More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3131 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1305  glycosyl transferase family 51  47.87 
 
 		 767 aa  692    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.551332 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4764  glycosyl transferase family 51  45.93 
 
 		 850 aa  697    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193555  normal  0.0626376 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3074  glycosyl transferase family 51  47.71 
 
 		 854 aa  690    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.846458 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1915  glycosyl transferase family 51  46.12 
 
 		 815 aa  712    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.70734 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5029  glycosyl transferase family 51  49.58 
 
 		 765 aa  718    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0981  hypothetical protein  49.33 
 
 		 786 aa  770    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.250374 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3220  glycosyl transferase family 51  44.26 
 
 		 785 aa  683    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259437  normal  0.206704 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0176  glycosyltransferase  55.69 
 
 		 762 aa  851    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.368405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3131  glycosyltransferase  100 
 
 		 759 aa  1578    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.47312  normal  0.698693 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0388  glycosyl transferase family 51  46.05 
 
 		 740 aa  626  1e-178  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1888  glycosyltransferase  43.86 
 
 		 743 aa  619  1e-176  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0246487 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0889  glycosyl transferase family protein  42.67 
 
 		 768 aa  618  1e-175  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1474  glycosyl transferase family 51  43.37 
 
 		 772 aa  603  1.0000000000000001e-171  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0249209  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03455  penicillin-binding protein 1A  41.57 
 
 		 773 aa  601  1e-170  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6609  glycosyl transferase family 51  41.5 
 
 		 794 aa  552  1e-156  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.911258  normal  0.0344936 
 
 
-
 
NC_002950  PG0794  penicillin-binding protein 1A, putative  39.66 
 
 		 786 aa  501  1e-140  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1252  glycosyltransferase  38.84 
 
 		 776 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.314687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0316  penicillin-binding protein, 1A family  39.27 
 
 		 750 aa  456  1e-127  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.223118 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0343  penicillin-binding protein, 1A family  37.82 
 
 		 774 aa  456  1e-127  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.314658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0274  penicillin-binding protein, 1A family  37.91 
 
 		 783 aa  455  1.0000000000000001e-126  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0242  penicillin-binding protein, 1A family  37.54 
 
 		 730 aa  442  9.999999999999999e-123  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000113999  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1945  penicillin-binding protein 1A  37.72 
 
 		 752 aa  434  1e-120  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.419198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0887  peptidoglycan glycosyltransferase  36.74 
 
 		 841 aa  433  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.24195 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1120  glycosyl transferase family 51  36.22 
 
 		 907 aa  435  1e-120  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2643  penicillin-binding protein, 1A family  38.25 
 
 		 755 aa  424  1e-117  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0301  1A family penicillin-binding protein  37.11 
 
 		 760 aa  425  1e-117  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4835  peptidoglycan glycosyl transferase  35.96 
 
 		 826 aa  421  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.191037  normal  0.0433282 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0590  penicillin-binding protein 1A  37.14 
 
 		 762 aa  414  1e-114  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2061  glycosyl transferase family protein  35.53 
 
 		 810 aa  414  1e-114  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2197  putative penicillin-binding 1 (peptidoglycansynthetase) transmembrane protein, MrcA  34.85 
 
 		 838 aa  411  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.633683  decreased coverage  0.00350534 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2329  glycosyl transferase family protein  35.76 
 
 		 801 aa  406  1.0000000000000001e-112  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.212398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3899  peptidoglycan glycosyltransferase  34.14 
 
 		 821 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2013  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.96 
 
 		 834 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.155902 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4875  peptidoglycan glycosyltransferase  34.15 
 
 		 850 aa  403  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0392  peptidoglycan glycosyltransferase  34.91 
 
 		 742 aa  402  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.431383 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1659  peptidoglycan glycosyltransferase  34.54 
 
 		 862 aa  403  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0514214  normal  0.169753 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5993  peptidoglycan glycosyltransferase  34.78 
 
 		 858 aa  405  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5259  peptidoglycan glycosyltransferase  35.21 
 
 		 743 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.297119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5014  peptidoglycan glycosyltransferase  35.06 
 
 		 743 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0205014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4244  peptidoglycan glycosyltransferase  34.75 
 
 		 857 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0164258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3108  peptidoglycan glycosyltransferase  35.21 
 
 		 743 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3770  peptidoglycan glycosyltransferase  34.51 
 
 		 870 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345724  normal  0.277872 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2324  1A family penicillin-binding protein  35.65 
 
 		 787 aa  399  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4006  peptidoglycan glycosyltransferase  35.15 
 
 		 857 aa  399  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237546  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4361  peptidoglycan glycosyltransferase  35.15 
 
 		 857 aa  399  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.885871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4259  peptidoglycan glycosyltransferase  34.9 
 
 		 888 aa  393  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.990931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2469  glycosyl transferase family protein  33.91 
 
 		 846 aa  394  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0192266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3455  peptidoglycan glycosyltransferase  33.53 
 
 		 787 aa  389  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.19889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3229  membrane carboxypeptidase/penicillin-binding protein  34.9 
 
 		 844 aa  386  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.258839  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2055  1A family penicillin-binding protein  34.9 
 
 		 839 aa  386  1e-106  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.635838  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1451  penicillin-binding protein  34.9 
 
 		 928 aa  386  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.49387  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3113  penicillin-binding protein  34.9 
 
 		 839 aa  386  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.988566  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2081  glycosyl transferase family protein  34.45 
 
 		 846 aa  387  1e-106  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.45351  normal  0.431878 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1080  penicillin-binding protein  34.9 
 
 		 844 aa  387  1e-106  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.366397  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1363  penicillin-binding protein  34.9 
 
 		 844 aa  387  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1674  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.45 
 
 		 846 aa  389  1e-106  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.339847  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2346  penicillin-binding protein  34.9 
 
 		 844 aa  387  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4618  glycosyl transferase family protein  33.58 
 
 		 728 aa  381  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5146  peptidoglycan glycosyltransferase  33.88 
 
 		 732 aa  379  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.725403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1773  glycosyl transferase family penicillin-binding protein transpeptidase  32.5 
 
 		 698 aa  361  3e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.488731  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2065  glycosyl transferase family protein  32.25 
 
 		 686 aa  344  2.9999999999999997e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.56119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4231  penicillin-binding protein 1A  30.4 
 
 		 748 aa  326  8.000000000000001e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0754  penicillin-binding protein, 1A family  32.28 
 
 		 796 aa  319  1e-85  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1298  1A family penicillin-binding protein  29.73 
 
 		 833 aa  318  3e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.144183  normal  0.788784 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2084  peptidoglycan glycosyltransferase  32.51 
 
 		 675 aa  316  9.999999999999999e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4058  glycosyl transferase family protein  31.37 
 
 		 678 aa  314  3.9999999999999997e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2676  1A family penicillin-binding protein  29.59 
 
 		 795 aa  310  5e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.21019 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0324  penicillin-binding protein, 1A family  28.31 
 
 		 802 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4406  1A family penicillin-binding protein  28.84 
 
 		 818 aa  308  3e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000928316  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0354  penicillin-binding protein 1A  28.59 
 
 		 841 aa  303  1e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.75585  normal  0.103015 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0324  penicillin-binding protein 1A  28.93 
 
 		 830 aa  295  2e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0232  1A family penicillin-binding protein  29.04 
 
 		 849 aa  294  4e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.748115  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4359  1A family penicillin-binding protein  31.03 
 
 		 810 aa  294  4e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4090  1A family penicillin-binding protein  29.84 
 
 		 844 aa  294  4e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5843  1A family penicillin-binding protein  30.41 
 
 		 808 aa  294  4e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.36925  normal  0.15552 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2078  penicillin-binding protein 1A  27.26 
 
 		 777 aa  293  6e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4119  1A family penicillin-binding protein  29.71 
 
 		 844 aa  292  1e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.922666  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4009  penicillin-binding protein, 1A family  29.71 
 
 		 844 aa  292  1e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0189  penicillin-binding protein, 1A family  28.07 
 
 		 827 aa  292  2e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4208  1A family penicillin-binding protein  29.9 
 
 		 822 aa  292  2e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0280  penicillin-binding protein 1A  29.01 
 
 		 839 aa  290  6e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0010  peptidoglycan synthetase; penicillin-binding protein 1A  29.13 
 
 		 797 aa  290  6e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.00000000000000754529  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1824  penicillin-binding protein 1A  29 
 
 		 843 aa  290  6e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0792156  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0171  penicillin-binding protein, 1A family  28.12 
 
 		 829 aa  290  9e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000166752 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0698  penicillin-binding protein, 1A family  28.38 
 
 		 779 aa  289  1e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2212  penicillin-binding protein 1A  28.35 
 
 		 835 aa  289  1e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3274  penicillin-binding protein 1A  28.69 
 
 		 792 aa  289  1e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3712  1A family penicillin-binding protein  29.1 
 
 		 839 aa  288  2e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.637834  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0729  1A family penicillin-binding protein  28.48 
 
 		 794 aa  288  2.9999999999999996e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.239456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1936  penicillin-binding protein, 1A family  28.28 
 
 		 790 aa  287  5.999999999999999e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3408  1A family penicillin-binding protein  28.81 
 
 		 766 aa  286  1.0000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000649652 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0163  1A family penicillin-binding protein  29 
 
 		 713 aa  286  1.0000000000000001e-75  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6049  penicillin-binding protein, 1A family  30.27 
 
 		 805 aa  286  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141532  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3704  1A family penicillin-binding protein  28.75 
 
 		 839 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.2288  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1716  penicillin-binding protein 1A  29.36 
 
 		 831 aa  285  2.0000000000000002e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0706575  normal  0.372111 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0241  1A family penicillin-binding protein  28.75 
 
 		 839 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002321  multimodular transpeptidase-transglycosylase  28.61 
 
 		 825 aa  285  3.0000000000000004e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000241558  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3374  penicillin-binding protein 1A  27.38 
 
 		 846 aa  285  3.0000000000000004e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3900  1A family penicillin-binding protein  28.63 
 
 		 839 aa  285  3.0000000000000004e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.247667  normal  0.227457 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2321  1A family penicillin-binding protein  26.98 
 
 		 862 aa  284  4.0000000000000003e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.10527  normal  0.723891 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>