250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2007 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2292  heat-inducible transcription repressor  99.41 
 
 		 339 aa  675    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2007  heat-inducible transcription repressor  100 
 
 		 339 aa  678    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1324  heat-inducible transcription repressor HrcA  44.51 
 
 		 351 aa  292  6e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1800  heat-inducible transcription repressor HrcA  41.89 
 
 		 348 aa  275  6e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.478668  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1553  heat-inducible transcription repressor HrcA  40.12 
 
 		 343 aa  267  2e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000153808  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2499  heat-inducible transcription repressor HrcA  39.35 
 
 		 347 aa  265  5.999999999999999e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000196344  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1181  heat-inducible transcription repressor HrcA  41.19 
 
 		 343 aa  257  2e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00891806 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3224  heat-inducible transcription repressor HrcA  40.83 
 
 		 345 aa  253  4.0000000000000004e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00005295  hitchhiker  0.00493399 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0583  heat-inducible transcription repressor HrcA  37.94 
 
 		 344 aa  246  3e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2060  heat-inducible transcription repressor HrcA  38.71 
 
 		 344 aa  244  1.9999999999999999e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1011  heat-inducible transcription repressor  37.13 
 
 		 344 aa  243  3e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4301  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.69 
 
 		 345 aa  241  2e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2313  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.81 
 
 		 345 aa  238  1e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000876043  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2439  heat-inducible transcription repressor  35.96 
 
 		 344 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000794362  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2081  heat-inducible transcription repressor HrcA  38.44 
 
 		 343 aa  229  3e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12820  heat-inducible transcription repressor HrcA  39.05 
 
 		 347 aa  227  2e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.428207  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4215  heat-inducible transcription repressor  34.51 
 
 		 338 aa  226  3e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4541  heat-inducible transcription repressor  34.51 
 
 		 338 aa  226  3e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0123825  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4053  heat-inducible transcription repressor  34.51 
 
 		 338 aa  225  7e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00744253  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4338  heat-inducible transcription repressor  34.51 
 
 		 338 aa  225  7e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.3771500000000003e-32 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4063  heat-inducible transcription repressor  34.51 
 
 		 338 aa  225  8e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.526253  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4167  heat-inducible transcription repressor  33.92 
 
 		 338 aa  224  2e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00317032  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4435  heat-inducible transcription repressor  34.51 
 
 		 338 aa  223  4e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000489937  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4449  heat-inducible transcription repressor  34.22 
 
 		 338 aa  222  6e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000694366  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0801  heat-inducible transcription repressor  34.22 
 
 		 338 aa  222  6e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000436482  hitchhiker  4.70073e-19 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4397  heat-inducible transcription repressor  33.92 
 
 		 338 aa  220  3e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.332663  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3042  heat-inducible transcription repressor  34.62 
 
 		 343 aa  219  5e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00211057  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0604  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.05 
 
 		 343 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3253  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.72 
 
 		 337 aa  215  9e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.240463  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1581  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.47 
 
 		 341 aa  215  9.999999999999999e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00115825  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1333  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.81 
 
 		 343 aa  211  2e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000176294  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0209  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.06 
 
 		 343 aa  210  3e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000018934  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1150  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.52 
 
 		 340 aa  206  5e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.330335 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1998  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.43 
 
 		 344 aa  204  2e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.503074  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1034  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.94 
 
 		 348 aa  204  2e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00468429  hitchhiker  0.0007913 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0031  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.43 
 
 		 342 aa  203  3e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.820963  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3534  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.09 
 
 		 343 aa  202  8e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000167088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2831  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.43 
 
 		 344 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.304325  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1026  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.9 
 
 		 354 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0109  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.79 
 
 		 357 aa  197  3e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620435  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0305  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.47 
 
 		 342 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2289  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.96 
 
 		 337 aa  196  5.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1643  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.84 
 
 		 340 aa  194  2e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0701  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.95 
 
 		 337 aa  193  3e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3456  heat-inducible transcription repressor  30.09 
 
 		 351 aa  193  3e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.213022 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0838  heat-inducible transcription repressor  32.49 
 
 		 343 aa  192  5e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.197604  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1168  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.63 
 
 		 337 aa  189  4e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1241  heat-inducible transcription repressor  31.36 
 
 		 340 aa  189  4e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000248464  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1406  heat-inducible transcription repressor HrcA  30 
 
 		 343 aa  190  4e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2549  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.34 
 
 		 357 aa  189  5.999999999999999e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.330864 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3836  heat-inducible transcription repressor  30.06 
 
 		 340 aa  189  7e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0984898  decreased coverage  0.000187974 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1264  heat-inducible transcription repressor  32.22 
 
 		 339 aa  188  1e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00809958 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4466  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.95 
 
 		 353 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.769802  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4485  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.95 
 
 		 353 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1903  heat-inducible transcription repressor  30.41 
 
 		 337 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.518414  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1550  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.1 
 
 		 339 aa  184  1.0000000000000001e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2109  heat-inducible transcription repressor  31.88 
 
 		 339 aa  184  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4476  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.41 
 
 		 354 aa  183  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.457422 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2701  heat-inducible transcription repressor  30.35 
 
 		 343 aa  183  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0906704  normal  0.605466 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3576  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.4 
 
 		 343 aa  182  6e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3507  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.01 
 
 		 343 aa  182  7e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.848963  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4330  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.78 
 
 		 355 aa  182  7e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.22068  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7058  heat-inducible transcription repressor  30.38 
 
 		 343 aa  182  7e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0930  heat-inducible transcription repressor  30.32 
 
 		 342 aa  181  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3244  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.05 
 
 		 347 aa  181  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.488784  normal  0.0534413 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3163  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.65 
 
 		 344 aa  179  4e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3837  heat-inducible transcription repressor  29.65 
 
 		 343 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.833698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3406  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.49 
 
 		 346 aa  178  1e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13430  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.06 
 
 		 341 aa  178  1e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.272128 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0458  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.24 
 
 		 351 aa  177  2e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.482284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13540  heat-inducible transcription repressor  30.7 
 
 		 341 aa  177  2e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1195  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.32 
 
 		 355 aa  177  3e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.300554 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0620  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.24 
 
 		 337 aa  177  3e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000107992  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2164  heat-inducible transcription repressor HrcA  30 
 
 		 355 aa  176  4e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.705839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1162  heat-inducible transcription repressor  29.38 
 
 		 360 aa  176  5e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3460  heat-inducible transcription repressor  29.02 
 
 		 347 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0783  heat-inducible transcription repressor  30.56 
 
 		 339 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0540401 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3523  heat-inducible transcription repressor  29.02 
 
 		 347 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0346852  normal  0.41387 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3471  heat-inducible transcription repressor  29.02 
 
 		 347 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00335096 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0443  heat-inducible transcription repressor  33.11 
 
 		 372 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0786222  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0102  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.36 
 
 		 363 aa  173  2.9999999999999996e-42  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.354305  normal  0.141179 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2210  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.45 
 
 		 340 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.867098  hitchhiker  0.00537893 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1571  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.15 
 
 		 340 aa  172  5e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.27159  hitchhiker  0.00683488 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1457  heat-inducible transcription repressor  28.02 
 
 		 349 aa  172  6.999999999999999e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0770785  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0901  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.61 
 
 		 345 aa  172  7.999999999999999e-42  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0905  heat-inducible transcription repressor  30.03 
 
 		 334 aa  172  7.999999999999999e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4335  heat-inducible transcription repressor  31.61 
 
 		 336 aa  171  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1514  heat-inducible transcription repressor  27.73 
 
 		 349 aa  170  3e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0847  heat-inducible transcription repressor  29.74 
 
 		 334 aa  170  3e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.617842  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1772  heat-inducible transcription repressor  31.53 
 
 		 336 aa  170  3e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12399  heat-inducible transcription repressor  28.57 
 
 		 343 aa  170  4e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1648  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.3 
 
 		 337 aa  169  5e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.685607  normal  0.0242929 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0909  heat-inducible transcription repressor  32.12 
 
 		 337 aa  169  6e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.185567  normal  0.427859 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10320  heat shock gene repressor HrcA  30.99 
 
 		 336 aa  169  7e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.319867  unclonable  0.00000000169449 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1086  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.06 
 
 		 350 aa  168  1e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0111351  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5123  heat-inducible transcription repressor  28.21 
 
 		 364 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.779513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0732  heat-inducible transcription repressor  30.52 
 
 		 339 aa  168  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5456  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.82 
 
 		 340 aa  167  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01183  heat-inducible transcription repressor  26.98 
 
 		 343 aa  167  2e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.180018  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1303  heat-inducible transcription repressor  31.63 
 
 		 338 aa  167  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.480706 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>