221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0843 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0843  glycosy hydrolase family protein  100 
 
 		 502 aa  1031    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00330381  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1469  glycoside hydrolase family 31  44.88 
 
 		 527 aa  451  1e-125  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000732278  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1712  glycoside hydrolase family 31  38.39 
 
 		 533 aa  401  9.999999999999999e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000051017  normal  0.0363963 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1770  glycoside hydrolase family 31  37.96 
 
 		 515 aa  389  1e-107  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.134766  normal  0.116734 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0259  glycoside hydrolase family 31  34.52 
 
 		 631 aa  269  8.999999999999999e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0820064 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45442  predicted protein  34.43 
 
 		 430 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000628338  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4334  glycoside hydrolase family protein  31.62 
 
 		 616 aa  251  3e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.638626  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38421  predicted protein  31.35 
 
 		 559 aa  201  3e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0452022  hitchhiker  0.000596343 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2416  alpha-glucosidase  26.56 
 
 		 760 aa  134  3e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl317  alpha glucosidase/alpha-xylosidase  27.1 
 
 		 752 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000639186  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1288  Alpha-glucosidase  25.71 
 
 		 765 aa  125  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1613  putative alpha-glucosidase  25.06 
 
 		 765 aa  124  4e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0503092  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1692  Alpha-glucosidase  27.84 
 
 		 743 aa  119  1.9999999999999998e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.90141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0490  glycoside hydrolase family 31  26.56 
 
 		 757 aa  117  6.9999999999999995e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_429  predicted protein  25 
 
 		 815 aa  116  7.999999999999999e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0318632  normal  0.136701 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1902  Alpha-glucosidase  23.98 
 
 		 806 aa  113  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000358831 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1729  alpha-glucosidase  24.59 
 
 		 792 aa  113  7.000000000000001e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0704  Alpha-glucosidase  27.54 
 
 		 770 aa  113  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2868  Alpha-glucosidase  23.86 
 
 		 779 aa  110  6e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1569  glycoside hydrolase family 31  27.49 
 
 		 794 aa  110  6e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1244  alpha-xylosidase YicI  25.45 
 
 		 712 aa  110  8.000000000000001e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.669712  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1017  Alpha-glucosidase  23.01 
 
 		 768 aa  108  2e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0362727  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4430  Alpha-glucosidase  25.48 
 
 		 836 aa  107  6e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.121046  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2605  Alpha-glucosidase  22.28 
 
 		 795 aa  105  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0006  Alpha-glucosidase  26.18 
 
 		 752 aa  104  3e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3837  Alpha-glucosidase  22.91 
 
 		 828 aa  103  6e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.452643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2333  alpha-glucosidase  25.18 
 
 		 746 aa  103  7e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2861  glycoside hydrolase family protein  23.29 
 
 		 695 aa  103  8e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0778  glycoside hydrolase family protein  26.32 
 
 		 799 aa  102  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4135  alpha-xylosidase YicI  24.81 
 
 		 772 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0171  Alpha-glucosidase  25.28 
 
 		 777 aa  102  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1194  glycoside hydrolase family 31  25 
 
 		 804 aa  101  3e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2099  Alpha-glucosidase  23.91 
 
 		 803 aa  101  4e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1660  glycoside hydrolase family protein  27.99 
 
 		 784 aa  101  4e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.624656  hitchhiker  0.00115127 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3956  alpha-xylosidase YicI  23.93 
 
 		 772 aa  100  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01510  alpha-xylosidase YicI  24.35 
 
 		 681 aa  100  8e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1794  Alpha-glucosidase  23.02 
 
 		 687 aa  99.8  9e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.761488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2044  Alpha-glucosidase  23.05 
 
 		 685 aa  99.4  1e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3966  alpha-xylosidase YicI  24.18 
 
 		 772 aa  99.8  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.822563  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4075  alpha-xylosidase YicI  23.93 
 
 		 772 aa  99.8  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.397579  normal  0.758007 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4029  alpha-xylosidase YicI  23.93 
 
 		 772 aa  99.8  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0205936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0609  alpha-xylosidase YicI  24.68 
 
 		 764 aa  97.4  5e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.283089  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0623  alpha-xylosidase YicI  24.68 
 
 		 764 aa  97.1  6e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0387  Alpha-glucosidase  23.44 
 
 		 806 aa  96.3  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.44264 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0156  isoglycosyl hydrolase family protein  25.88 
 
 		 755 aa  95.5  2e-18  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.138592  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0705  glycoside hydrolase family protein  23.51 
 
 		 778 aa  95.5  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.149362  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1683  Alpha-glucosidase  24.87 
 
 		 779 aa  95.9  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4683  alpha-xylosidase YicI  21.98 
 
 		 771 aa  94.7  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00144447  normal  0.975878 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2586  alpha-glucosidase  23.68 
 
 		 738 aa  94.4  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3867  alpha-xylosidase YicI  24.06 
 
 		 772 aa  94  6e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0650  Alpha-glucosidase  22.87 
 
 		 828 aa  93.6  7e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.178818  normal  0.195512 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03514  predicted alpha-glucosidase  24.06 
 
 		 772 aa  93.6  8e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.485788  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3324  Alpha-glucosidase  23.4 
 
 		 825 aa  93.6  8e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000336077 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03466  hypothetical protein  24.06 
 
 		 772 aa  93.6  8e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.498351  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4160  alpha-xylosidase YicI  24.06 
 
 		 772 aa  93.6  8e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0049  glycoside hydrolase family 31  24.06 
 
 		 772 aa  93.2  9e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0055  alpha-xylosidase YicI  24.06 
 
 		 772 aa  93.2  9e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.353636 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3099  Alpha-glucosidase  24.02 
 
 		 797 aa  92.8  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.109594 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19090  Alpha-glucosidase  24.74 
 
 		 801 aa  92.8  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00110521  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2887  alpha-xylosidase YicI  22.14 
 
 		 779 aa  93.2  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3999  alpha-xylosidase YicI  24.06 
 
 		 772 aa  93.2  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1763  alpha-xylosidase YicI  21.17 
 
 		 760 aa  92  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.983763  normal  0.0245324 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0071  alpha-xylosidase YicI  23.77 
 
 		 772 aa  92.4  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.290357  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1323  alpha-xylosidase YicI  23.93 
 
 		 760 aa  92.4  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2986  alpha-xylosidase YicI  23.04 
 
 		 749 aa  92  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391132  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07120  conserved hypothetical protein  24.23 
 
 		 699 aa  91.3  3e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.845548 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00280  glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03140)  23.71 
 
 		 661 aa  91.3  3e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0244988 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10130  family 31 glycosyl hydrolase, alpha-glucosidase  22.76 
 
 		 766 aa  91.3  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0724432  normal  0.362992 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1246  alpha-xylosidase YicI  23.18 
 
 		 774 aa  91.3  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.758952  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0187  alpha-xylosidase YicI  23.53 
 
 		 775 aa  90.5  7e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5029  alpha-xylosidase YicI  23.8 
 
 		 772 aa  90.1  7e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0793  Alpha-glucosidase  23.97 
 
 		 700 aa  90.1  8e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4107  alpha-xylosidase YicI  22.99 
 
 		 763 aa  89  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2338  Alpha-glucosidase  23.37 
 
 		 839 aa  88.6  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.185932  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2545  Alpha-glucosidase  23.41 
 
 		 785 aa  88.2  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000167108  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02870  family 31 glycosyl hydrolase, alpha-glucosidase  23.02 
 
 		 690 aa  87.8  4e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1145  glycoside hydrolase family protein  25.21 
 
 		 739 aa  88.2  4e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0015  Alpha-glucosidase  25.07 
 
 		 816 aa  87.4  6e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0917  Alpha-glucosidase  22.42 
 
 		 683 aa  86.7  8e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0520  alpha-glucosidase  24.54 
 
 		 668 aa  86.3  0.000000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.284712  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3309  Alpha-glucosidase  23.66 
 
 		 821 aa  86.7  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.154266 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0046  glycoside hydrolase, family 31  23.5 
 
 		 679 aa  85.5  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.118014  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0045  glycoside hydrolase, family 31  23.39 
 
 		 679 aa  85.1  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1108  Alpha-glucosidase  22.22 
 
 		 728 aa  84.3  0.000000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.910405  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4927  glycoside hydrolase family 31  21.85 
 
 		 777 aa  84  0.000000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0045  glycoside hydrolase, family 31  23.39 
 
 		 679 aa  83.6  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.229343  normal  0.24021 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0019  glycosy hydrolase family protein  23.32 
 
 		 679 aa  83.6  0.000000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0278482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0046  glycoside hydrolase, family 31  23.26 
 
 		 679 aa  84  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.39622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2746  Alpha-glucosidase  22.55 
 
 		 799 aa  84  0.000000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.441472  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0218  alpha-xylosidase YicI  24.6 
 
 		 780 aa  83.6  0.000000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0044  glycoside hydrolase, family 31  23.39 
 
 		 679 aa  83.6  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.228548  decreased coverage  0.00512205 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2608  glycoside hydrolase family 31  21.35 
 
 		 695 aa  83.2  0.000000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.805177  normal  0.759517 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2057  alpha-xylosidase YicI  22.35 
 
 		 772 aa  83.2  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2455  alpha-xylosidase YicI  22.25 
 
 		 770 aa  82  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.623882  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07505  Alpha-xylosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AW25]  22.19 
 
 		 780 aa  81.6  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.763241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0413  alpha-xylosidase YicI  23.45 
 
 		 763 aa  82  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1611  Alpha-glucosidase  25.06 
 
 		 702 aa  81.3  0.00000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0369575  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0521  Alpha-glucosidase  23.39 
 
 		 779 aa  81.3  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4630  glycoside hydrolase family protein  21.92 
 
 		 744 aa  80.9  0.00000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03670  glycoside hydrolase family 31  23.81 
 
 		 1024 aa  80.1  0.00000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.510709  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>