protein  36.61 
 
 
191 aa  76.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1795  putative CheW protein  33.79 
 
 
152 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2309  CheW protein  31.85 
 
 
238 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  27.01 
 
 
162 aa  75.5  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  28.28 
 
 
163 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  31.4 
 
 
164 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1692  CheW protein  36.61 
 
 
191 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0484464  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3653  CheW protein  27.97 
 
 
167 aa  75.9  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1301  purine-binding chemotaxis protein CheW  29.29 
 
 
164 aa  75.5  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.278999  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  28.68 
 
 
164 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  28.68 
 
 
164 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  28.68 
 
 
164 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  28.68 
 
 
164 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  33.33 
 
 
189 aa  75.1  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  28.68 
 
 
164 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1198  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  26.21 
 
 
158 aa  74.7  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.841781  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0575  CheW protein  32.43 
 
 
164 aa  75.1  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.447704  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3419  putative CheW protein  29.46 
 
 
163 aa  75.1  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.48741  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  27.91 
 
 
164 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0491  CheW protein  30 
 
 
154 aa  74.7  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0779  CheW protein  31.93 
 
 
165 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3029  CheW protein  31.78 
 
 
163 aa  74.3  0.0000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0654  putative CheW protein  38.76 
 
 
169 aa  74.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.119082  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  29.41 
 
 
158 aa  74.7  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2572  CheW protein  34.67 
 
 
185 aa  74.7  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0320  CheW protein  29.63 
 
 
160 aa  74.3  0.0000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  28.46 
 
 
165 aa  74.3  0.0000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2476  CheW protein  34.67 
 
 
185 aa  74.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100144  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  29.46 
 
 
164 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  29.46 
 
 
159 aa  74.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2648  CheW protein  30.94 
 
 
163 aa  74.3  0.0000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.34231  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  29.46 
 
 
159 aa  74.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  29.46 
 
 
159 aa  74.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  29.46 
 
 
159 aa  74.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3603  CheW protein  34.4 
 
 
139 aa  74.3  0.0000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.861446  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2796  putative CheW protein  28.68 
 
 
159 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153028  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3144  putative CheW protein  31.3 
 
 
262 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2575  CheW protein  29.08 
 
 
156 aa  73.6  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256512  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2836  CheW protein  29.08 
 
 
156 aa  73.6  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0103385 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0280  CheW protein  33.04 
 
 
155 aa  73.9  0.0000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.128089  normal  0.922662 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00050  chemotaxis signal transduction protein  32.37 
 
 
160 aa  73.6  0.0000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1375  CheW protein  32.62 
 
 
194 aa  73.6  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  29.91 
 
 
158 aa  73.6  0.0000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0576  purine-binding chemotaxis protein  27.15 
 
 
180 aa  73.2  0.000000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1415  CheW protein  31.88 
 
 
154 aa  73.2  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  27.13 
 
 
161 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3920  CheW protein  26.12 
 
 
158 aa  73.2  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>