More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5208 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_5208  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
432 aa  823  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377398  normal  0.900425 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0534  hypothetical protein  38.06 
 
 
412 aa  220  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5551  major facilitator superfamily MFS_1  37.56 
 
 
420 aa  205  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138486  normal  0.597938 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0062  putative membrane transport protein  37.53 
 
 
418 aa  203  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.640827  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3061  major facilitator superfamily MFS_1  35.09 
 
 
429 aa  202  1e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00310805  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1864  major facilitator transporter  34.31 
 
 
417 aa  198  1e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.436032 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4585  putative membrane transport protein  37.09 
 
 
403 aa  195  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00668253  normal  0.163129 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4138  major facilitator superfamily MFS_1  38.17 
 
 
435 aa  187  4e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.496821  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0062  major facilitator superfamily protein  38.04 
 
 
431 aa  186  6e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.378864  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0805  major facilitator superfamily MFS_1  31.25 
 
 
459 aa  177  4e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3679  major facilitator superfamily MFS_1  37.3 
 
 
410 aa  175  2e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.709991  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0801  major facilitator superfamily MFS_1  35.48 
 
 
442 aa  174  3e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.469185 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0885  major facilitator transporter  35.16 
 
 
415 aa  163  6e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4617  major facilitator superfamily MFS_1  31.88 
 
 
455 aa  139  7e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.117227  hitchhiker  0.000601374 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1940  putative transporter  29.34 
 
 
420 aa  137  5e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  5.31086e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1864  putative transporter  28.85 
 
 
420 aa  135  1e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.42079e-47 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1062  major facilitator superfamily MFS_1  34.16 
 
 
423 aa  135  1e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.264864  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1630  transporter  29.34 
 
 
420 aa  134  2e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1819  transporter  28.61 
 
 
420 aa  135  2e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000952932  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1684  transporter  28.61 
 
 
420 aa  135  2e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3515  putative transporter  28.99 
 
 
420 aa  134  4e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1892  transporter, putative  29.24 
 
 
420 aa  134  4e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166254  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1827  putative transporter  28.43 
 
 
420 aa  133  5e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4528  major facilitator superfamily MFS_1  29.8 
 
 
409 aa  122  1e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.392098 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1486  major facilitator transporter  29.76 
 
 
420 aa  122  2e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.467645  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  29.29 
 
 
432 aa  114  2e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0427  transporter, putative  22.76 
 
 
412 aa  107  5e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0532  major facilitator superfamily MFS_1  29.31 
 
 
428 aa  105  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0210  major facilitator superfamily MFS_1  28.97 
 
 
476 aa  104  4e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0098  major facilitator superfamily MFS_1  27 
 
 
428 aa  103  6e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5814  major facilitator superfamily MFS_1  24.33 
 
 
423 aa  97.8  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.915234  hitchhiker  0.00491963 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1693  major facilitator superfamily MFS_1  28.89 
 
 
422 aa  97.4  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00531073  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  26.64 
 
 
424 aa  97.8  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7122  MFS permease  29.69 
 
 
426 aa  97.4  5e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  29.17 
 
 
447 aa  97.1  6e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  28.87 
 
 
446 aa  96.7  7e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2679  major facilitator superfamily MFS_1  27.95 
 
 
453 aa  95.5  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  3.22743e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  23.34 
 
 
405 aa  95.1  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4580  H+ antiporter protein  28.2 
 
 
443 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.120622 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  23.34 
 
 
405 aa  95.1  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2289  major facilitator transporter  29.6 
 
 
432 aa  94  4e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.995339  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0768  major facilitator superfamily MFS_1  28.21 
 
 
456 aa  94  4e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  30 
 
 
450 aa  94  5e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  26.06 
 
 
421 aa  93.6  6e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3596  major facilitator superfamily MFS_1  27.66 
 
 
417 aa  93.2  8e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4887  major facilitator superfamily MFS_1  29.29 
 
 
424 aa  90.9  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4301  H+ antiporter protein  27.15 
 
 
424 aa  90.5  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.100469  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4147  H+ antiporter protein  27.15 
 
 
424 aa  90.5  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  27.23 
 
 
418 aa  90.5  5e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2024  major facilitator superfamily MFS_1  25.27 
 
 
419 aa  90.5  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  27.94 
 
 
474 aa  90.1  7e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1662  major facilitator superfamily MFS_1  22.73 
 
 
405 aa  89.4  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0310  major facilitator transporter  27.68 
 
 
443 aa  88.6  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1670  protein of unknown function DUF894 DitE  29.52 
 
 
532 aa  89  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0165754  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14790  Major Facilitator Superfamily transporter  26.6 
 
 
464 aa  88.2  3e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.13794 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0746  hypothetical protein  26.33 
 
 
431 aa  88.2  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0165656  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11210  major facilitator superfamily MFS_1  24.48 
 
 
433 aa  87.8  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3756  major facilitator superfamily MFS_1  25.19 
 
 
409 aa  87.4  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  30.24 
 
 
412 aa  87.4  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  22.7 
 
 
1833 aa  87.4  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2511  ABC transporter, permease protein, putative  23.2 
 
 
414 aa  87.4  5e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00150223  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  28.19 
 
 
412 aa  87  5e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0691  major facilitator transporter  29.53 
 
 
428 aa  87  6e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.877498 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  28.53 
 
 
413 aa  86.7  7e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1339  major facilitator superfamily MFS_1  30.6 
 
 
429 aa  86.7  8e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3626  major facilitator transporter  31.28 
 
 
413 aa  85.9  1e-15  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.348332  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1539  major facilitator transporter  24.24 
 
 
412 aa  85.1  2e-15  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  1.51531e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5212  major facilitator superfamily MFS_1  26.58 
 
 
408 aa  85.1  2e-15  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0948922  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1813  major facilitator superfamily permease  23.08 
 
 
410 aa  84.3  3e-15  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1572  major facilitator transporter  31.47 
 
 
415 aa  84.7  3e-15  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.58248  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2514  major facilitator superfamily MFS_1  26.9 
 
 
439 aa  84.7  3e-15  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1327  major facilitator superfamily MFS_1  27.99 
 
 
433 aa  84.3  4e-15  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2501  putative ABC transporter, permease protein  22.71 
 
 
415 aa  84.3  4e-15  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2286  major facilitator transporter  22.22 
 
 
414 aa  84  5e-15  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0407537  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  25.18 
 
 
433 aa  84  5e-15  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2227  permease; macrolide-efflux protein  22.73 
 
 
417 aa  84  5e-15  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0120958  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0762  protein of unknown function DUF894, DitE  30.94 
 
 
560 aa  84  5e-15  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.446257 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4461  H+ antiporter protein  28.89 
 
 
414 aa  83.2  9e-15  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1663  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  30.86 
 
 
209 aa  82.8  1e-14  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1928  major facilitator superfamily MFS_1  26.63 
 
 
414 aa  82.8  1e-14  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0688885  normal  0.183583 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0369  major facilitator transporter  23.36 
 
 
418 aa  82.8  1e-14  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.616869  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8802  major facilitator superfamily MFS_1  28.83 
 
 
405 aa  82  2e-14  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.953446 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1224  major facilitator superfamily MFS_1  27.19 
 
 
440 aa  81.6  2e-14  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2273  permease; macrolide-efflux protein  22.71 
 
 
417 aa  82  2e-14  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00046211  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2435  putative ABC transporter, permease protein  21.76 
 
 
414 aa  81.6  2e-14  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.70932  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3926  major facilitator transporter  28.62 
 
 
457 aa  81.6  2e-14  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  24.11 
 
 
440 aa  82  2e-14  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0536  major facilitator superfamily MFS_1  27.34 
 
 
432 aa  82  2e-14  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.187699  hitchhiker  1.7573e-05 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2302  major facilitator superfamily MFS_1  30.85 
 
 
390 aa  82  2e-14  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  2.6904e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3970  protein of unknown function DUF894 DitE  28.97 
 
 
535 aa  81.3  3e-14  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  27.85 
 
 
418 aa  81.3  3e-14  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1388  hypothetical protein  26.98 
 
 
404 aa  80.9  4e-14  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1012  protein of unknown function DUF894, DitE  31.74 
 
 
409 aa  80.9  4e-14  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.171336 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0181  major facilitator superfamily MFS_1  27.71 
 
 
401 aa  80.9  4e-14  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1118  major facilitator superfamily MFS_1  25.13 
 
 
406 aa  80.9  4e-14  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5468  protein of unknown function DUF894 DitE  29.43 
 
 
535 aa  80.5  5e-14  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  28.72 
 
 
441 aa  80.5  5e-14  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0867  putative membrane transport protein  33.08 
 
 
321 aa  80.9  5e-14  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  27.97 
 
 
474 aa  80.1  6e-14  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  25.57 
 
 
436 aa  80.5  6e-14  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>