More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3115 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_3115  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
584 aa  1186    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4261  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.86 
 
 
563 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4273  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.04 
 
 
563 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1727  AMP-dependent synthetase and ligase  49.81 
 
 
551 aa  508  9.999999999999999e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00049699  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4634  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.86 
 
 
582 aa  508  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4653  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.76 
 
 
561 aa  503  1e-141  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4422  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.86 
 
 
563 aa  502  1e-141  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841946  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4638  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.86 
 
 
582 aa  503  1e-141  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0827  AMP-dependent synthetase and ligase  45.54 
 
 
566 aa  502  1e-141  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.86 
 
 
563 aa  502  1e-141  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491645  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0601  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.4 
 
 
561 aa  503  1e-141  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4654  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.58 
 
 
561 aa  503  1e-141  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3226  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.47 
 
 
561 aa  499  1e-140  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4354  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.23 
 
 
561 aa  501  1e-140  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2629  AMP-dependent synthetase and ligase  43.45 
 
 
557 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0494506  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1597  AMP-dependent synthetase and ligase  45.19 
 
 
549 aa  489  1e-137  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000318079  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0108  AMP-dependent synthetase and ligase  43.62 
 
 
569 aa  479  1e-134  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.824706  normal  0.320607 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1611  AMP-dependent synthetase and ligase  43.34 
 
 
584 aa  475  1e-133  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.187495  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0256  AMP-dependent synthetase and ligase  43.85 
 
 
583 aa  476  1e-133  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0139167 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2963  AMP-dependent synthetase and ligase  42.6 
 
 
551 aa  474  1e-132  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000191926  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1784  AMP-dependent synthetase and ligase  43.5 
 
 
590 aa  473  1e-132  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1070  AMP-dependent synthetase and ligase  45.12 
 
 
565 aa  473  1e-132  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0635723  normal  0.557335 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2084  AMP-dependent synthetase and ligase  43.15 
 
 
591 aa  472  1e-132  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3345  AMP-dependent synthetase and ligase  42.71 
 
 
577 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.305311  hitchhiker  0.00000703503 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3583  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.88 
 
 
583 aa  469  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1592  AMP-dependent synthetase and ligase  44.11 
 
 
561 aa  465  1e-129  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185317  normal  0.745369 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1803  AMP-dependent synthetase and ligase  42.19 
 
 
539 aa  463  1e-129  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1756  AMP-dependent synthetase and ligase  42.96 
 
 
564 aa  462  1e-129  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.598576 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2221  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.93 
 
 
562 aa  462  1e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.202713 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1185  AMP-dependent synthetase and ligase  47.64 
 
 
569 aa  456  1e-127  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.609931 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1593  AMP-dependent synthetase and ligase  43.09 
 
 
559 aa  457  1e-127  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0495218 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2616  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  46.22 
 
 
568 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4351  AMP-dependent synthetase and ligase  42.39 
 
 
578 aa  454  1.0000000000000001e-126  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1626  AMP-dependent synthetase and ligase  41.58 
 
 
573 aa  449  1e-125  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3638  AMP-dependent synthetase and ligase  42.23 
 
 
543 aa  449  1e-125  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0228  AMP-dependent synthetase and ligase  44.78 
 
 
558 aa  446  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2082  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.56 
 
 
562 aa  444  1e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.126939  normal  0.0929922 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1725  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.94 
 
 
585 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00134138  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1253  AMP-dependent synthetase and ligase  40.97 
 
 
585 aa  437  1e-121  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17930  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  44.48 
 
 
574 aa  435  1e-120  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.849454 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3455  AMP-dependent synthetase and ligase  40.7 
 
 
583 aa  431  1e-119  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0889  AMP-dependent synthetase and ligase  42.83 
 
 
560 aa  425  1e-118  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0278278 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1757  AMP-dependent synthetase and ligase  40.22 
 
 
554 aa  423  1e-117  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.384408  normal  0.62754 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1327  AMP-dependent synthetase and ligase  44.19 
 
 
571 aa  421  1e-116  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1312  AMP-dependent synthetase and ligase  40.44 
 
 
564 aa  420  1e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.384847  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2791  AMP-dependent synthetase and ligase  40.11 
 
 
575 aa  417  9.999999999999999e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.444002 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0371  AMP-dependent synthetase and ligase  39.82 
 
 
544 aa  416  9.999999999999999e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00566676  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1738  AMP-dependent synthetase and ligase  39.41 
 
 
549 aa  417  9.999999999999999e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0121059  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0337  AMP-dependent synthetase and ligase  41.21 
 
 
577 aa  413  1e-114  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.238028  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1973  AMP-dependent synthetase and ligase  43.12 
 
 
553 aa  407  1.0000000000000001e-112  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.935913  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4440  AMP-dependent synthetase and ligase  41.93 
 
 
549 aa  394  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00251188 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2778  putative long chain fatty-acid CoA ligase(long- chain acyl-CoA synthetase)  40.45 
 
 
604 aa  389  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.422591  normal  0.203216 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0839  AMP-dependent synthetase and ligase  38.06 
 
 
577 aa  389  1e-107  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1435  AMP-dependent synthetase and ligase  36.88 
 
 
577 aa  389  1e-106  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0654989  normal  0.0257553 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1672  AMP-dependent synthetase and ligase  39.48 
 
 
601 aa  385  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.455088 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4746  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.81 
 
 
563 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2684  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.24 
 
 
567 aa  384  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.503393 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0455  AMP-dependent synthetase and ligase  37.68 
 
 
579 aa  384  1e-105  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1323  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.33 
 
 
561 aa  383  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1510  AMP-dependent synthetase and ligase  39.69 
 
 
584 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.79948  hitchhiker  0.00072846 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1344  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.35 
 
 
572 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.77905 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2424  AMP-dependent synthetase and ligase  37.7 
 
 
567 aa  382  1e-104  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1054  AMP-dependent synthetase and ligase  39.52 
 
 
584 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.63665  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1534  AMP-dependent synthetase and ligase  39.52 
 
 
584 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2588  AMP-dependent synthetase and ligase  38.38 
 
 
591 aa  380  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.401336  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1052  AMP-dependent synthetase and ligase  36.86 
 
 
566 aa  375  1e-103  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.909575  hitchhiker  0.000208439 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4674  AMP-dependent synthetase and ligase  38.66 
 
 
584 aa  376  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0112629 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1416  AMP-dependent synthetase and ligase  38.87 
 
 
584 aa  375  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.498039  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1704  AMP-dependent synthetase and ligase  38.34 
 
 
599 aa  375  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.180137  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1456  AMP-dependent synthetase and ligase  38.87 
 
 
584 aa  375  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.877669  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.68 
 
 
514 aa  370  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0353  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase protein  38.41 
 
 
565 aa  372  1e-101  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.333466  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1720  AMP-dependent synthetase and ligase  38.53 
 
 
586 aa  372  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.976205  hitchhiker  0.000132971 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1398  AMP-dependent synthetase and ligase  36.61 
 
 
564 aa  372  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000129983 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0946  AMP-dependent synthetase and ligase  37.15 
 
 
559 aa  372  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0952  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.94 
 
 
563 aa  368  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.412461  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3950  AMP-dependent synthetase and ligase  37.46 
 
 
559 aa  367  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0302713  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3299  AMP-dependent synthetase and ligase  37.46 
 
 
559 aa  367  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2529  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.05 
 
 
590 aa  365  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.26444  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3734  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.77 
 
 
560 aa  369  1e-100  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.862355  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5859  AMP-dependent synthetase and ligase  35.9 
 
 
567 aa  363  5.0000000000000005e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1803  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.09 
 
 
590 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.911304  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1276  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.09 
 
 
590 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.011036  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1472  hypothetical protein  35.58 
 
 
569 aa  362  7.0000000000000005e-99  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1035  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.09 
 
 
590 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.526739  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1957  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.09 
 
 
590 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000391168  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2065  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.94 
 
 
561 aa  363  7.0000000000000005e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1782  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.09 
 
 
590 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.177104  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1764  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.09 
 
 
590 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0022418  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0394  AMP-dependent synthetase and ligase  35.93 
 
 
559 aa  363  7.0000000000000005e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0131  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.09 
 
 
590 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0305097  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00067  putative long-chain fatty acyl CoA ligase  38.31 
 
 
560 aa  362  1e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0959  AMP-dependent synthetase and ligase  36.41 
 
 
558 aa  361  2e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.336851  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1511  hypothetical protein  35.58 
 
 
569 aa  361  2e-98  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1553  AMP-dependent synthetase and ligase  36.65 
 
 
553 aa  361  2e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0143852  hitchhiker  0.00793845 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4074  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.1 
 
 
561 aa  361  2e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0428  AMP-dependent synthetase and ligase  37.35 
 
 
579 aa  361  2e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0627658  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1838  AMP-dependent synthetase and ligase  37.77 
 
 
583 aa  360  3e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0025116  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01763  hypothetical protein  37.77 
 
 
561 aa  361  3e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1893  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.77 
 
 
561 aa  361  3e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>