More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0080 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0080  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 324 aa  675    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.49427  normal  0.135541 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6413  glycosyl transferase family 9  56.91 
 
 		 329 aa  377  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2622  glycosyl transferase family 9  55.31 
 
 		 327 aa  368  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.980475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2827  glycosyl transferase family 9  50 
 
 		 332 aa  334  1e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0112  heptosyltransferase  34.14 
 
 		 335 aa  192  1e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0106  glycosyl transferase family 9  34.66 
 
 		 332 aa  191  1e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00331411  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0156  glycosyl transferase family 9  33.44 
 
 		 334 aa  184  2.0000000000000003e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0639777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2514  glycosyl transferase family protein  32.5 
 
 		 333 aa  183  3e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.566705  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0145  glycosyl transferase family 9  33.44 
 
 		 334 aa  182  8.000000000000001e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0787699  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0160  glycosyl transferase family 9  32.29 
 
 		 345 aa  177  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.081148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0093  heptosyltransferase  34.16 
 
 		 335 aa  173  3.9999999999999995e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.283951  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3089  glycosyl transferase family 9  30.12 
 
 		 330 aa  149  8e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0389  glycosyl transferase family 9  31.07 
 
 		 330 aa  143  5e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0552  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  30.45 
 
 		 516 aa  125  1e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3090  glycosyl transferase family 9  28.31 
 
 		 344 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18880  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  26.69 
 
 		 348 aa  116  5e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0347069  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1515  glycosyl transferase family 9  26.96 
 
 		 315 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2822  glycosyl transferase family 9  28.44 
 
 		 357 aa  115  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0668  glycosyl transferase family 9  28.62 
 
 		 304 aa  114  3e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000239845  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3391  glycosyl transferase family protein  25.14 
 
 		 409 aa  108  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0510  glycosyl transferase family 9  29.03 
 
 		 345 aa  106  5e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1482  heptosyltransferase family protein  21.71 
 
 		 344 aa  105  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000479014  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18890  Three-deoxy-D-manno-octulosonic-acid transferase domain protein  25.45 
 
 		 779 aa  104  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000185158  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17200  glycosyl transferase family 9  28.8 
 
 		 360 aa  103  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0860  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.3 
 
 		 339 aa  102  7e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0849  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.01 
 
 		 360 aa  102  8e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.539129  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3077  glycosyl transferase family 9  23.94 
 
 		 355 aa  100  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212218 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3479  glycosyl transferase family 9  22.67 
 
 		 342 aa  99.4  8e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1683  heptosyltransferase family protein  22.42 
 
 		 339 aa  99  9e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.943397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2700  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.32 
 
 		 332 aa  97.8  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.257964  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2795  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.32 
 
 		 332 aa  97.8  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2614  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.18 
 
 		 332 aa  97.4  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.82358  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0375  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  25.3 
 
 		 362 aa  97.4  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3411  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  23.31 
 
 		 368 aa  95.9  8e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1403  putative heptosyltransferase III waaq  27.33 
 
 		 356 aa  95.5  9e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.308915  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1939  glycosyl transferase family protein  22.46 
 
 		 344 aa  95.1  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.21219 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1722  glycosyl transferase family 9  23.05 
 
 		 350 aa  94.4  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1231  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  25.21 
 
 		 356 aa  92  1e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1155  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase, putative  27.99 
 
 		 296 aa  89  9e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0565  ADP-heptose--lipopolysaccharide heptosyltransferase II protein  25.15 
 
 		 341 aa  87.8  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.995222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0372  glycosyl transferase family protein  25 
 
 		 369 aa  86.7  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0069  glycosyl transferase family 9  23.97 
 
 		 345 aa  86.3  7e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.960845  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0772  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  21.34 
 
 		 359 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0377  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  22.32 
 
 		 352 aa  84.3  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.644029 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1964  glycosyl transferase family 9  22.38 
 
 		 354 aa  83.2  0.000000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0172789  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0229  glycosyl transferase family 9  21.64 
 
 		 348 aa  82.8  0.000000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2713  lipopolysaccharide heptosyltransferase-1, putative  24.63 
 
 		 349 aa  82.4  0.000000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0473  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  24.14 
 
 		 356 aa  82.4  0.000000000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.189899  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1046  glycosyl transferase family protein  25.17 
 
 		 335 aa  82  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2581  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.38 
 
 		 332 aa  82  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0315509  normal  0.0579279 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3406  glycosyl transferase family 9  25 
 
 		 337 aa  82  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1535  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  23.7 
 
 		 346 aa  80.5  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0486  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.4 
 
 		 341 aa  80.5  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.109958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1552  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  21.28 
 
 		 353 aa  80.1  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0473  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.1 
 
 		 341 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.84327 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0171  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  26.09 
 
 		 322 aa  79  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.425143  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3949  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  22.49 
 
 		 361 aa  79  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3226  glycosyl transferase family protein  23.06 
 
 		 364 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3215  glycosyl transferase family protein  23.17 
 
 		 347 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4861  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  24.52 
 
 		 352 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.36371 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0170  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  23.64 
 
 		 361 aa  79  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.792363  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0370  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  25.16 
 
 		 352 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.381359 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2345  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  23.85 
 
 		 359 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0579  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  23.08 
 
 		 347 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0417722 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3033  glycosyl transferase family protein  25.23 
 
 		 348 aa  78.2  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3136  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.17 
 
 		 344 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2616  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  22.22 
 
 		 346 aa  77.8  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0161  ADP-heptose-LPS heptosyltransferase II  23.74 
 
 		 356 aa  77.8  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0262  ADP-heptose-LPS heptosyltransferase II  23.74 
 
 		 356 aa  77.8  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1820  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.02 
 
 		 343 aa  77.4  0.0000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0465  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  23.91 
 
 		 344 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0977  glycosyl transferase family 9  23.1 
 
 		 336 aa  77  0.0000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.412214  hitchhiker  0.000380468 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4090  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  25.42 
 
 		 320 aa  76.6  0.0000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0589  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  21.91 
 
 		 326 aa  76.6  0.0000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.253987  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4386  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  21.59 
 
 		 415 aa  76.3  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001794  ADP-heptose--lipooligosaccharide heptosyltransferase II  23.28 
 
 		 352 aa  76.3  0.0000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.578647  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0114  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  23.72 
 
 		 367 aa  75.9  0.0000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0576  heptosyltransferase  22.09 
 
 		 418 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0342  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  24.84 
 
 		 352 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.826178 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0669  heptosyltransferase  22.09 
 
 		 418 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.822838  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0367  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  24.84 
 
 		 352 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1067  glycosyl transferase family 9  23.26 
 
 		 316 aa  75.5  0.000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000716573  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4830  glycosyl transferase family protein  23.67 
 
 		 363 aa  74.7  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.244067  hitchhiker  0.0000484932 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1275  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  25.66 
 
 		 342 aa  74.7  0.000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.336205  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2415  glycosyl transferase family 9  26.42 
 
 		 326 aa  75.1  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0888849  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1967  putative heptosyltransferase (O-antigen related)  22.09 
 
 		 418 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.422645  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0626  glycosyl transferase family protein  25.61 
 
 		 340 aa  75.1  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0429094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2100  glycosyl transferase family protein  24.93 
 
 		 361 aa  75.1  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0393  glycosyl transferase family protein  26.8 
 
 		 385 aa  74.3  0.000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.326109  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0149  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.75 
 
 		 341 aa  73.9  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00680  ADP-heptose-LPS heptosyltransferase II  24.63 
 
 		 352 aa  74.3  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0578  glycosyl transferase family protein  22.94 
 
 		 302 aa  73.9  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2105  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase  24.21 
 
 		 351 aa  73.9  0.000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00459  lipopolysaccharide heptosyltransferase-1, putative  24.64 
 
 		 359 aa  73.6  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1433  heptosyltransferase family protein  23.24 
 
 		 372 aa  73.6  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.561852  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0828  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  22.49 
 
 		 346 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03000  heptosyltransferase  23.72 
 
 		 331 aa  73.9  0.000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0265488  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0149  glycosyl transferase family 9  25.68 
 
 		 352 aa  73.6  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0081  heptosyltransferase family protein  24.21 
 
 		 351 aa  73.6  0.000000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0197496  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0491  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.64 
 
 		 354 aa  73.2  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.287096 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>