More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE1878 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE1878  RNA pseudouridylate synthase family protein  100 
 
 		 253 aa  513  1.0000000000000001e-145  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0266462  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0003  RNA pseudouridine synthase family protein  99.21 
 
 		 253 aa  509  1e-143  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000000522631  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2083  RNA pseudouridine synthase family protein  98.02 
 
 		 253 aa  504  9.999999999999999e-143  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000000447983  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0017  putative ribosomal pseudouridine synthase  87.75 
 
 		 253 aa  460  9.999999999999999e-129  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1885  putative peptide ABC transporter, permease protein  69.17 
 
 		 257 aa  358  4e-98  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0639352  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1113  RNA-uridine isomerase  68.11 
 
 		 257 aa  358  4e-98  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1809  pseudouridine synthase, Rsu:RNA-binding S4:pseudouridine synthase  64.96 
 
 		 254 aa  338  2.9999999999999998e-92  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.137789  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1750  RNA pseudouridine synthase  64.82 
 
 		 253 aa  335  2.9999999999999997e-91  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0065  RNA-binding S4 domain protein  59.27 
 
 		 261 aa  313  1.9999999999999998e-84  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0212  pseudouridine synthase, Rsu  49.19 
 
 		 312 aa  252  4.0000000000000004e-66  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2010  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  36.44 
 
 		 268 aa  150  1e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.154184  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1041  pseudouridine synthase, Rsu  36.05 
 
 		 268 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0593866  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1089  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  34.14 
 
 		 290 aa  145  4.0000000000000006e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.164298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1258  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  37.83 
 
 		 296 aa  142  4e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.919604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1855  pseudouridine synthase, Rsu  35.29 
 
 		 315 aa  135  5e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1470  RNA-binding S4 domain protein  36.13 
 
 		 292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.177762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1228  pseudouridine synthase, Rsu  35.34 
 
 		 317 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000379641  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1793  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  36.13 
 
 		 292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1689  pseudouridine synthase  35.77 
 
 		 379 aa  132  6.999999999999999e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0924391  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5024  pseudouridine synthase  35.09 
 
 		 467 aa  131  9e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.114157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0984  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  32.8 
 
 		 244 aa  130  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1594  hypothetical protein  33.33 
 
 		 248 aa  130  3e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1165  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  35.54 
 
 		 447 aa  130  3e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1096  pseudouridine synthase  33.73 
 
 		 417 aa  129  4.0000000000000003e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1085  pseudouridine synthase  35.53 
 
 		 435 aa  129  4.0000000000000003e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.126004  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1722  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  33.73 
 
 		 398 aa  129  4.0000000000000003e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.950771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0851  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  35.86 
 
 		 286 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000682568  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0877  RNA pseudouridine synthase family protein  32.8 
 
 		 244 aa  129  5.0000000000000004e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2246  pseudouridine synthase  34.5 
 
 		 293 aa  128  7.000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041999 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1691  pseudouridine synthase  32.31 
 
 		 288 aa  128  9.000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.58425  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1402  hypothetical protein  32.93 
 
 		 248 aa  128  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1753  RNA-binding S4 domain protein  34.13 
 
 		 318 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.362888 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2001  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  34.65 
 
 		 686 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.850732  normal  0.19762 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0581  pseudouridine synthase  32.44 
 
 		 278 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.826332  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2824  pseudouridine synthase, Rsu  35.09 
 
 		 289 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.564406  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2455  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  34.66 
 
 		 340 aa  125  4.0000000000000003e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.155456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2312  pseudouridine synthase, Rsu  33.59 
 
 		 466 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.49516  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1648  pseudouridine synthase  33.19 
 
 		 290 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000180778  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0085  pseudouridine synthase  35.53 
 
 		 520 aa  125  5e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.300201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2070  pseudouridine synthase  33.88 
 
 		 271 aa  125  5e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0652133  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1758  pseudouridine synthase  33.47 
 
 		 554 aa  125  6e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.324653  normal  0.0138956 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1525  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  33.19 
 
 		 291 aa  125  6e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00489615 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1629  pseudouridine synthase  32.53 
 
 		 626 aa  125  7e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00621954 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1064  RNA pseudouridylate synthase family protein  33.2 
 
 		 380 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1230  pseudouridine synthase  34.63 
 
 		 587 aa  125  8.000000000000001e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0560095  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2613  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  34.96 
 
 		 544 aa  125  8.000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0609714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3785  RNA-binding S4 domain-containing protein  34.18 
 
 		 354 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000422758 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1419  RNA-binding S4 domain-containing protein  33.2 
 
 		 572 aa  125  9e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0617825 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1473  RNA-binding S4 domain-containing protein  32.93 
 
 		 586 aa  125  9e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.780813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1467  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  32.75 
 
 		 291 aa  125  9e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.807732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1533  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  32.75 
 
 		 291 aa  125  9e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000439021  normal  0.0168974 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1395  pseudouridine synthase  34.29 
 
 		 242 aa  125  9e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02283  pseudouridine synthase (makes pseudouridine2605 in 23 S RNA)  32.02 
 
 		 298 aa  125  9e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.268189  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0178  RNA pseudouridine synthase family protein  33.2 
 
 		 554 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00491144  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1912  RNA pseudouridylate synthase family protein  33.2 
 
 		 513 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.402665  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2907  pseudouridine synthase  33.62 
 
 		 287 aa  124  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.191084  normal  0.0790045 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2567  RNA pseudouridylate synthase family protein  33.2 
 
 		 502 aa  124  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00446007  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1510  RNA pseudouridine synthase family protein  33.2 
 
 		 554 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1416  RNA-binding S4 domain-containing protein  34.18 
 
 		 355 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.504489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0988  RNA pseudouridine synthase family protein  33.2 
 
 		 554 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1016  pseudouridine synthase, Rsu  32.93 
 
 		 586 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.718536  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4002  RNA-binding S4 domain-containing protein  34.18 
 
 		 355 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000006993 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1379  pseudouridine synthase, Rsu  33.2 
 
 		 572 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1497  pseudouridine synthase, Rsu  32.93 
 
 		 586 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003093  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  33.63 
 
 		 312 aa  124  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00130129  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02753  16S rRNA uridine-516 pseudouridylate synthase  34.78 
 
 		 312 aa  124  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1593  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  33.6 
 
 		 240 aa  124  2e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2696  pseudouridine synthase  31.44 
 
 		 291 aa  123  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.764496  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4638  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  32.93 
 
 		 588 aa  124  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.386925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0800  pseudouridine synthase family 1 protein  34.51 
 
 		 321 aa  124  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1759  RNA pseudouridine synthase family protein  33.2 
 
 		 554 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.282053  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2796  RNA-binding S4 domain-containing protein  31.44 
 
 		 291 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.479983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2717  pseudouridine synthase  31.44 
 
 		 291 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.374808  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1737  RNA pseudouridine synthase family protein  33.2 
 
 		 554 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0207122  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1669  RNA-binding S4 domain protein  31.44 
 
 		 291 aa  123  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00289659  hitchhiker  0.000456402 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1382  RNA pseudouridine  33.88 
 
 		 242 aa  123  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.947274  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1355  pseudouridylate synthase  33.88 
 
 		 242 aa  123  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1565  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  33.88 
 
 		 242 aa  123  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.37262e-16 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2398  pseudouridine synthase  31.44 
 
 		 291 aa  123  3e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0731299  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1493  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  33.88 
 
 		 242 aa  123  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2436  pseudouridine synthase, Rsu  31.88 
 
 		 290 aa  123  3e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1527  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  33.88 
 
 		 242 aa  123  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0693  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  36.03 
 
 		 239 aa  123  3e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1419  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  33.47 
 
 		 483 aa  122  4e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.829241  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1597  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  33.88 
 
 		 242 aa  123  4e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1354  pseudouridylate synthase  33.88 
 
 		 242 aa  123  4e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1301  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  30.77 
 
 		 236 aa  122  4e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1867  pseudouridine synthase  35.53 
 
 		 527 aa  122  4e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.919575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1633  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  33.88 
 
 		 242 aa  123  4e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2691  RNA-binding S4 domain protein  30.89 
 
 		 549 aa  122  5e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2550  pseudouridine synthase, Rsu  34.05 
 
 		 680 aa  122  5e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0219746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1217  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  33.6 
 
 		 258 aa  122  5e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000897909  hitchhiker  0.000000206079 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1841  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  33.2 
 
 		 385 aa  122  5e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3394  RNA-binding S4 domain-containing protein  32.92 
 
 		 300 aa  122  5e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000468714  normal  0.359184 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23110  hypothetical protein  33.76 
 
 		 386 aa  122  5e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000760883 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2823  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  32.13 
 
 		 633 aa  122  6e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2728  pseudouridine synthase  31.84 
 
 		 274 aa  121  9e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3519  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  30.13 
 
 		 355 aa  121  9e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3818  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  33.88 
 
 		 242 aa  121  9e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000641699 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2031  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  33.06 
 
 		 615 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>