More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0171 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_0171  peptidyl-tRNA hydrolase  100 
 
 
198 aa  400  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8605  Aminoacyl-tRNA hydrolase  70.05 
 
 
201 aa  271  5.000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3951  peptidyl-tRNA hydrolase  65.99 
 
 
197 aa  266  2e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.72777  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3152  peptidyl-tRNA hydrolase  62.89 
 
 
209 aa  258  3e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.936943  normal  0.265918 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0653  peptidyl-tRNA hydrolase  67.2 
 
 
189 aa  253  1.0000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0782  peptidyl-tRNA hydrolase  63.02 
 
 
195 aa  247  9e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0912  peptidyl-tRNA hydrolase  61.46 
 
 
217 aa  245  2e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1220  peptidyl-tRNA hydrolase  65.43 
 
 
194 aa  242  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1000  peptidyl-tRNA hydrolase  67.55 
 
 
206 aa  242  3e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0735  aminoacyl-tRNA hydrolase  65.61 
 
 
196 aa  241  5e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0068065 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1292  peptidyl-tRNA hydrolase  61.78 
 
 
213 aa  241  7.999999999999999e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0791  aminoacyl-tRNA hydrolase  63.49 
 
 
196 aa  236  2e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1290  peptidyl-tRNA hydrolase  63.83 
 
 
196 aa  233  1.0000000000000001e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000493335 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32390  peptidyl-tRNA hydrolase  62.9 
 
 
199 aa  230  1e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.438107 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0417  peptidyl-tRNA hydrolase  62.3 
 
 
213 aa  226  2e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4550  peptidyl-tRNA hydrolase  63.16 
 
 
195 aa  222  3e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.9788 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0990  peptidyl-tRNA hydrolase  59.07 
 
 
199 aa  220  9.999999999999999e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.532871  hitchhiker  0.0022816 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30140  peptidyl-tRNA hydrolase  58.46 
 
 
202 aa  218  3e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.601869 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3987  peptidyl-tRNA hydrolase  63.73 
 
 
221 aa  218  6e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.819406  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1944  peptidyl-tRNA hydrolase  55.03 
 
 
196 aa  214  5.9999999999999996e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4633  peptidyl-tRNA hydrolase  56.15 
 
 
192 aa  211  5.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.557373 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4254  peptidyl-tRNA hydrolase  56.15 
 
 
192 aa  211  5.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4340  peptidyl-tRNA hydrolase  56.15 
 
 
192 aa  211  5.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.480593  normal  0.292105 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0914  peptidyl-tRNA hydrolase  60.85 
 
 
195 aa  207  6e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0822526  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1054  Aminoacyl-tRNA hydrolase  58.33 
 
 
198 aa  206  2e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4788  peptidyl-tRNA hydrolase  56.15 
 
 
192 aa  205  4e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140463  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05520  peptidyl-tRNA hydrolase  60.54 
 
 
191 aa  201  5e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1938  peptidyl-tRNA hydrolase  54.01 
 
 
192 aa  196  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18819  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03510  peptidyl-tRNA hydrolase  56.78 
 
 
202 aa  196  2.0000000000000003e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.584729 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3210  peptidyl-tRNA hydrolase  58.85 
 
 
194 aa  194  5.000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1940  peptidyl-tRNA hydrolase  54.04 
 
 
205 aa  194  9e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0884  peptidyl-tRNA hydrolase  56.22 
 
 
206 aa  191  7e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.202868 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11032  peptidyl-tRNA hydrolase  54.01 
 
 
191 aa  188  4e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2704  peptidyl-tRNA hydrolase  56.63 
 
 
202 aa  182  2.0000000000000003e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13420  peptidyl-tRNA hydrolase  58.42 
 
 
204 aa  178  4e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.1854  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2504  peptidyl-tRNA hydrolase  47.34 
 
 
188 aa  177  8e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00873234  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1538  peptidyl-tRNA hydrolase  50.54 
 
 
188 aa  172  1.9999999999999998e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03980  peptidyl-tRNA hydrolase  45.99 
 
 
185 aa  166  2e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.469192 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1729  peptidyl-tRNA hydrolase  46.03 
 
 
214 aa  165  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2760  peptidyl-tRNA hydrolase  45.45 
 
 
185 aa  164  6.9999999999999995e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1290  aminoacyl-tRNA hydrolase  43.62 
 
 
187 aa  163  2.0000000000000002e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0656  aminoacyl-tRNA hydrolase  43.52 
 
 
199 aa  162  4.0000000000000004e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1001  peptidyl-tRNA hydrolase  45.5 
 
 
217 aa  162  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2056  peptidyl-tRNA hydrolase  44.62 
 
 
214 aa  155  5.0000000000000005e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5260  peptidyl-tRNA hydrolase  40.32 
 
 
207 aa  154  6e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2121  Aminoacyl-tRNA hydrolase  42.78 
 
 
190 aa  154  7e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.062679 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0056  peptidyl-tRNA hydrolase  40.32 
 
 
207 aa  154  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0060  peptidyl-tRNA hydrolase  40.32 
 
 
207 aa  153  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0057  peptidyl-tRNA hydrolase  40.32 
 
 
207 aa  153  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1595  peptidyl-tRNA hydrolase  46.52 
 
 
192 aa  152  2e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0046  peptidyl-tRNA hydrolase  40.32 
 
 
186 aa  153  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  42.7 
 
 
186 aa  152  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0050  peptidyl-tRNA hydrolase  39.78 
 
 
186 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  39.78 
 
 
186 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0050  peptidyl-tRNA hydrolase  39.78 
 
 
186 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2073  peptidyl-tRNA hydrolase  42.93 
 
 
195 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1560  peptidyl-tRNA hydrolase  42.42 
 
 
201 aa  150  8.999999999999999e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0200988  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0049  peptidyl-tRNA hydrolase  39.78 
 
 
210 aa  150  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  40.32 
 
 
207 aa  150  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0070  aminoacyl-tRNA hydrolase  38.38 
 
 
183 aa  150  1e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21920  peptidyl-tRNA hydrolase  42.55 
 
 
190 aa  148  4e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00516718 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0778  peptidyl-tRNA hydrolase  41.45 
 
 
199 aa  149  4e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.881763  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0897  peptidyl-tRNA hydrolase  41.97 
 
 
230 aa  149  4e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.185924  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3500  peptidyl-tRNA hydrolase  41.94 
 
 
213 aa  148  5e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000021188 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0339  peptidyl-tRNA hydrolase  42.61 
 
 
179 aa  148  5e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0048  peptidyl-tRNA hydrolase  40.86 
 
 
186 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0591  peptidyl-tRNA hydrolase  41.71 
 
 
184 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00307137  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0119  peptidyl-tRNA hydrolase  42.7 
 
 
185 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000476771  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  38.83 
 
 
186 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1662  peptidyl-tRNA hydrolase  42.93 
 
 
225 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.107221  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2819  aminoacyl-tRNA hydrolase  40.43 
 
 
193 aa  145  4.0000000000000006e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112866  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0310  aminoacyl-tRNA hydrolase  41.62 
 
 
206 aa  145  4.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21210  Aminoacyl-tRNA hydrolase  38.83 
 
 
187 aa  145  5e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000292391  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0209  peptidyl-tRNA hydrolase  41.71 
 
 
196 aa  144  7.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0394  peptidyl-tRNA hydrolase  43.01 
 
 
192 aa  144  7.0000000000000006e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000248474  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2675  peptidyl-tRNA hydrolase  44.15 
 
 
186 aa  144  8.000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0489  peptidyl-tRNA hydrolase  43.72 
 
 
202 aa  142  2e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00415538 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0111  aminoacyl-tRNA hydrolase  38.1 
 
 
191 aa  142  3e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.212396  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1688  peptidyl-tRNA hydrolase  38.8 
 
 
189 aa  142  4e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0180  peptidyl-tRNA hydrolase  41.05 
 
 
191 aa  142  4e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0063  Aminoacyl-tRNA hydrolase  40.84 
 
 
207 aa  141  6e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000509944  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2631  peptidyl-tRNA hydrolase  40.93 
 
 
196 aa  140  9.999999999999999e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3516  Aminoacyl-tRNA hydrolase  42.86 
 
 
213 aa  140  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0382669  normal  0.238994 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0137  peptidyl-tRNA hydrolase  45.6 
 
 
192 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1510  Aminoacyl-tRNA hydrolase  36.96 
 
 
193 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0126  peptidyl-tRNA hydrolase  45.6 
 
 
192 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2483  peptidyl-tRNA hydrolase  47.83 
 
 
225 aa  139  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.697792  normal  0.152859 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1086  peptidyl-tRNA hydrolase  47.95 
 
 
192 aa  139  3e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0949  peptidyl-tRNA hydrolase  40.53 
 
 
216 aa  139  3e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.803923  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1354  peptidyl-tRNA hydrolase  40.96 
 
 
193 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0119  peptidyl-tRNA hydrolase  45.05 
 
 
192 aa  138  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1291  peptidyl-tRNA hydrolase  40.64 
 
 
204 aa  138  4.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.800618 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0824  peptidyl-tRNA hydrolase  47.28 
 
 
225 aa  138  6e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.705778  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2606  peptidyl-tRNA hydrolase  42.19 
 
 
202 aa  138  6e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.642317 
 
 
-
 
NC_002936  DET0595  peptidyl-tRNA hydrolase  39.27 
 
 
189 aa  137  7.999999999999999e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0675  peptidyl-tRNA hydrolase  41.67 
 
 
198 aa  137  7.999999999999999e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000361482  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0352  peptidyl-tRNA hydrolase  47.43 
 
 
225 aa  137  7.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.320411  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0637  peptidyl-tRNA hydrolase  37.16 
 
 
189 aa  137  1e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.205248  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0071  aminoacyl-tRNA hydrolase  43.55 
 
 
195 aa  137  1e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.287226  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1000  peptidyl-tRNA hydrolase  42.05 
 
 
193 aa  137  1e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.853012  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>