More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2086 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2374  selenide, water dikinase  98.54 
 
 
343 aa  682    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2086  selenide, water dikinase, selenocysteine-containing  100 
 
 
343 aa  691    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1661  selenide, water dikinase  57.65 
 
 
342 aa  418  1e-116  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3076  selenide, water dikinase  58.09 
 
 
347 aa  392  1e-108  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000815299 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0304  selenide, water dikinase  55.26 
 
 
347 aa  359  3e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.480411  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1241  selenide, water dikinase  56.21 
 
 
309 aa  348  6e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1486  selenide, water dikinase  50.58 
 
 
340 aa  341  1e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1625  selenophosphate synthase  51.07 
 
 
328 aa  340  2e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000489254  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2461  selenide, water dikinase (selenocysteine-containing)  50 
 
 
354 aa  327  3e-88  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000145839  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2542  selenophosphate synthase  51.53 
 
 
315 aa  325  1e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000270867  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1707  selenide, water dikinase  47.23 
 
 
348 aa  315  5e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0134481  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1535  selenide, water dikinase  50.65 
 
 
328 aa  313  1.9999999999999998e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000657698  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0811  selenide, water dikinase  49.4 
 
 
344 aa  311  1e-83  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0252  selenide, water dikinase  48.19 
 
 
352 aa  310  2.9999999999999997e-83  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0491527 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2761  selenide, water dikinase  50.5 
 
 
346 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.124113  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3526  selenide, water dikinase  46.55 
 
 
343 aa  305  5.0000000000000004e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4589  selenide, water dikinase  47.73 
 
 
340 aa  305  6e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2907  selenophosphate synthase  45.88 
 
 
343 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.547007  normal  0.430139 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3509  selenide, water dikinase  45.92 
 
 
355 aa  303  3.0000000000000004e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.502042  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0450  selenide, water dikinase  47.16 
 
 
354 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3445  selenide, water dikinase  45.62 
 
 
351 aa  300  3e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.413976  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3460  selenide, water dikinase  44.87 
 
 
343 aa  299  4e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3401  selenide, water dikinase  52.17 
 
 
317 aa  298  6e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0323823 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1116  selenophosphate synthase  48.69 
 
 
323 aa  298  7e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.418125  normal  0.456278 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2053  selenide, water dikinase  47.45 
 
 
343 aa  290  2e-77  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1736  selenide, water dikinase  45.61 
 
 
351 aa  290  2e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.298189  normal  0.96466 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3249  selenide, water dikinase  47.91 
 
 
316 aa  290  3e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0099  selenophosphate synthase  48.22 
 
 
320 aa  287  2e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.574229 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3427  selenide, water dikinase  45.08 
 
 
316 aa  287  2e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1228  selenide, water dikinase  50.51 
 
 
327 aa  286  2.9999999999999996e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0607  selenide, water dikinase, selenocysteine-containing  46.96 
 
 
345 aa  285  9e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0822  selenide, water dikinase  48.62 
 
 
326 aa  285  9e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.771892  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1684  selenide, water dikinase  48.53 
 
 
351 aa  281  8.000000000000001e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.815145 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25360  selenium donor protein  45.9 
 
 
314 aa  278  7e-74  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.592311 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0884  selenide, water dikinase  45.09 
 
 
344 aa  278  7e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000463593 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0362  selenide, water dikinase (possible start at 335663)  48.99 
 
 
320 aa  275  8e-73  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1677  selenide, water dikinase  44.12 
 
 
340 aa  273  3e-72  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.309519  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3849  selenide, water dikinase  44.44 
 
 
317 aa  271  1e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3363  selenophosphate synthase  44.7 
 
 
314 aa  270  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1754  selenophosphate synthetase  45.81 
 
 
357 aa  269  5e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.207511  normal  0.482616 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2036  selenide, water dikinase  46.36 
 
 
318 aa  269  5e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0154042  hitchhiker  0.000215589 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0830  selenophosphate synthase  44.17 
 
 
325 aa  269  5.9999999999999995e-71  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1753  selenide, water dikinase  42.68 
 
 
348 aa  268  1e-70  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1505  selenophosphate synthetase  46.35 
 
 
360 aa  268  1e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.252621  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11290  selenium donor protein  46.88 
 
 
321 aa  267  2e-70  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.327064 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0107  selenide, water dikinase  46.71 
 
 
350 aa  266  5e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.317143 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2802  selenide, water dikinase  42.56 
 
 
356 aa  264  1e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.543452  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3479  selenophosphate synthase  42.26 
 
 
356 aa  263  3e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.160372  normal  0.547237 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0844  selenide, water dikinase  41.76 
 
 
358 aa  261  1e-68  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000873496  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2746  selenide, water dikinase  45.9 
 
 
321 aa  260  2e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.201658  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1496  selenide, water dikinase  44.59 
 
 
308 aa  258  1e-67  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.258981  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4627  selenophosphate synthetase  42.69 
 
 
353 aa  258  2e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.173949  normal  0.0779363 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3367  selenophosphate synthetase  40.6 
 
 
357 aa  257  2e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1987  selenide, water dikinase  45.16 
 
 
319 aa  257  3e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4912  selenophosphate synthetase  40.6 
 
 
354 aa  256  3e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.462232  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5238  selenophosphate synthetase  41.19 
 
 
354 aa  256  3e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4708  selenophosphate synthetase  41.19 
 
 
357 aa  256  3e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.262495  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3008  selenophosphate synthetase  40.6 
 
 
357 aa  256  4e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5358  selenophosphate synthetase  40.6 
 
 
357 aa  256  4e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2225  selenophosphate synthase  46.67 
 
 
297 aa  255  8e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0368  selenide, water dikinase  43.24 
 
 
337 aa  255  8e-67  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0287  selenophosphate synthetase  40.3 
 
 
357 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1727  selenophosphate synthetase  42.41 
 
 
355 aa  254  2.0000000000000002e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000666487 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0228  selenophosphate synthetase  41.99 
 
 
347 aa  252  5.000000000000001e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0643475  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2052  selenophosphate synthetase  41.52 
 
 
357 aa  252  5.000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.752159  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2844  selenophosphate synthetase  45.13 
 
 
369 aa  252  7e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0196  selenophosphate synthetase  41.76 
 
 
352 aa  252  8.000000000000001e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2243  selenophosphate synthetase  41.74 
 
 
346 aa  252  8.000000000000001e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.466152  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0819  selenophosphate synthetase  40.42 
 
 
354 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.765639  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1473  selenophosphate synthetase  40.42 
 
 
354 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2116  selenophosphate synthetase  40.42 
 
 
389 aa  251  1e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113835  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2135  selenophosphate synthetase  40.42 
 
 
356 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0175  selenophosphate synthetase  41.99 
 
 
352 aa  250  2e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0170  selenophosphate synthetase  41.99 
 
 
352 aa  251  2e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0263017 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4080  selenophosphate synthetase  41.99 
 
 
352 aa  250  2e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0503  selenophosphate synthetase  40.12 
 
 
356 aa  250  3e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0173  selenophosphate synthetase  41.99 
 
 
352 aa  250  3e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0177  selenophosphate synthetase  41.99 
 
 
352 aa  250  3e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.248798 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4182  selenophosphate synthetase  41.99 
 
 
352 aa  249  4e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0955566  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0176  selenophosphate synthetase  41.99 
 
 
352 aa  249  4e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.984786  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1832  selenophosphate synthetase  40.12 
 
 
421 aa  249  5e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4341  selenophosphate synthetase  41.23 
 
 
346 aa  249  5e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00762353  hitchhiker  0.000113499 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0405  selenophosphate synthetase  40.12 
 
 
385 aa  249  5e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2198  selenophosphate synthetase  40.54 
 
 
389 aa  249  5e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.605066 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1061  selenophosphate synthase  45.42 
 
 
291 aa  247  2e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.309297  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3481  selenide, water dikinase  40.82 
 
 
671 aa  246  4e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.409241  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2860  selenide, water dikinase  40.42 
 
 
350 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0135  selenophosphate synthetase  40.76 
 
 
347 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.397327 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6563  selenophosphate synthetase  41.25 
 
 
358 aa  245  6e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.207959  hitchhiker  0.00495665 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3488  selenide, water dikinase  40.24 
 
 
359 aa  245  6.999999999999999e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4713  selenophosphate synthetase  40.35 
 
 
351 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.31309  normal  0.849821 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16910  selenophosphate synthase  41.94 
 
 
333 aa  244  1.9999999999999999e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.254595  normal  0.381057 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1345  selenide, water dikinase  38.84 
 
 
354 aa  244  1.9999999999999999e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5279  selenide, water dikinase  41.67 
 
 
335 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0606  selenide, water dikinase  39.19 
 
 
353 aa  242  7.999999999999999e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1778  selenide, water dikinase  39.67 
 
 
378 aa  242  7.999999999999999e-63  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2555  selenophosphate synthetase  41.84 
 
 
354 aa  241  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3543  selenophosphate synthetase  44.85 
 
 
352 aa  241  2e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3250  selenophosphate synthetase  42.07 
 
 
351 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.433054  normal  0.299232 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0284  selenophosphate synthase  41.94 
 
 
351 aa  239  4e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>