More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0364 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0364  3-dehydroquinate dehydratase  100 
 
 
159 aa  322  1e-87  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0718569  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0370  3-dehydroquinate dehydratase  90.45 
 
 
159 aa  301  2.0000000000000002e-81  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00140278  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1505  3-dehydroquinate dehydratase  79.11 
 
 
159 aa  269  1e-71  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1211  3-dehydroquinate dehydratase, type II  76 
 
 
155 aa  245  1e-64  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0063  3-dehydroquinate dehydratase  71.9 
 
 
159 aa  245  2e-64  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0104  3-dehydroquinate dehydratase  71.9 
 
 
159 aa  245  2e-64  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0076  3-dehydroquinate dehydratase  71.24 
 
 
159 aa  244  4.9999999999999997e-64  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0290  3-dehydroquinate dehydratase, type II  73.83 
 
 
160 aa  239  7.999999999999999e-63  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.347415  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0230  3-dehydroquinate dehydratase  71.03 
 
 
160 aa  231  3e-60  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0687  3-dehydroquinate dehydratase  67.74 
 
 
160 aa  229  2e-59  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.715219  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0981  3-dehydroquinate dehydratase  56.16 
 
 
150 aa  184  5e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00261283  normal  0.0932644 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1823  3-dehydroquinate dehydratase  56.16 
 
 
144 aa  179  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000527848  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2022  3-dehydroquinate dehydratase  55.48 
 
 
150 aa  175  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1595  3-dehydroquinate dehydratase, type II  52.74 
 
 
144 aa  173  7e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0849  3-dehydroquinate dehydratase  57.14 
 
 
142 aa  169  1e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00904578  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1050  3-dehydroquinate dehydratase  53.19 
 
 
147 aa  168  3e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000995076  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1721  3-dehydroquinate dehydratase  49.66 
 
 
145 aa  167  4e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1474  3-dehydroquinate dehydratase, type II  52.03 
 
 
152 aa  167  5e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00136549  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0211  3-dehydroquinate dehydratase  53.57 
 
 
149 aa  163  6.9999999999999995e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.324309  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04381  3-dehydroquinate dehydratase  48.28 
 
 
145 aa  163  9e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0561971  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1003  3-dehydroquinate dehydratase  46.67 
 
 
150 aa  162  2.0000000000000002e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2300  3-dehydroquinate dehydratase  48.98 
 
 
148 aa  160  6e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.562117  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2893  3-dehydroquinate dehydratase  53.24 
 
 
146 aa  160  7e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0307948  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1559  3-dehydroquinate dehydratase  51.11 
 
 
149 aa  160  8.000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.897026  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0231  3-dehydroquinate dehydratase  52.14 
 
 
149 aa  160  8.000000000000001e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.447722  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2228  3-dehydroquinate dehydratase, type II  53.57 
 
 
149 aa  159  2e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4272  3-dehydroquinate dehydratase  52.52 
 
 
146 aa  158  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2657  3-dehydroquinate dehydratase  51.11 
 
 
149 aa  158  3e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000254633 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4329  3-dehydroquinate dehydratase  52.52 
 
 
146 aa  158  3e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0570  3-dehydroquinate dehydratase  48.67 
 
 
150 aa  158  3e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1698  3-dehydroquinate dehydratase, type II  53.15 
 
 
145 aa  158  3e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03030  3-dehydroquinate dehydratase  47.89 
 
 
148 aa  158  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.343672  hitchhiker  0.0000797805 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4103  3-dehydroquinate dehydratase  52.52 
 
 
146 aa  157  4e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.478145  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3941  3-dehydroquinate dehydratase  52.52 
 
 
146 aa  157  4e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3952  3-dehydroquinate dehydratase  52.52 
 
 
146 aa  157  4e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.405359  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4423  3-dehydroquinate dehydratase  52.52 
 
 
146 aa  157  4e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1924  3-dehydroquinate dehydratase  52.99 
 
 
142 aa  157  4e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.132739  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0330  3-dehydroquinate dehydratase  49.3 
 
 
148 aa  157  4e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.7522  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4219  3-dehydroquinate dehydratase  52.52 
 
 
146 aa  157  4e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0337  3-dehydroquinate dehydratase  51.08 
 
 
146 aa  157  5e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06130  3-dehydroquinate dehydratase, type II  51.05 
 
 
148 aa  156  8e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1540  3-dehydroquinate dehydratase  48.94 
 
 
156 aa  156  1e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0606879 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4052  3-dehydroquinate dehydratase  51.08 
 
 
146 aa  156  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2695  3-dehydroquinate dehydratase, type II  51.47 
 
 
145 aa  155  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.800528 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0925  3-dehydroquinate dehydratase  52.52 
 
 
146 aa  155  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0544  3-dehydroquinate dehydratase  50.7 
 
 
152 aa  155  2e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4964  3-dehydroquinate dehydratase  49.32 
 
 
151 aa  155  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0222066 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0715  3-dehydroquinate dehydratase  52.17 
 
 
153 aa  155  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0744  3-dehydroquinate dehydratase  52.17 
 
 
153 aa  155  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00682582  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3469  3-dehydroquinate dehydratase, type II  48.05 
 
 
152 aa  155  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.411498 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3063  3-dehydroquinate dehydratase  49.32 
 
 
151 aa  155  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.816098  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5304  3-dehydroquinate dehydratase  49.32 
 
 
151 aa  155  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0349681 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1913  3-dehydroquinate dehydratase  48.65 
 
 
152 aa  154  4e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.643127  normal  0.307548 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3205  3-dehydroquinate dehydratase  53.62 
 
 
148 aa  154  4e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0087334 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4665  3-dehydroquinate dehydratase  47.95 
 
 
151 aa  154  4e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.560222  normal  0.542393 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2754  3-dehydroquinate dehydratase  52.99 
 
 
151 aa  154  5.0000000000000005e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1456  3-dehydroquinate dehydratase  50.69 
 
 
145 aa  154  6e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.903143  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1538  3-dehydroquinate dehydratase  52.52 
 
 
145 aa  154  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21280  3-dehydroquinate dehydratase  53.33 
 
 
150 aa  154  7e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.775201  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4309  3-dehydroquinate dehydratase  51.8 
 
 
146 aa  153  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1732  3-dehydroquinate dehydratase  51.8 
 
 
145 aa  153  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676815  normal  0.0717581 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2690  3-dehydroquinate dehydratase  47.44 
 
 
150 aa  153  1e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000775969  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3419  3-dehydroquinate dehydratase  48.63 
 
 
151 aa  153  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0105986  normal  0.197082 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5193  3-dehydroquinate dehydratase  47.26 
 
 
151 aa  152  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0883  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 
160 aa  152  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.893545  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0668  3-dehydroquinate dehydratase  49.67 
 
 
156 aa  152  2e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0948  3-dehydroquinate dehydratase  51.8 
 
 
153 aa  152  2.9999999999999998e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00455713  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0344  3-dehydroquinate dehydratase  46.58 
 
 
151 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960001  normal  0.658958 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0662  3-dehydroquinate dehydratase  49.63 
 
 
147 aa  151  2.9999999999999998e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0915  3-dehydroquinate dehydratase  46.62 
 
 
149 aa  152  2.9999999999999998e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.249833  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3063  3-dehydroquinate dehydratase  53.33 
 
 
162 aa  151  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2041  3-dehydroquinate dehydratase  47.97 
 
 
149 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.775923 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1551  3-dehydroquinate dehydratase  48.2 
 
 
150 aa  151  2.9999999999999998e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.961806  normal  0.25542 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2377  3-dehydroquinate dehydratase  52.82 
 
 
149 aa  151  4e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4568  3-dehydroquinate dehydratase  46.85 
 
 
151 aa  151  4e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2094  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50 
 
 
142 aa  150  5e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.641417  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2531  3-dehydroquinate dehydratase  54.41 
 
 
145 aa  150  5e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4097  3-dehydroquinate dehydratase, type II  47.37 
 
 
165 aa  150  5e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.517045  normal  0.0424658 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0695  3-dehydroquinate dehydratase  53.68 
 
 
144 aa  150  5e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0103169  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03924  3-dehydroquinate dehydratase (3-dehydroquinase) (Type II DHQase)  45.21 
 
 
146 aa  150  5.9999999999999996e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.252405  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0695  3-dehydroquinate dehydratase  53.68 
 
 
146 aa  150  5.9999999999999996e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.114768  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11973  3-dehydroquinate dehydratase  49.65 
 
 
144 aa  150  7e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0032  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 
149 aa  150  8e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0255  3-dehydroquinate dehydratase, type II  51.08 
 
 
184 aa  150  8e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2407  3-dehydroquinate dehydratase  48.28 
 
 
149 aa  150  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0668809  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1789  3-dehydroquinate dehydratase  52.99 
 
 
145 aa  150  8.999999999999999e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0571  3-dehydroquinate dehydratase  51.11 
 
 
144 aa  149  1e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000293441  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2190  3-dehydroquinate dehydratase, type II  46.94 
 
 
150 aa  149  1e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.369696  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2345  3-dehydroquinate dehydratase, type II  48.92 
 
 
137 aa  149  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.660798  normal  0.653044 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0586  3-dehydroquinate dehydratase  51.11 
 
 
144 aa  149  1e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3288  3-dehydroquinate dehydratase  47.97 
 
 
152 aa  149  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.796587 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3692  3-dehydroquinate dehydratase  48.92 
 
 
150 aa  149  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.526895  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04381  3-dehydroquinate dehydratase  49.64 
 
 
147 aa  149  2e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3290  3-dehydroquinate dehydratase  50.38 
 
 
152 aa  149  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.267239  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0954  3-dehydroquinate dehydratase  51.39 
 
 
148 aa  149  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0330586 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2785  3-dehydroquinate dehydratase  52.59 
 
 
156 aa  148  4e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.995047 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04491  3-dehydroquinate dehydratase  46.58 
 
 
146 aa  148  4e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.609687  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38070  3-dehydroquinate dehydratase  48.61 
 
 
147 aa  147  5e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.633165  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3731  3-dehydroquinate dehydratase  48.32 
 
 
157 aa  147  6e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.318206  hitchhiker  0.00144149 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04071  3-dehydroquinate dehydratase  49.64 
 
 
147 aa  147  6e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>