More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3177 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_3177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  100 
 
 
519 aa  1018    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.706315  hitchhiker  0.000232213 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2757  EmrB/QacA family drug resistance transporter  62.12 
 
 
500 aa  542  1e-153  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4243  EmrB/QacA family drug resistance transporter  63.34 
 
 
504 aa  503  1e-141  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.891003  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0255  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  55.27 
 
 
487 aa  484  1e-135  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7473  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  57.26 
 
 
514 aa  476  1e-133  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4425  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  51.27 
 
 
788 aa  458  9.999999999999999e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0371338  normal  0.193177 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0402  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  50.4 
 
 
509 aa  417  9.999999999999999e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15496  normal  0.237492 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1038  major facilitator superfamily MFS_1  54.92 
 
 
506 aa  412  1e-114  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0766  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  50.71 
 
 
499 aa  399  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.176707 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7839  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  47.15 
 
 
505 aa  379  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0757914 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14840  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  50.66 
 
 
512 aa  378  1e-103  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.038471 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.79 
 
 
487 aa  372  1e-101  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.31571 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.65 
 
 
508 aa  366  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.208526 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1611  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  50.93 
 
 
503 aa  367  1e-100  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4088  major facilitator superfamily MFS_1  48.61 
 
 
501 aa  364  2e-99  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.246435 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6944  EmrB/QacA family drug resistance transporter  52.02 
 
 
498 aa  362  7.0000000000000005e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.419184 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5593  major facilitator superfamily MFS_1  50.32 
 
 
499 aa  360  4e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5131  major facilitator superfamily MFS_1  47.9 
 
 
487 aa  355  7.999999999999999e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.22804  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43.97 
 
 
498 aa  350  5e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4141  major facilitator superfamily MFS_1  44.26 
 
 
486 aa  347  4e-94  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0412  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  47.26 
 
 
499 aa  344  2e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.758903  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3988  major facilitator transporter  48.74 
 
 
482 aa  330  3e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.958906 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8633  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  46.47 
 
 
488 aa  328  1.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0776  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  45.45 
 
 
488 aa  323  3e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000908237 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5012  major facilitator transporter  43.25 
 
 
490 aa  318  2e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.675946  normal  0.0652477 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.58 
 
 
763 aa  315  9.999999999999999e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.164946  normal  0.060075 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3442  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.11 
 
 
530 aa  314  2.9999999999999996e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.477749  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4256  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  48.07 
 
 
519 aa  308  1.0000000000000001e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.278944 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0447  major facilitator superfamily MFS_1  49.64 
 
 
470 aa  304  2.0000000000000002e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00443315 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1130  major facilitator superfamily MFS_1  43.37 
 
 
491 aa  304  2.0000000000000002e-81  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5562  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.24 
 
 
493 aa  303  5.000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3979  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.51 
 
 
527 aa  300  4e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1233  putative transmembrane efflux protein  45.32 
 
 
505 aa  300  6e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7966  major facilitator superfamily MFS_1  40.34 
 
 
487 aa  290  3e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1215  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.95 
 
 
553 aa  278  2e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.117259 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4824  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.49 
 
 
519 aa  276  7e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5575  major facilitator superfamily MFS_1  45.88 
 
 
469 aa  275  1.0000000000000001e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7047  putative transmembrane efflux protein  37.45 
 
 
492 aa  275  1.0000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0500177  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7577  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.26 
 
 
487 aa  275  2.0000000000000002e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0346  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.29 
 
 
490 aa  275  2.0000000000000002e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.149604 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.12 
 
 
501 aa  271  2.9999999999999997e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3343  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.36 
 
 
534 aa  270  5.9999999999999995e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00960  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.69 
 
 
475 aa  270  5.9999999999999995e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5573  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.22 
 
 
474 aa  269  7e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5556  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.86 
 
 
489 aa  267  4e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0798171  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.58 
 
 
479 aa  265  2e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.384361 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3835  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.91 
 
 
496 aa  261  2e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7424  major facilitator superfamily MFS_1  35.97 
 
 
494 aa  260  5.0000000000000005e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0782  putative transmembrane efflux protein  38.46 
 
 
470 aa  259  9e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000700007 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.82 
 
 
478 aa  258  2e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2254  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.59 
 
 
507 aa  255  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0213589 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1704  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.21 
 
 
757 aa  255  2.0000000000000002e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0947  major facilitator transporter  40.4 
 
 
483 aa  249  9e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.289424  normal  0.783186 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3935  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.9 
 
 
479 aa  248  1e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000976381 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2666  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.33 
 
 
487 aa  247  3e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.608352  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1705  major facilitator superfamily MFS_1  35.64 
 
 
733 aa  247  4e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2443  major facilitator transporter  35.57 
 
 
481 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0756  permease of the major facilitator superfamily  37.29 
 
 
497 aa  246  9e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9044  putative transmembrane efflux protein  38.68 
 
 
492 aa  246  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0362  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.18 
 
 
479 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0845  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.18 
 
 
479 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.880414  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4046  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37 
 
 
543 aa  245  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2075  major facilitator transporter  36.98 
 
 
529 aa  243  5e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0542399  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2121  major facilitator superfamily transporter  36.98 
 
 
529 aa  243  5e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.360369  normal  0.0488476 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2058  major facilitator transporter  36.98 
 
 
529 aa  243  5e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.283059  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0817  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.59 
 
 
479 aa  243  9e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278156  normal  0.800505 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2306  major facilitator superfamily transporter  36.67 
 
 
543 aa  241  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0864673  normal  0.0994822 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2144  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.81 
 
 
520 aa  238  2e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.434739  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4079  major facilitator transporter  36.9 
 
 
470 aa  237  3e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0276069  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4492  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.11 
 
 
487 aa  236  5.0000000000000005e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44231  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.45 
 
 
522 aa  235  1.0000000000000001e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.42 
 
 
522 aa  235  1.0000000000000001e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4552  putative transmembrane efflux protein  38.65 
 
 
454 aa  235  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.739035  normal  0.395452 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0312  major facilitator superfamily MFS_1  39.1 
 
 
485 aa  235  1.0000000000000001e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.116628 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.93 
 
 
502 aa  234  3e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4568  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.3 
 
 
482 aa  232  1e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.411532 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3496  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.3 
 
 
482 aa  232  1e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.152282  normal  0.192769 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1486  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.96 
 
 
482 aa  231  3e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.527824  normal  0.420653 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2004  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.86 
 
 
506 aa  230  5e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.331322 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1042  putative membrane transport protein  35.82 
 
 
498 aa  230  5e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.010302  normal  0.0110823 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4413  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.39 
 
 
497 aa  230  5e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.504324  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3703  permease of the major facilitator superfamily  39.71 
 
 
477 aa  230  6e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805067  normal  0.0440675 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8232  major facilitator superfamily MFS_1  36.82 
 
 
513 aa  229  8e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2307  major facilitator superfamily transporter  35.08 
 
 
508 aa  229  9e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.018174  normal  0.0567456 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3555  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.53 
 
 
583 aa  229  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4154  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.06 
 
 
516 aa  227  5.0000000000000005e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232645  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1424  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.77 
 
 
548 aa  226  7e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.589759  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3195  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.53 
 
 
480 aa  226  9e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.88533  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3141  drug resistance MFS transporter  40.53 
 
 
480 aa  225  1e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3178  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.53 
 
 
480 aa  225  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4328  major facilitator transporter  37.69 
 
 
482 aa  224  2e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.192705  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1483  drug resistance MFS transporter  39.63 
 
 
480 aa  225  2e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0906  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.27 
 
 
510 aa  225  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.0779201 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12861  integral membrane efflux protein efpA  36.62 
 
 
530 aa  224  2e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0945731  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.29 
 
 
480 aa  224  3e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.189888  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0891  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.29 
 
 
480 aa  224  3e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.175912  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2724  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.29 
 
 
480 aa  224  3e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1885  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.29 
 
 
480 aa  224  3e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0004  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.63 
 
 
480 aa  224  4e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.53 
 
 
528 aa  224  4e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>