More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1769 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_1769  two component transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 
219 aa  432  1e-120  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.221401  normal  0.0578747 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  55.09 
 
 
223 aa  217  1e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2804  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.58 
 
 
216 aa  213  2e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  54.63 
 
 
222 aa  212  4e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1099  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.17 
 
 
213 aa  198  5e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04459  two-component system regulatory protein  50.23 
 
 
213 aa  197  7e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4064  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.77 
 
 
217 aa  195  4e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2171  two component LuxR family transcriptional regulator  49.07 
 
 
218 aa  194  8e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0762379  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1619  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.77 
 
 
234 aa  194  1e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2510  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.39 
 
 
217 aa  188  6e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1401  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.93 
 
 
217 aa  187  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5591  DNA-binding response regulator  45.83 
 
 
215 aa  186  3e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2028  two component LuxR family transcriptional regulator  47.69 
 
 
219 aa  186  3e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2511  two component LuxR family transcriptional regulator  47.2 
 
 
229 aa  186  3e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0214  two component LuxR family transcriptional regulator  45.79 
 
 
220 aa  185  4e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5535  DNA-binding response regulator  44.91 
 
 
215 aa  185  4e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4468  response regulator receiver protein  47.89 
 
 
219 aa  184  6e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0876299  normal  0.32237 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5540  DNA-binding response regulator  45.83 
 
 
215 aa  184  8e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6963  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.96 
 
 
225 aa  184  8e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.029709  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5506  DNA-binding response regulator  45.83 
 
 
215 aa  184  1e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5661  DNA-binding response regulator  45.83 
 
 
215 aa  184  1e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5263  DNA-binding response regulator  45.83 
 
 
215 aa  184  1e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.24037  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5108  response regulator  45.83 
 
 
215 aa  184  1e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00235048  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0951  LuxR family two component transcriptional regulator  48.84 
 
 
221 aa  184  1e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.392411  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5091  response regulator  45.83 
 
 
215 aa  184  1e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  45.5 
 
 
216 aa  183  2e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3654  two component LuxR family transcriptional regulator  46.7 
 
 
221 aa  182  2e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  2.10563e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0236  LuxR family two component transcriptional regulator  47 
 
 
218 aa  183  2e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1020  response regulator receiver  46.51 
 
 
218 aa  183  2e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.648692  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.02 
 
 
217 aa  182  3e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3244  response regulator receiver protein  47.69 
 
 
218 aa  182  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000568428  normal  0.332742 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5417  DNA-binding response regulator  44.91 
 
 
215 aa  181  5e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5205  two component LuxR family transcriptional regulator  44.04 
 
 
215 aa  181  7e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5304  response regulator receiver protein  46.51 
 
 
220 aa  181  9e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  42.06 
 
 
216 aa  181  9e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4860  two component LuxR family transcriptional regulator  47.89 
 
 
219 aa  181  1e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.452521  normal  0.0798716 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4115  response regulator receiver protein  48.85 
 
 
216 aa  181  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.071707  normal  0.0608108 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1363  two component LuxR family transcriptional regulator  43.46 
 
 
210 aa  179  3e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0039551  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1563  DNA-binding response regulator  43.46 
 
 
210 aa  179  3e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  9.42452e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1348  DNA-binding response regulator  43.46 
 
 
210 aa  179  3e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  4.40829e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1531  DNA-binding response regulator  43.46 
 
 
210 aa  179  3e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.64189e-24 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1601  DNA-binding response regulator  43.46 
 
 
210 aa  179  3e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  1.36266e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1322  response regulator  43.46 
 
 
210 aa  179  3e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.30192e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1457  DNA-binding response regulator  43.46 
 
 
210 aa  179  3e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  5.38049e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3359  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.95 
 
 
219 aa  179  4e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0172663  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3849  DNA-binding response regulator  42.99 
 
 
210 aa  178  5e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  3.08683e-08  hitchhiker  3.50245e-10 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1198  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.37 
 
 
225 aa  178  5e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.109916  normal  0.0247339 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8900  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.54 
 
 
221 aa  178  6e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.967084  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1160  two component LuxR family transcriptional regulator  42.79 
 
 
210 aa  178  6e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2325  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.87 
 
 
228 aa  178  7e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1938  two component LuxR family transcriptional regulator  40.28 
 
 
209 aa  177  8e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1972  response regulator receiver  40.28 
 
 
209 aa  177  8e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3639  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.87 
 
 
215 aa  177  9e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.274763  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0857  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.65 
 
 
219 aa  177  1e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0762303  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1495  DNA-binding response regulator  42.79 
 
 
210 aa  177  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  1.74821e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8412  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.66 
 
 
239 aa  177  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1903  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.44 
 
 
225 aa  177  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.202425  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21900  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  49.54 
 
 
230 aa  176  2e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00486265  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3768  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.93 
 
 
223 aa  176  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.28303  normal  0.763501 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.33 
 
 
213 aa  176  2e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0094  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.52 
 
 
233 aa  176  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0277195 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2458  response regulator receiver  46.48 
 
 
220 aa  176  3e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0554598  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1321  response regulator  42.99 
 
 
210 aa  176  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  3.32221e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2042  two component LuxR family transcriptional regulator  41.43 
 
 
208 aa  174  6e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0315  two component LuxR family transcriptional regulator  45.97 
 
 
214 aa  175  6e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0084678 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03540  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  46.51 
 
 
226 aa  174  7e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0609  response regulator receiver protein  43.69 
 
 
218 aa  173  1e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0671  putative response regulator  42.26 
 
 
248 aa  174  1e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.248332  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  46.3 
 
 
234 aa  173  1e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7161  two component LuxR family transcriptional regulator  46.76 
 
 
225 aa  173  2e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0588186  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4937  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.54 
 
 
224 aa  173  2e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.570807  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7105  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.99 
 
 
241 aa  173  2e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106023  normal  0.469545 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4902  response regulator receiver  46.01 
 
 
216 aa  173  2e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.443208  normal  0.676579 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2737  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.91 
 
 
227 aa  172  2e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418014  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2302  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.75 
 
 
226 aa  173  2e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0191252  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1550  two component LuxR family transcriptional regulator  46.26 
 
 
220 aa  172  3e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0356  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.51 
 
 
220 aa  172  3e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165726  normal  0.0985551 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2809  two component LuxR family transcriptional regulator  44.13 
 
 
219 aa  172  4e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1355  two component LuxR family transcriptional regulator  47.17 
 
 
230 aa  172  4e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2842  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.3 
 
 
226 aa  171  5e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.622781  decreased coverage  0.00305681 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0262  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.01 
 
 
225 aa  172  5e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0721339  normal  0.623073 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3240  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.33 
 
 
224 aa  171  7e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3804  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 
216 aa  171  7e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.185264  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2557  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.87 
 
 
224 aa  171  8e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.0978001 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1998  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.98 
 
 
225 aa  171  1e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.12496  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1846  LuxR family two component transcriptional regulator  45.41 
 
 
226 aa  171  1e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.699471  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4217  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.83 
 
 
225 aa  170  1e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000816589  normal  0.757819 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0676  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.5 
 
 
215 aa  170  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4275  two component LuxR family transcriptional regulator  47.42 
 
 
226 aa  170  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.798613  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1910  response regulator receiver protein  44.13 
 
 
226 aa  171  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238062  normal  0.36963 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2486  two component LuxR family transcriptional regulator  46.95 
 
 
208 aa  169  2e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7812  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.91 
 
 
227 aa  170  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0544  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.8 
 
 
215 aa  170  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4652  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.48 
 
 
219 aa  169  3e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0949639  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4080  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.76 
 
 
241 aa  169  3e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.858367 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3185  two component LuxR family transcriptional regulator  46.05 
 
 
223 aa  169  3e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1316  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.19 
 
 
210 aa  169  3e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3028  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.54 
 
 
225 aa  169  4e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  decreased coverage  2.66978e-05 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2635  response regulator receiver  44.39 
 
 
207 aa  169  4e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1863  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.19 
 
 
216 aa  169  4e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  5.48978e-06  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>