74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_0064 on replicon NC_008787
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008787  CJJ81176_0064  cytochrome c family protein  100 
 
 
689 aa  1436    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0807  cytochrome c family protein  62.46 
 
 
688 aa  904    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0014  hypothetical protein  58.26 
 
 
670 aa  811    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2603  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like protein  45.83 
 
 
729 aa  488  1e-136  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.18944  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0274  cytochrome c family protein  35.99 
 
 
619 aa  374  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00552346  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0125  hypothetical protein  35.23 
 
 
618 aa  374  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000548778  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2063  hypothetical protein  35.74 
 
 
615 aa  372  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.97808  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0077  hypothetical protein  39.49 
 
 
616 aa  369  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.09082e-34 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0095  hypothetical protein  38.15 
 
 
616 aa  363  8e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000209926  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0100  cytochrome c family protein  36.32 
 
 
618 aa  351  2e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000214934  normal  0.444755 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4073  cytochrome c family protein  35.59 
 
 
662 aa  351  2e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0551  cytochrome c family protein  35.57 
 
 
688 aa  340  5.9999999999999996e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0762772  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1404  cytochrome c family protein  34.88 
 
 
655 aa  323  7e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.352447  normal  0.0404574 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0127  hypothetical protein  28.54 
 
 
566 aa  216  9e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0116  hypothetical protein  28.95 
 
 
566 aa  215  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.7686  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0109  hypothetical protein  28.74 
 
 
571 aa  214  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0113  hypothetical protein  27.9 
 
 
577 aa  207  5e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.020056  normal  0.620455 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2713  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like  26.52 
 
 
658 aa  171  3e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.151641  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0845  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like protein  26.13 
 
 
757 aa  169  1e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.763615  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3925  hypothetical protein  34.87 
 
 
236 aa  149  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2001  deca-heme C-type cytochrome-like  31.22 
 
 
241 aa  123  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1962  deca-heme C-type cytochrome-like protein  31.22 
 
 
241 aa  123  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.282752  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1877  deca-heme C-type cytochrome-like protein  31.22 
 
 
241 aa  123  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.14633  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1806  deca-heme C-type cytochrome-like protein  30.77 
 
 
247 aa  120  9e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.655576  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0480  hypothetical protein  39.44 
 
 
146 aa  99.4  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3541  rhodanese domain-containing protein  45.19 
 
 
147 aa  94.4  6e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4001  rhodanese domain-containing protein  41.26 
 
 
146 aa  94.4  6e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3876  rhodanese domain-containing protein  44.23 
 
 
147 aa  94.4  7e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0489  rhodanese domain-containing protein  45.19 
 
 
147 aa  94  8e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0490  rhodanese domain-containing protein  45.19 
 
 
147 aa  94  9e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3363  rhodanese domain-containing protein  45.19 
 
 
146 aa  93.6  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3926  hypothetical protein  32.49 
 
 
211 aa  93.6  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0349  rhodanese domain-containing protein  47.52 
 
 
141 aa  91.3  6e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1805  cytochrome C family protein  29.96 
 
 
346 aa  91.3  6e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.126894  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1961  cytochrome C family protein  28.57 
 
 
346 aa  84.3  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.613696  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1876  cytochrome C family protein  28.57 
 
 
346 aa  84.3  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2002  cytochrome c family protein  28.57 
 
 
346 aa  84.3  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0494  hypothetical protein  33.8 
 
 
142 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0480  rhodanese domain-containing protein  42.45 
 
 
142 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4455  rhodanese domain-containing protein  34.51 
 
 
143 aa  82  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4476  rhodanese domain-containing protein  41.51 
 
 
142 aa  82  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1338  cytochrome c family protein  57.75 
 
 
75 aa  81.3  0.00000000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.207335  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0483  rhodanese domain-containing protein  39.6 
 
 
151 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0504  rhodanese domain-containing protein  32.39 
 
 
152 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2739  hypothetical protein  25.11 
 
 
471 aa  62.8  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000852444  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2381  hypothetical protein  33.98 
 
 
270 aa  52.4  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.145583  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2839  cytochrome c family protein  25.29 
 
 
289 aa  50.4  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000361793  decreased coverage  9.49573e-22 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0431  flavodoxin domain-containing protein  24.86 
 
 
883 aa  49.3  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3166  cytochrome C family protein  26.63 
 
 
650 aa  48.5  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1648  cytochrome c family protein  30.39 
 
 
270 aa  48.1  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1924  cytochrome c family protein  28.16 
 
 
270 aa  48.1  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00050556  normal  0.656343 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0313  formate-dependent nitrite reductase  29.73 
 
 
154 aa  47.8  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0797  formate dehydrogenase gamma subunit  25.12 
 
 
229 aa  47.4  0.0009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.205396  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2394  formate dehydrogenase, gamma subunit  24.29 
 
 
208 aa  47  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0099056  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3261  cytochrome C family protein  30.1 
 
 
656 aa  47  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1681  formate dehydrogenase, gamma subunit  24.29 
 
 
208 aa  47  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0728  formate dehydrogenase, gamma subunit  24.29 
 
 
208 aa  47  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0679  rhodanese-like protein  33.33 
 
 
363 aa  47  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.117873  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0709  formate dehydrogenase, gamma subunit  24.29 
 
 
208 aa  46.6  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0086  formate dehydrogenase-O subunit gamma  25 
 
 
211 aa  47.4  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2257  formate dehydrogenase, gamma subunit  24.29 
 
 
208 aa  47  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3967  formate-dependent nitrite reductase  28.97 
 
 
156 aa  47.4  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1719  cytochrome c, putative  26.11 
 
 
464 aa  45.8  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.668861  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1901  formate dehydrogenase, gamma subunit  23.73 
 
 
208 aa  45.4  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.335747  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3130  cytochrome C family protein  27.13 
 
 
317 aa  45.4  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.849943  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0573  formate dehydrogenase, gamma subunit  23.73 
 
 
208 aa  45.4  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.15666  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4360  decaheme cytochrome c  27.71 
 
 
304 aa  45.1  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2925  cytochrome c family protein  25.13 
 
 
315 aa  45.1  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2583  cytochrome C family protein  24.86 
 
 
259 aa  45.1  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0433  NHL domain/cytochrome c family protein  26.17 
 
 
930 aa  45.1  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.102411  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1694  formate dehydrogenase, gamma subunit  24 
 
 
208 aa  44.7  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0352  cytochrome c family protein  26.34 
 
 
317 aa  44.3  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.101331 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2335  Rhodanese domain protein  35.16 
 
 
432 aa  44.3  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.120281  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2408  hypothetical protein  26.61 
 
 
225 aa  44.3  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>