More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0119 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_0119  UDP-glucose 4-epimerase  100 
 
 
328 aa  672    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.500269  hitchhiker  0.00370533 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2654  UDP-glucose 4-epimerase  75.08 
 
 
329 aa  509  1e-143  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.933262  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1509  UDP-glucose 4-epimerase  74.46 
 
 
326 aa  503  1e-141  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0386563  normal  0.0493544 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2205  UDP-glucose 4-epimerase  65.44 
 
 
327 aa  455  1e-127  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1771  UDP-glucose 4-epimerase  63.91 
 
 
328 aa  434  1e-121  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.333176  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2693  UDP-glucose 4-epimerase  60.06 
 
 
327 aa  398  9.999999999999999e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212619  normal  0.400076 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20680  UDP-glucose 4-epimerase  58.39 
 
 
328 aa  375  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0282  UDP-glucose 4-epimerase  54.71 
 
 
328 aa  367  1e-100  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0273  UDP-glucose 4-epimerase  54.41 
 
 
328 aa  363  2e-99  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0186  UDP-galactose 4-epimerase  53.94 
 
 
354 aa  361  1e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.347724  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2084  UDP-glucose 4-epimerase  55.38 
 
 
328 aa  359  3e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212461  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1166  UDP-glucose 4-epimerase  52.89 
 
 
330 aa  358  6e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1662  UDP-glucose 4-epimerase  51.66 
 
 
330 aa  358  7e-98  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1702  UDP-galactose 4-epimerase  54.98 
 
 
331 aa  354  1e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.189185 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1088  UDP-glucose 4-epimerase  54.88 
 
 
329 aa  350  2e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1369  UDP-glucose 4-epimerase  51.81 
 
 
333 aa  349  4e-95  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0537  UDP-glucose 4-epimerase  53.85 
 
 
328 aa  348  8e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0940  UDP-glucose 4-epimerase  50.91 
 
 
327 aa  348  8e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4306  UDP-glucose 4-epimerase  55.28 
 
 
324 aa  348  1e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0064009  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3237  UDP-glucose 4-epimerase  52.25 
 
 
328 aa  345  4e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.218159  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0339  UDP-galactose 4-epimerase  50.45 
 
 
331 aa  339  2.9999999999999998e-92  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1352  UDP-glucose 4-epimerase  51.52 
 
 
329 aa  338  9e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1183  UDP-glucose 4-epimerase  51.83 
 
 
351 aa  336  3.9999999999999995e-91  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.119771  normal  0.642661 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1923  UDP-glucose 4-epimerase  48.34 
 
 
331 aa  334  1e-90  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1068  UDP-galactose 4-epimerase  47.73 
 
 
334 aa  332  6e-90  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.715245  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0668  UDP-glucose 4-epimerase  53.48 
 
 
319 aa  330  2e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0718222 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5380  UDP-glucose 4-epimerase  50.46 
 
 
330 aa  329  3e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5434  UDP-glucose 4-epimerase  50.46 
 
 
330 aa  330  3e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5354  UDP-glucose 4-epimerase  50.15 
 
 
330 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4945  UDP-glucose 4-epimerase  50.15 
 
 
330 aa  328  5.0000000000000004e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4960  UDP-glucose 4-epimerase  50.15 
 
 
330 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00145973  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5056  UDP-glucose 4-epimerase  49.54 
 
 
330 aa  328  7e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0284  UDP-galactose 4-epimerase  48.04 
 
 
330 aa  327  1.0000000000000001e-88  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.555091  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5114  UDP-glucose 4-epimerase  49.85 
 
 
330 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5505  UDP-glucose 4-epimerase  49.85 
 
 
330 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.678064  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4242  UDP-glucose 4-epimerase  52.63 
 
 
332 aa  326  3e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4205  UDP-glucose 4-epimerase  53.27 
 
 
318 aa  326  3e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0647  UDP-glucose 4-epimerase  49.39 
 
 
334 aa  323  2e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.52379 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4455  UDP-glucose 4-epimerase  49.54 
 
 
330 aa  322  4e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000044018  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1950  UDP-glucose 4-epimerase  49.24 
 
 
328 aa  321  9.000000000000001e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00010158  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1261  UDP-glucose 4-epimerase  52.5 
 
 
321 aa  321  9.999999999999999e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.992711 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1463  UDP-glucose 4-epimerase  51.74 
 
 
320 aa  320  1.9999999999999998e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.612123  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2242  UDP-galactose 4-epimerase  49.39 
 
 
326 aa  318  7e-86  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1324  UDP-glucose 4-epimerase  45.92 
 
 
330 aa  314  9.999999999999999e-85  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1555  UDP-glucose 4-epimerase  45.92 
 
 
330 aa  314  9.999999999999999e-85  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2299  UDP-glucose 4-epimerase  49.07 
 
 
332 aa  313  1.9999999999999998e-84  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1957  UDP-galactose 4-epimerase  48.92 
 
 
332 aa  311  7.999999999999999e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.880811  normal  0.626313 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4279  UDP-galactose 4-epimerase  48.45 
 
 
333 aa  310  2e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.277879  normal  0.0248708 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1402  UDP-galactose 4-epimerase  47.43 
 
 
332 aa  310  2e-83  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.232119  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1064  UDP-glucose 4-epimerase  49.69 
 
 
328 aa  309  4e-83  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27520  UDP-galactose 4-epimerase  52.04 
 
 
321 aa  308  6.999999999999999e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4409  UDP-glucose 4-epimerase  50.16 
 
 
316 aa  308  9e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4141  UDP-glucose 4-epimerase  50.31 
 
 
332 aa  308  9e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0043  UDP-glucose 4-epimerase  46.89 
 
 
337 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0769  UDP-glucose 4-epimerase  50.62 
 
 
329 aa  308  1.0000000000000001e-82  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.953207  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4827  UDP-glucose 4-epimerase  49.54 
 
 
329 aa  307  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.321852  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0041  UDP-glucose 4-epimerase  46.58 
 
 
337 aa  306  3e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0608  UDP-glucose 4-epimerase  48.77 
 
 
324 aa  305  5.0000000000000004e-82  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000293819  hitchhiker  0.00261597 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3289  UDP-glucose 4-epimerase  47.31 
 
 
330 aa  305  6e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4181  UDP-glucose 4-epimerase  50 
 
 
332 aa  305  9.000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1830  UDP-glucose 4-epimerase  47.95 
 
 
327 aa  304  2.0000000000000002e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.352077  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5423  UDP-glucose 4-epimerase  48.92 
 
 
328 aa  302  4.0000000000000003e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0946684  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1465  UDP-glucose 4-epimerase  49.07 
 
 
323 aa  302  7.000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000880176  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1089  UDP-glucose 4-epimerase  48.76 
 
 
323 aa  301  1e-80  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1708  UDP-glucose 4-epimerase  48.92 
 
 
331 aa  299  3e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.380668  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0320  UDP-galactose 4-epimerase  48.45 
 
 
332 aa  299  4e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2916  UDP-glucose 4-epimerase  47.55 
 
 
320 aa  298  8e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.660815 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4249  UDP-galactose 4-epimerase  46.48 
 
 
327 aa  297  2e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.444052 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1676  UDP-galactose 4-epimerase  50.16 
 
 
329 aa  295  5e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000240695 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2187  UDP-galactose 4-epimerase  48.92 
 
 
327 aa  295  7e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2242  UDP-glucose 4-epimerase  46.27 
 
 
334 aa  291  9e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.558956  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0576  UDP-glucose 4-epimerase  45.87 
 
 
325 aa  288  6e-77  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1342  UDP-glucose 4-epimerase  50.15 
 
 
332 aa  288  1e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0739  UDP-glucose 4-epimerase  49.23 
 
 
327 aa  287  2e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209358  hitchhiker  0.00614298 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0322  UDP-glucose 4-epimerase  45.23 
 
 
326 aa  285  7e-76  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1807  UDP-glucose 4-epimerase  46.63 
 
 
324 aa  285  9e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1125  UDP-glucose 4-epimerase  45.17 
 
 
329 aa  283  4.0000000000000003e-75  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.333219  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2411  UDP-galactose 4-epimerase  46.2 
 
 
333 aa  283  4.0000000000000003e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.016358  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0418  UDP-glucose 4-epimerase  43.77 
 
 
326 aa  281  9e-75  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1573  UDP-galactose 4-epimerase  43.73 
 
 
328 aa  281  9e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  1.52654e-16 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2493  UDP-glucose 4-epimerase  46.27 
 
 
350 aa  281  1e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4903  UDP-glucose 4-epimerase  47.8 
 
 
320 aa  280  3e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.027411  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0652  UDP-galactose 4-epimerase  45.54 
 
 
328 aa  277  2e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.276662  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0420  UDP-glucose 4-epimerase  47.68 
 
 
328 aa  277  2e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1081  UDP-glucose 4-epimerase  44.58 
 
 
321 aa  276  3e-73  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000142619  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2305  UDP-glucose 4-epimerase  45.23 
 
 
328 aa  276  4e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.738706  normal  0.125833 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3171  UDP-glucose 4-epimerase  47.35 
 
 
327 aa  275  7e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0137  UDP-glucose 4-epimerase  46.18 
 
 
356 aa  273  3e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.169815 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0163  UDP-galactose 4-epimerase  45.96 
 
 
331 aa  273  4.0000000000000004e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.507846  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0795  UDP-glucose 4-epimerase  48.62 
 
 
327 aa  271  2e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0517  UDP-glucose 4-epimerase  44.89 
 
 
325 aa  270  2e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.171515  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1776  UDP-glucose 4-epimerase  44.38 
 
 
330 aa  270  2e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.098997  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2250  UDP-glucose 4-epimerase  44.62 
 
 
321 aa  269  5e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1224  UDP-glucose 4-epimerase  44.68 
 
 
328 aa  268  8.999999999999999e-71  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00236591  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3065  UDP-glucose 4-epimerase  44.58 
 
 
328 aa  268  1e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2726  UDP-glucose 4-epimerase  46.32 
 
 
324 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00760058  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3471  UDP-glucose 4-epimerase  44.14 
 
 
330 aa  267  2e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1249  UDP-glucose 4-epimerase  41.34 
 
 
328 aa  267  2e-70  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0208  UDP-glucose 4-epimerase  46.2 
 
 
328 aa  266  4e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163102  normal  0.146368 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2586  UDP-glucose 4-epimerase  46.63 
 
 
321 aa  266  4e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>